これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windowsオンラインエミュレータ、MAC OSオンラインエミュレータなど、複数の無料オンラインワークステーションのいずれかを使用して、OnWorks無料ホスティングプロバイダーで実行できるコマンドdistmateです。
プログラム：
NAME
distmat - 多重配列アライメントから距離行列を作成する
SYNOPSIS
ディスマット -シーケンス シーケンスセット -nucメソッド リスト -protメソッド リスト -曖昧 boolean
-ギャップウェイト フロート -ポジション 整数 -計算する boolean -パラメータa フロート
-outfile アウトファイル
ディスマット -助けて
DESCRIPTION
ディスマット EMBOSS（「EuropeanMolecular BiologyOpen」のコマンドラインプログラムです。
ソフトウェアスイート」）。 これは、「系統発生:分子配列」コマンド グループの一部です。
OPTIONS
入力
-シーケンス シーケンスセット
配列アラインメントを含むファイル。
必須
-nucメソッド リスト
ヌクレオチドの多重置換修正法。
-protメソッド リスト
タンパク質に対する多重置換補正法。
NEW
-曖昧 boolean
ジュークス・カントール法の計算で曖昧なコードを使用するオプション、または
配列はタンパク質です。デフォルト値: N
-ギャップウェイト フロート
補正されていない（ヌクレオチド）距離とJukes-Cantor距離のギャップに重み付けするオプション
メソッド。デフォルト値: 0。
-ポジション 整数
各コドンで分析する塩基位置を選択します。例えば、123（すべての塩基）、12（最初のXNUMX塩基）
塩基）、1、2、または3つの個別塩基。デフォルト値：123
-計算する boolean
これにより、ジンネイガンマ距離のパラメータ「a」の計算が強制されます。
計算しない場合はデフォルトは1.0です（-parameteraオプションを参照）。デフォルト値：N
-パラメータa フロート
Jin-Neiガンマ距離計算で使用するユーザー定義パラメータ「a」。
推奨値は1.0（Jin et al.）で、これがデフォルトです。デフォルト値：
1.0
出力
-outfile アウトファイル
onworks.net サービスを使用して distmate をオンラインで使用
