これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、MAC OS オンライン エミュレーターなど、複数の無料オンライン ワークステーションのいずれかを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド fdnaparse です。
プログラム:
NAME
fdnapars - DNA 節約アルゴリズム
SYNOPSIS
fdnapars -シーケンス シークセットオール -インツリーファイル ツリー [-重み プロパティ] [-maxtrees 整数]
-徹底的に トグル -並べ替える ブール値 [-転換 ブール値] -ごちゃまぜ 整数
-シード 整数 [-アウトグルノ 整数] [-脱穀 トグル] -しきい値 フロート
-outfile アウトファイル [-マス トグル] -アウトツリーファイル アウトファイル [-印刷データ ブール値]
[-進捗 ブール値] [-ステップボックス ブール値] [-ancseq ブール値] [-ツリープリント ブール値]
-dotdiff ブール値
fdnapars -助けて
DESCRIPTION
fdnapars EMBOSS(「EuropeanMolecular BiologyOpen」のコマンドラインプログラムです。
ソフトウェアスイート」)。 これは、「系統発生:分子配列」コマンド グループの一部です。
OPTIONS
入力
-シーケンス シークセットオール
XNUMX つ以上の配列アライメントを含むファイル
-インツリーファイル ツリー
-重み プロパティ
NEW
-maxtrees 整数
デフォルト値:10000
-徹底的に トグル
デフォルト値:Y
-並べ替える ブール値
デフォルト値:Y
-転換 ブール値
デフォルト値:N
-ごちゃまぜ 整数
-シード 整数
デフォルト値:1
-アウトグルノ 整数
-脱穀 トグル
デフォルト値:N
-しきい値 フロート
デフォルト値:1.0
出力
-outfile アウトファイル
-マス トグル
デフォルト値:Y
-アウトツリーファイル アウトファイル
-印刷データ ブール値
デフォルト値:N
-進捗 ブール値
デフォルト値:Y
-ステップボックス ブール値
デフォルト値:N
-ancseq ブール値
デフォルト値:N
-ツリープリント ブール値
デフォルト値:Y
-dotdiff ブール値
デフォルト値:Y
onworks.net サービスを使用してオンラインで fdnaparse を使用する