これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、MAC OS オンライン エミュレーターなどの複数の無料オンライン ワークステーションの XNUMX つを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド gt-matchtool です。
プログラム：
NAME
gt-matchtool - 一致形式を解析したり、一致ツールを呼び出したりします。
SYNOPSIS
gt マッチツール [オプション ...]
DESCRIPTION
型 [...]
一致ファイル形式を選択します: OPENMATCH: 開いた match 形式、例: vmatch BLASTOUT : 表形式
BLAST 出力 (-m 8) BLASTALLP: blastp で BLASTALL を呼び出します BLASTALLN: BLASTALL を呼び出します
with blastn BLASTP : blastp を呼び出す BLASTN : blastn を呼び出す LAST : LAST を呼び出す SW : 使用する
スミス-ウォーターマン (デフォルト: OPENMATCH)
-マッチファイル [ファイル名]
入力ファイル名を設定します (デフォルト: 未定義)
-デシベル [ファイル名]
データベースファイル名を設定します (デフォルト: 未定義)
-スイミンレン [値]
最小必要なアライメント長を設定します (スミス-ウォーターマン アライメントの場合) (デフォルト: 10)
-swmaxedist [値]
最大許容編集距離を設定します (スミス-ウォーターマン アラインメントの場合) (デフォルト: 0)
-クエリ [ファイル名]
クエリファイル名を設定します (デフォルト: 未定義)
-助けて
ヘルプを表示して終了します
-バージョン
バージョン情報を表示して終了します
報告 バグ
バグを報告する[メール保護]>.
onworks.net サービスを使用して gt-matchtool をオンラインで使用する
