これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windowsオンラインエミュレーター、MACOSオンラインエミュレーターなどの複数の無料オンラインワークステーションのXNUMXつを使用してOnWorks無料ホスティングプロバイダーで実行できるコマンドinsdseqgetです。
プログラム:
NAME
insdseqget-GenBankからのシーケンスをXMLINSDSetとしてフォーマットします
SYNOPSIS
insdseqget [-] [-d ファイル名] [-i ファイル名] [-m n / p / b] [-n] [-o ファイル名] [-v]
DESCRIPTION
insdseqget GenBankから生物学的配列データを取得します(の入力リストによると
GIアクセッション番号)を作成し、XMLINSDSetドキュメントとして出力します。
OPTIONS
オプションの概要は以下に含まれています。
- 使用状況メッセージを印刷する
-d ファイル名
日付リストのファイル名を入力します(必要なアクセッション、XNUMX行にXNUMXつ、その後に
空白行と許可された日付のリスト、これもXNUMX行にXNUMXつ)
-i ファイル名
GIリストの入力ファイル名(デフォルト= stdin)
-m n / p / b
分子タイプ:
nヌクレオチド(デフォルト)
pプロテイン
b両方
-n 新しいレコードのみを返します(指定されたGIが古いバージョンを参照している)
-o ファイル名
XML INSDSetの出力ファイル名(デフォルト= stdout)
-v SNPバリエーションを取得する
onworks.netサービスを使用してオンラインでinsdseqgetを使用する