これはコマンドmapMers-depthであり、Ubuntu Online、Fedora Online、Windowsオンラインエミュレーター、MACOSオンラインエミュレーターなどの複数の無料オンラインワークステーションのXNUMXつを使用してOnWorks無料ホスティングプロバイダーで実行できます。
プログラム:
NAME
mapMers-depth-kmersをシーケンスにマッピングすることに関する情報を報告します
SYNOPSIS
mapMers-深さ {-カウント|- 深さ|-統計} -マーズ メリル -m メルサイズ -seq インファスタ
OPTIONS
モード of 操作
シーケンス序数 's'およびそのシーケンス内の位置 'p'の場合:
-カウント 位置(p)から始まる単一のkmerのカウント(c)を報告します。
フォーマット: 'spc'
- 深さ 位置(p)にまたがるkmerの数(n)を報告します。
フォーマット: 'spn'
-統計 スパンするすべてのmerの最小(m)、最大(M)、および平均(a)カウントを報告します
位置(p)。 総数(t)とkmerの数(n)も報告します
フォーマット: 'spm M atn'
-m メルサイズ
-マーズ メリル
メリル(1)データベース
-seq インファスタ
fasta入力シーケンス
mapMersを使用する-onworks.netサービスを使用してオンラインで深さ