これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、MAC OS オンライン エミュレーターなど、複数の無料オンライン ワークステーションのいずれかを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド mia-3dimagestatistics-in-mask です。
プログラム：
NAME
mia-3dimagestatistics-in-mask - 入力のマスクされた領域内の統計を評価します
データ。
SYNOPSIS
mia-3dimageマスク内の統計 -i -m [オプション]
DESCRIPTION
mia-3dimageマスク内の統計 このプログラムは、画像内の統計を評価します。
画像のマスクされた領域。 可能な出力は、要約統計量とヒストグラムです。
その価値。
OPTIONS
ファイル-IO
-i --image=(入力、必須); いお
分析する入力画像 サポートされているファイルの種類については、PLUGINS:3dimage/io を参照してください
-m --mask=(入力、必須); いお
分析を制限するために使用するマスク イメージ サポートされているファイル タイプについては、
プラグイン:3dimage/io
-s --summary=(出力); ストリング
要約統計をプレーンテキストとして書き込むファイル。
-H --histogram=(出力); ストリング
ヒストグラムを書き込むファイル
カスタマーサービス & インフォ
-V --verbose=警告
出力の冗長性、指定されたレベルおよびより高い優先順位のメッセージを出力します。
最も低いレベルから始まるサポートされる優先度は次のとおりです。
info ‐ 低レベルのメッセージ
トレース ‐ 関数呼び出しトレース
失敗する ‐ テストの失敗を報告する
警告 ‐ 警告
エラー ‐ エラーを報告する
debug ‐ デバッグ出力
メッセージ ‐ 通常のメッセージ
致命的な ‐ 致命的なエラーのみを報告する
-著作権
著作権情報を印刷する
-h --ヘルプ
このヘルプを印刷する
-? - 使用法
短いヘルプを印刷する
- バージョン
バージョン番号を出力して終了します
計測パラメータ
--構造名=未定義
統計が評価される構造の名前
-l --limit=20;単位 [20, inf)
マスクに少なくとも含める必要があるピクセル数。
-b --bins=8; [4, inf) の ulong
使用するヒストグラム ビンの数
--hmin=0
ヒストグラム マッピングの下限。 この値を下回るすべての値は、
最下位のビンにマップされます。 このパラメータが hmax 以上の場合、
ヒストグラムの範囲は自動的に評価されます。ヒストグラムの下限
マッピング。 この値を下回るすべての値は、最も低いビンにマップされます。 もしも
このパラメータが hmax 以上の場合、ヒストグラムの範囲は
自動的に評価されます。
--hmax=0
ヒストグラム マッピングの hpper 境界。 この値を超えるすべての値は
最高のビンにマップされます。 このパラメータが以下の場合
hmin、ヒストグラムの範囲は自動的に評価されます。
ヒストグラム マッピング。 この値を超えるすべての値は、
最高ビン。 このパラメータが hmin 以下の場合、ヒストグラム
範囲は自動的に評価されます。
処理
--スレッド=-1
処理に使用するスレッドの最大数。この数は小さくする必要があります。
またはマシン内の論理プロセッサ コアの数と同じです。 (-1:
自動推定)。処理に使用するスレッドの最大数。これは
数は、論理プロセッサ コアの数以下である必要があります。
この機械。 (-1: 自動推定)。
プラグイン: 3D画像/IO
分析します 7.5画像を分析する
認識されるファイル拡張子: .HDR、.hdr
サポートされている要素タイプ:
符号なし 8 ビット、符号付き 16 ビット、符号付き 32 ビット、浮動小数点 32 ビット、
浮動小数点64ビット
データプール 内部データプールとの間の仮想IO
認識されるファイル拡張子: .@
ディコム 3D としての Dicom 画像シリーズ
認識されるファイル拡張子: .DCM、.dcm
サポートされている要素タイプ:
符号付き16ビット、符号なし16ビット
HDF5 HDF5 3D画像IO
認識されるファイル拡張子: .H5、.h5
サポートされている要素タイプ:
バイナリデータ、符号付き8ビット、符号なし8ビット、符号付き16ビット、符号なし16ビット、
符号付き 32 ビット、符号なし 32 ビット、符号付き 64 ビット、符号なし 64 ビット、浮動小数点
小数点32ビット、浮動小数点64ビット
インリア インリア画像
認識されるファイル拡張子: .INR、.inr
サポートされている要素タイプ:
符号付き 8 ビット、符号なし 8 ビット、符号付き 16 ビット、符号なし 16 ビット、符号付き 32
ビット、符号なし 32 ビット、浮動小数点 32 ビット、浮動小数点 64 ビット
MHD MetaIO VTK 実装を使用した 3D 画像 IO (実験的)。
認識されるファイル拡張子: .MHA、.MHD、.mha、.mhd
サポートされている要素タイプ:
符号付き 8 ビット、符号なし 8 ビット、符号付き 16 ビット、符号なし 16 ビット、符号付き 32
ビット、符号なし 32 ビット、浮動小数点 32 ビット、浮動小数点 64 ビット
気の利いた NIFTI-1 3D画像IO
認識されるファイル拡張子: .NII、.nii
サポートされている要素タイプ:
符号付き 8 ビット、符号なし 8 ビット、符号付き 16 ビット、符号なし 16 ビット、符号付き 32
ビット、符号なし 32 ビット、符号付き 64 ビット、符号なし 64 ビット、浮動小数点 32
ビット、浮動小数点64ビット
VFF VFF Sun ラスター形式
認識されるファイル拡張子: .VFF、.vff
サポートされている要素タイプ:
符号なし8ビット、符号付き16ビット
ビスタ 3Dビュー
認識されるファイル拡張子: .V、.VISTA、.v、.vista
サポートされている要素タイプ:
バイナリデータ、符号付き8ビット、符号なし8ビット、符号付き16ビット、符号なし16ビット、
符号付き 32 ビット、符号なし 32 ビット、浮動小数点 32 ビット、浮動小数点 64
ビット
vti 3D 画像 VTK-XML の入力および出力 (実験的)。
認識されるファイル拡張子: .VTI、.vti
サポートされている要素タイプ:
符号付き 8 ビット、符号なし 8 ビット、符号付き 16 ビット、符号なし 16 ビット、符号付き 32
ビット、符号なし 32 ビット、浮動小数点 32 ビット、浮動小数点 64 ビット
VTK 3D VTK 画像のレガシー入力および出力 (実験的)。
認識されるファイル拡張子: .VTK、.VTKIMAGE、.vtk、.vtkimage
サポートされている要素タイプ:
バイナリデータ、符号付き8ビット、符号なし8ビット、符号付き16ビット、符号なし16ビット、
符号付き 32 ビット、符号なし 32 ビット、浮動小数点 32 ビット、浮動小数点 64
ビット
実施例
入力の要約統計量と 10 個のビンを持つヒストグラムを評価し、自動的に
評価された境界。 サマリーを summary.txt に保存し、ヒストグラムを hist.txt に保存します。
mia-3dimagestatistics-in-mask --image image.v.gz --mask Mask.v.gz --summary summary.txt
--ヒストグラム hist.txt
著者
ガート・ウォルニー
COPYRIGHT
このソフトウェアの著作権は 1999-2015 ライプツィヒ、ドイツおよびマドリード、スペインにあります。 来る
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オプション「--copyright」。
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