これはGapFillerという名前のLinuxアプリで、最新リリースはGapFiller-1.1.1.zipとしてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティングプロバイダーOnWorksでオンラインで実行できます。
GapFillerという名前のこのアプリをOnWorksで無料でダウンロードしてオンラインで実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
ギャップフィラー
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DESCRIPTION
GapFillerは、ペアの読み取り内のギャップを埋めるためのシードと拡張のローカルアセンブラーです。
DNAとRNAの両方に使用でき、イルミナのデータでテストされています。
GapFillerは、シーケンスの長さの大まかな見積もりがあれば、シーケンスの両端にある読み取りから開始してシーケンスをアセンブルするときにいつでも使用できます。
オプション
- サポートされている入力形式：FASTQ（.gz、.bz2）、FASTA（.gz、.bz2）、SAM、BAM
- 高度にカスタマイズ可能なアセンブリパラメータ
- シードとアセンブリに異なるデータセットを指定する可能性
- レイアウト情報を保存する可能性（組み立てられたコンティグ内の位置と方向を読み取る）
ユーザーインターフェース
コマンドライン
プログラミング言語
C + +
カテゴリー
これは、https：//sourceforge.net/projects/gapfiller/からも取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティングシステムのXNUMXつから最も簡単な方法でオンラインで実行するために、OnWorksでホストされています。
