これは、metawatt という名前の Linux アプリで、最新リリースは MetaWatt-3.5.3.zip としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
このメタワットという名前のアプリを OnWorks で無料でダウンロードしてオンラインで実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
スクリーンショットは
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メタワット
DESCRIPTION
Metawattビニングは、テトラヌクレオチド頻度の多変量統計と差分カバレッジベースのビニングを利用するグラフィカルなビニングツールです。 また、ビニング品質の分類学的評価も実行します（ダイヤモンドBLASTxを介して）。 作成されたビンは、fastaとして編集およびエクスポートできます。 MetawattはJavaSWINGに実装されており、SVGグラフィックのエクスポートについては、Diamond、HMMer3.1、BBMap、Prodigal、およびBatikライブラリに最小限依存しています。
引用：Strous M、Kraft B、Bisdorf R、TegetMeyer H（2012）混合培養の微生物生理学のためのメタゲノムコンティグのビニング。 微生物生理学および代謝のフロンティア3：410。 土井：10.3389 / fmicb.2012.00410
特徴
- メタゲノムコンティグのテトラヌクレオチドとディファレンシャルカバレッジビニングの組み合わせ
- データ探索用のグラフィカルユーザーインターフェイス
- ダイヤモンドブラストによるビンの分類学的プロファイリング
- 保存されたシングルコピー遺伝子の検出
- 保存された遺伝子に基づくビンの系統発生的ツリー化
- インタラクティブGC /カバレッジまたはカバレッジ/カバレッジプロット
- また、コマンドラインで完全に自動的に実行されます
Audience
科学/研究
ユーザーインターフェース
Java Swing
プログラミング言語
Java
カテゴリー
これは、https：//sourceforge.net/projects/metawatt/からも取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティングシステムのXNUMXつから最も簡単な方法でオンラインで実行するために、OnWorksでホストされています。
