cmtk-volume_reconstruction - 클라우드에서 온라인

프로그램:

이름

Volume_reconstruction - 볼륨 재구성

개요

Volume_reconstruction [옵션] refImage xform0 inImage0 [xform1 inImage1 ...]

기술

역 보간법을 사용하여 공동 등록된 이미지로부터 반복적인 볼륨 재구성 또는
조인트 디블러링

옵션

글로벌 툴킷 옵션 (이들 are 공유 by 모든 CMTK 도구)
--도움
기본 명령줄 옵션 목록을 표준 출력에 씁니다.

--도움말
기본 및 고급 명령줄 옵션의 전체 목록을 표준 출력에 씁니다.

--위키
MediaWiki 마크업의 표준 출력에 명령줄 옵션 목록을 씁니다.

--남성
표준 출력에 대한 'nroff' 마크업의 매뉴얼 페이지 소스를 작성하십시오.

--번역
툴킷 버전을 표준 출력으로 작성하십시오.

--에코
현재 명령줄을 표준 출력에 씁니다.

--상세 수준
상세 수준을 설정합니다.

--말 수가 많은, -v
자세한 표시 수준을 1씩 증가시킵니다(더 이상 사용되지 않음, 이전 버전과의 호환성을 위해 지원됨).

--스레드
최대 병렬 스레드 수를 설정합니다(POSIX 스레드 및 OpenMP의 경우).

입력 옵션
--exclude-첫 번째 이미지, -x
첫 번째 이미지를 별도의 등록 대상 이미지로 재구성에서 제외)

--수확고
픽셀 영역 x0,y0,z1:x1,y1,z1에 대한 참조 자르기

-- 통과 가중치 , -W
패스에 대한 기여 가중치를 'pass:weight' 형식으로 설정합니다.

재건 그리드
--recon-grid
재구성 그리드를 Nx,Ny,Nz:dX,dY,dZ[:Ox,Oy,Oz](dims:pixel:offset)로 정의합니다.

--recon-그리드-경로 , -R
재구성된 이미지 그리드를 정의하는 그리드에 경로 제공[오프셋 포함] [기본:
없음]

처음의 음량 주입 파라미터
--등방성 주입
등방성 볼륨 주입을 사용합니다. 그렇지 않으면 패스 이미지 픽셀 크기에 따라 크기가 조정됩니다.
치수]

--주입 커널 시그마 , -S
픽셀 크기의 배수로 볼륨 주입에 대한 가우스 커널의 표준 편차
각 방향으로. [기본: 1]

--주입 커널 반경 , -r
주입 커널의 절단 반경 계수입니다. 커널은 다음에서 잘립니다.
sigma*radius, 여기서 sigma는 커널 표준 편차입니다. [기본: 2]

음량 재건 옵션
--역보간 커널
역보간 재구성을 위한 커널 지원되는 값: "cubic",
"linear", "hamming-sinc", "cosine-sinc", 여기서 기본값은 "cubic"이거나 다음 중 하나를 사용합니다.
다음 :

--입방체, -C
삼차 보간 [이것 is 전에, 기본]

--선의, -L
삼선형 보간(더 빠르지만 덜 정확함)

--해밍-싱크, -H
해밍 윈도우 싱크 보간

--코사인-싱크, -O
코사인 창 sinc 보간(가장 정확하지만 가장 느림)

--디블러링
조인트 디블러링을 위한 포인트 확산 기능을 근사화하기 위한 커널 모양
재구성(이 중 하나를 선택하면 역보간 재구성이 비활성화됨)
지원되는 값: "box", "gaussian" 또는 다음 중 하나를 사용합니다.

--상자
상자 모양의 커널

--가우시안
가우스 커널

--psf
x,y,z로 점 확산 함수 크기를 명시적으로 설정합니다. '디블러링' 커널과 함께 사용
재건.

--psf-규모
스케일 포인트 확산 함수 크기는 이 값입니다. '디블러링' 커널과 함께 사용
재건. [기본: 1]

최적화 파라미터
--반복 횟수 , -n
최대 역보간 반복 횟수 [기본: 20]

--XNUMX차 오류, -f
최적화를 위해 XNUMX차 오류가 아닌 XNUMX차 오류를 사용합니다.

정규화 파라미터
--l-표준 무게
Tikhonov-type L-Norm 정규화에 대한 제약 가중치 설정(0은 제약 조건을 비활성화함)
[기본: 0]

--잘림 없음, -T
비선형 지역 강도 잘림 끄기

산출 옵션
--산출 , -o
최종 재구성된 이미지의 출력 경로 [기본: 재구성.nii ]

--쓰기 주입 이미지
이 경로에 초기 볼륨 주입 이미지 쓰기 [기본: 없음]

--쓰기-최저-최대-오류-이미지
MAXIMUM 오류가 가장 낮은 재구성된 이미지를 쓰기 위한 선택적 경로입니다. [기본:
없음]

--write-images-float, -F
출력 이미지를 부동 소수점으로 쓰기

작가

Torsten Rohlfing, Michael P. Hasak, Greg Jefferis, Calvin R.
마우러, 다니엘 B. 루사코프, 야로슬라프 할첸코

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