이것은 Ubuntu Online, Fedora Online, Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MAC OS 온라인 에뮬레이터와 같은 여러 무료 온라인 워크스테이션 중 하나를 사용하여 OnWorks 무료 호스팅 제공업체에서 실행할 수 있는 kmc_tools-complex 명령입니다.
프로그램:
이름
kmc_tools-complex - 다수의 입력 데이터베이스를 사용한 복잡한 작업
개요
kmc_tools 콤플렉스
기술
이 명령은 다음에 정의된 작업 조합을 실행합니다.
. 다음 구문을 포함하는 텍스트 파일입니다.
__________________________________________________________________
|입력: |
| = [매개변수] |
| = [매개변수] |
|... |
| = [매개변수] |
|출력: |
| = [ [...] |
|[OUTPUT_PARAMS: __|
| ] | /
| | /
|_________________________________________________|/
매개 변수
입력1, 입력2, ..., 입력 N
방정식을 정의하는 데 사용되는 입력 이름
입력1_db_경로, 입력2_db_경로, ..., inputN_db_path
k-mers 세트에 대한 경로
각 입력에 대해 설정할 수 있는 추가 매개변수가 있습니다.
-ci
다음보다 적게 발생하는 k-mer를 제외합니다. 타임스
CX
다음보다 많이 발생하는 k-mer를 제외합니다. 타임스
out_db_path
출력 데이터베이스 경로
ref_input
input1, input2, ..., inputN 중 하나
오퍼레이터
{intersect, kmers_subtract, counters_subtract,
노동 조합}
연산자 '*'는 우선순위가 가장 높습니다. 다른 연산자의 우선순위는 동일합니다. 의 순서
괄호로 연산을 변경할 수 있습니다.
출력 매개 변수 :
-ci
다음보다 적게 발생하는 k-mer를 제외합니다. 타임스
-cx
다음보다 많이 발생하는 k-mer를 제외합니다. 타임스
-cs
카운터의 최대값
예
__________________________________________________________________
|입력: |
|set1 = kmc_o1 -ci5 |
|set2 = kmc_o2 |
|set3 = kmc_o3 -ci10 -cx100 __|
|출력: | /
|결과 = (세트3+세트1)*세트2 | /
|_________________________________________________|/
onworks.net 서비스를 사용하여 온라인으로 kmc_tools-complex를 사용하세요.
