이는 Ubuntu Online, Fedora Online, Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MAC OS 온라인 에뮬레이터와 같은 여러 무료 온라인 워크스테이션 중 하나를 사용하여 OnWorks 무료 호스팅 제공자에서 실행할 수 있는 kmc_tools 명령입니다.
프로그램:
이름
kmc_tools - k-mer 데이터베이스에 대한 추가 작업
개요
kmc_tools [전역 매개변수] [작업 매개변수]
기술
이 명령과 다양한 하위 주석은 KMC에서 여러 작업을 구현합니다.
데이터베이스.
케이-메르스 세트 운영 을 통한 2 KMC 데이터베이스
교차하다
2개의 k-mer 집합의 교집합
kmers_subtract
2k-mer 세트의 뺄셈
카운터_빼기
2k-mer 세트의 카운터 뺄셈
노동 조합
2개의 k-mer 집합의 합집합
운영 을 통한 단일 kmc 데이터베이스
종류
KMC2.x에서 생성된 데이터베이스에서 k-mer를 정렬합니다.
감소
너무 드물고 너무 빈번한 k-mer 제외
팩트
카운터 제거(k-mer만 저장)
막대 그래프
k-mer 발생 히스토그램
덤프
k-mer와 카운터를 텍스트 파일에 덤프합니다.
더 보기 복잡한 작업 :
복잡한
여러 입력 데이터베이스를 사용한 복잡한 작업
기타 작업 :
필터링
k-mer 수가 너무 적은 읽기를 필터링합니다.
옵션
글로벌 매개 변수 :
-티
총 스레드 수(기본값: CPU 코어 수)
-v
자세한 정보 표시 모드를 활성화합니다(기본값: false)
-HP
진행률 백분율 숨기기(기본값: false)
예
kmc_tools 유니온 db1 -ci3 db2 -ci5 -cx300 db1_union_db2 -ci10
onworks.net 서비스를 사용하여 kmc_tools를 온라인으로 사용하세요
