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온웍스 파비콘

mapMers-depth - 클라우드의 온라인

Ubuntu Online, Fedora Online, Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MAC OS 온라인 에뮬레이터를 통해 OnWorks 무료 호스팅 제공업체에서 mapMers-depth 실행

이것은 Ubuntu Online, Fedora Online, Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MAC OS 온라인 에뮬레이터와 같은 여러 무료 온라인 워크스테이션 중 하나를 사용하여 OnWorks 무료 호스팅 제공업체에서 실행할 수 있는 mapMers-depth 명령입니다.

프로그램:

이름


mapMers-depth - kmer를 시퀀스에 매핑하는 방법에 대한 정보 보고

개요


mapMers 깊이 {-카운트|-깊이|-통계} -메르스 메릴 -m 메르사이즈 -seq 인파스타

옵션


모드 of 조작
시퀀스 서수 ''' 및 해당 시퀀스 'p'의 위치:

-카운트 위치(p)에서 시작하는 단일 kmer의 수(c)를 보고합니다.

형식: 'spc'

-깊이 위치(p)에 걸쳐 있는 kmer의 수(n)를 보고합니다.

형식: 'spn'

-통계 최소(m), 최대(M) 및 평균(a) 범위에 걸쳐 있는 모든 메르의 수를 보고합니다.
위치(p). 또한 총 수(t) 및 kmers 수(n)를 보고합니다.

형식: 'spm M atn'

일반
-m 메르사이즈

-메르스 메릴
메릴(1) 데이터베이스

-seq 인파스타
fasta 입력 시퀀스

onworks.net 서비스를 사용하여 mapMers-depth 온라인 사용


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