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프로그램:

이름

miconv - 의료 이미지 데이터를 형식 간에 변환합니다.

개요

미콘브 [옵션] []

기술

miconv: 의료 이미지 데이터를 형식 간에 변환합니다.

파일 형식은 파일 확장자로 자동 식별됩니다. 에 기대된다
끝 부분에 최소 두 개의 파일 이름/디렉토리(입력 및 출력 파일용)
명령줄. 단 하나만 필요한 옵션 '-l'은 예외입니다.
파일 이름/디렉토리를 사용하여 내용을 나열합니다.

일반 옵션 :
-l: 공백으로 구분된 프로토콜 매개변수 세트를 나열하고 종료합니다. '-l help'를 사용하여
가능한 매개변수 목록과 모든 매개변수를 나열하려면 '-l all'. 매개변수
이 옵션을 사용할 때는 '출력 파일'을 생략해야 합니다.

-p: 기본값으로 이 프로토콜을 로드합니다.

프로토콜 옵션 :
-데이트: 스캔 날짜 [yyyymmdd] (기본값=20140807yyyymmdd)

-fp: 위상 방향의 FOV[mm](기본값=220.0mm)

-정말로: 읽기 방향의 FOV[mm](기본값=220.0mm)

-fs: 슬라이스 방향의 FOV[mm](기본값=5.0mm)

-nr: 연속 측정 횟수(기본값=1)

-nx: 읽기 방향의 포인트 수(기본값=128)

-니: 위상 방향의 포인트 수(기본값=128)

-nz: 슬라이스 방향의 포인트 수(기본값=1)

-출산: 환자의 생년월일 [yyyymmdd] (기본값=00000000yyyymmdd)

-피드: 고유한 환자 식별자(기본값=알 수 없음)

-이름: 전체 환자 이름(기본값=알 수 없음)

-psex: 환자 성별(옵션=MFO, 기본값=O)

-중량: 환자 체중[kg] (기본값=50.0kg)

-과학적: 과학자 이름(기본값=알 수 없음)

-SD: 슬라이스 간 거리(중심에서 중심까지) [mm] (기본값=10.0mm)

-serd: 시리즈 설명(기본값=알 수 없음)

-세로노: 시리즈 번호(기본값=1)

-성: 슬라이스 두께 [mm] (기본값=5.0mm)

-마개: 연구 설명(기본값=알 수 없음)

-tc이름: 송신 코일의 이름(기본값=알 수 없음)

-테: 시퀀스의 에코까지의 시간[ms](기본값=80.0ms)

-시각: 스캔 시간 [hhmmss] (기본값=091009hhmmss)

-tr: 연속 여기 사이의 시간 [ms] (기본값=1000.0ms)

입양 부모로서의 귀하의 적합성을 결정하기 위해 미국 이민국에 읽기 옵션 :
-cplx: 데이터를 복잡한 것으로 취급하고 주어진 구성요소를 추출합니다(옵션=없음 abs pha real
imag , 기본값=없음)

-ds: 여러 데이터셋을 읽을 경우 추출할 데이터셋 인덱스

-필터: 프로토콜 매개변수 'key'에 문자열이 포함된 데이터 세트만 읽습니다.
'값'('키=값' 형식으로 지정)

-fmap: 메모리 사용량을 줄이기 위해 (raw) 데이터를 읽은 후 파일 매핑을 유지하지만 쓰기
어레이에 충돌이 발생합니다.

-jdx: JDX 어레이가 여러 개 있는 경우 이 항목을 선택합니다.

-방언: 형식의 주어진 방언을 사용하여 데이터를 읽습니다. (기본값은 방언 없음)

-rf: 형식을 읽고 파일 확장자를 재정의하는 데 사용합니다(options=autodetect 3db analyze asc
coi dat dcm 더블 플로트 gz hdr idx ima 인터파일 jdx mag mhd nii ph png pos pro
reg s16bit s32bit s8bit smp u16bit u32bit u8bit, 기본값=자동 감지)

-건너 뛰기: 원시 데이터를 읽기 전에 이 바이트 수를 건너뜁니다(기본값=0).

입양 부모로서의 귀하의 적합성을 결정하기 위해 미국 이민국에 쓰다 옵션 :
-추가: 원시 데이터에 대해서만 기존 파일에 추가

-fnamepar: 고유한 생성 시 포함할 프로토콜 매개변수의 공백으로 구분된 목록
파일 이름

-노스케일: 정수를 저장할 때 값을 재조정하지 마십시오.

-스플릿: 프로토콜-데이터 쌍을 별도의 파일로 강제 분할합니다.

-유형: 이미지 표현 유형 (옵션=자동 float double s32bit u32bit s16bit
u16bit s8bit u8bit, 기본값=자동)

-방언: 형식의 주어진 방언을 사용하여 데이터를 씁니다. (기본값은 방언 없음)

-wf: 형식을 작성하고 파일 확장자를 재정의하는 데 사용합니다(options=autodetect 3db analyze asc
coi dat dcm 더블 플로트 gz hdr idx ima 인터파일 jdx mag mhd nii ph png pos pro
reg s16bit s32bit s8bit smp u16bit u32bit u8bit, 기본값=자동 감지)

-wp: 이 파일에 프로토콜을 별도로 저장합니다.

필터 :
-맞추다 : 데이터를 지오메트리(복셀 위치)에 정렬합니다.
외부 파일

-자동마스크 : 자동 히스토그램 기반 임계값을 사용하여 마스크 생성

-클러스터 : 크기별로 정렬된 XNUMX이 아닌 인접/이웃 복셀 클러스터 생성

-말다 <컨볼루션 커널(Gauss NoFilter Triangle Hann Hamming CosSq Blackman
BlackmanNuttall Exp ), 커널 직경 [mm]> : 공간 차원의 컨볼루션

- 추세를 억제하다 <제거할 저주파 성분의 수, 결과의 평균은 0입니다.
timecourse> : 시간 경과에 따른 느린 드리프트 제거

-편집하다 <형식의 위치/범위 문자열(timeframe,slicepos,phasepos,readpos),새 값
of voxel> : 단일 복셀 값 편집

-젠마스크 : 값이 있는 모든 복셀을 포함하는 마스크 생성
주어진 범위에서

-등방성 : 보간을 통해 이미지 복셀을 등방성으로 만듭니다(이미지
지오메트리는 변경되지 않습니다)

-저역 통과 : 저역 통과 필터링

-최대 : 최대값을 초과하는 모든 값 자르기

-맥시프 : 최대 강도 투영 수행
주어진 방향을 넘어서

-병합 : 시간 차원을 확장하여 데이터세트를 단일 데이터세트로 병합

-분 : 최소값 이하의 모든 값 자르기

-미니프 : 최소 강도 투영 수행
주어진 방향을 넘어서

-noNaN : 모든 NaN을 주어진 값으로 바꿉니다.

-플립 : 데이터를 위상 방향으로 뒤집기

-프랭 : 범위 선택
위상 방향

- 프로젝트 : 주어진 값에 대해 평균 투영을 수행합니다.
방향

-콴틸마스크 : 주어진 분수 이상의 모든 복셀을 포함하는 마스크 생성
임계값

-리샘플링 : 이미지 데이터의 임시 크기 조정

-크기 조정 : 이미지 데이터의 공간적 크기 조정

-재슬라이스 : 주어진 이미지로 재분할
정위

-플립 : 읽기 방향으로 데이터 뒤집기

-썩음 : 면내 회전

-정렬 : 범위 선택
방향을 읽다

-규모 : 이미지 값 재조정

-뒤집기 : 슬라이스 방향으로 데이터 뒤집기

-시프트 <read방향 이동 [픽셀], 위상 방향 이동 [픽셀], 슬라이스 방향 이동
[픽셀]> : 데이터를 공간적으로 이동

-슬라이스 타임 : 올바른
슬라이스의 다른 획득 시점

-접착 : 접합
주어진 방향의 이미지

-이상한 : 범위 선택
슬라이스 방향

-스왑딤 <[rps][-],[rps][-],[rps][-]> : 방향을 지정하여 치수를 바꾸거나 반영합니다.
선택적 반사 기호가 추가된 트리플

-타일 : 슬라이스를 정사각형 2D 이미지로 결합

- 이상한 : 범위 선택
시간 방향

-tshift : 시간에 따른 데이터 이동

-typemax : 특정 데이터 유형의 최대값을 초과하는 모든 값 자르기

-typemin : 특정 데이터 유형의 최소값 이하의 모든 값을 자릅니다.

- 유즈마스크 : 파일에서 마스크 내의 모든 값을 포함하는 1D 데이터셋 생성

기타 옵션 :
-v 또는 모든 구성 요소 또는 단일 구성 요소를 디버깅/추적하기 위해
구성 요소, 각각. loglevel에 가능한 값은 0(noLog), 1(errorLog),
2(경고 로그), 3(정보 로그).

-h, --도움, -도움, --번역 : 도움말 텍스트 또는 버전 정보 인쇄

지원 파일 확장자(형식):
3db(Iris3D 바이너리 데이터)

분석하다
(NIFTI/ANALYZE, 방언: fsl )

asc (ASCII, 방언: tcourse )

coi(JCAMP-DX 데이터 세트)

dat(Matlab ASCII 2D 데이터 매트릭스)

dcm(DICOM, 방언: siemens)

이중(이중 원시 데이터)

float(플로트 원시 데이터)

gz(다른 형식을 위한 GNU-Zip 컨테이너)

hdr (Interfile, 방언: neurostat )

hdr (NIFTI/ANALYZE, 방언: fsl )

idx(ASCII에서 3이 아닌 XNUMXD 인덱스)

ima(DICOM, 방언: siemens)

인터파일
(Interfile, 방언: neurostat )

jdx(JCAMP-DX 이미지 형식)

mag (DICOM, 방언: siemens)

mhd(메타 이미지)

nii (NIFTI/ANALYZE, 방언: fsl )

ph(DICOM, 방언: siemens)

png(이동식 네트워크 그래픽)

pos(ASCII에서 XNUMX이 아닌 xy 위치)

pro (ODIN 측정 프로토콜)

reg(Ansoft HFSS ASCII)

s16bit(서명된 16비트 원시 데이터)

s32bit(서명된 32비트 원시 데이터)

s8bit(서명된 8비트 원시 데이터)

smp(JCAMP-DX 데이터 세트)

u16bit(부호 없는 16비트 원시 데이터)

u32bit(부호 없는 32비트 원시 데이터)

u8bit(부호 없는 8비트 원시 데이터)

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