mincstats - 클라우드의 온라인

프로그램:

이름

mincstats - minc 파일의 복셀에 대한 간단한 통계 계산

개요

mincstats [ ] .mnc

기술

Mincstats minc 파일의 모든 복셀에 대한 간단한 통계 측정값을 계산합니다.
이는 복셀별 측정이 아니라 전역 통계 측정이라는 점에 유의하십시오(참조:
최소 평균 그에 대한). 기본적으로 모든 통계가 계산됩니다. 어떤 통계가 있다면
명령줄 옵션을 통해 요청하면 요청된 통계만 인쇄됩니다.

이 프로그램의 매우 유용한 기능은 복셀 세트를 제한하는 기능입니다.
포함된 값의 범위를 제한하거나
또는 제한된 범위의 마스크 파일을 사용합니다. 입력 파일에 대한 다중 범위 또는
마스크 파일을 지정할 수 있습니다. 포함된 볼륨 값의 각 범위 및 각 범위에 대해
마스크 값의 관련 통계가 인쇄됩니다(n*m 값, 여기서 n은 숫자입니다.
볼륨 범위 및 m 마스크 범위 수). 이러한 계산은 단일로 수행됩니다.
데이터를 통과하므로 여러 범위를 지정하는 것이
프로그램을 반복적으로 실행합니다. 이는 여러 지역 평균을 계산할 때 매우 유용합니다.
VOI 마스크 볼륨.

히스토그램 및 관련 통계 측정에 대해 특별히 언급해야 합니다. 그만큼
히스토그램의 기본 범위는 파일의 가장 작은 값에서 가장 큰 값까지입니다. ~ 안에
드물지 않지만 특별한 경우 히스토그램 빈의 수가 정확히 일치하는 경우
파일에서 가능한 값의 수(예: 전체 범위 바이트 데이터의 경우 256개 빈),
히스토그램은 기본 히스토그램 범위를 사용할 때 이상한 기능으로 끝날 수 있습니다. 이것
데이터의 이산화에서 발생하며 약간
일치하지 않는 히스트그램. 바이트 데이터의 예에서 사용해야 하는 값은 256입니다.
최소값 아래로 빈의 절반과 빈의 절반을 확장하는 빈 및 히스토그램 범위
가장 큰 위. 사용 옵션 -discrete_히스토그램 이 문제를 자동으로 해결하거나
-integer_histogram 입력 데이터가 본질적으로 정수인 경우 단위 너비의 빈을 갖습니다.
(예: 레이블 데이터). 일반적으로 불연속화된 리비닝에 대해 주의해야 합니다.
데이터를 이산화 수준에 가까운 빈 크기의 히스토그램으로 변환합니다.

옵션

옵션은 (고유한 한) 축약된 형식으로 지정할 수 있습니다.
명령줄 어디에서나 지정할 수 있습니다. 통계가 인쇄되는 순서
에 관계없이 또는 요청된 순서에 관계없이 항상 동일합니다.
명령 줄

일반 옵션

-소지품
기존 파일을 덮어씁니다.

-노클로버
기존 파일을 덮어쓰지 마십시오(기본값).

-말 수가 많은
추가 정보를 인쇄합니다(기본값 이상).

-조용한 요청한 번호만 출력

-max_buffer_size_in_kb 크기
내부 버퍼의 최대 크기(KB)를 지정합니다. 기본값은 4MB입니다.

잘못된 가치 옵션

-ignore_nan
통계 계산에서 잘못된 값(유효 범위를 벗어남)을 제외합니다. 이것은
기본값.

-include_nan
유효하지 않은 값을 XNUMX으로 취급하고 통계 계산에 포함합니다.

-replace_nan 가치
유효하지 않은 값을 지정된 값으로 바꾸고 새 값을
통계 계산.

음량 범위 옵션

-바닥 min1,min2, ...
통계에 포함할 데이터 범위의 하한을 쉼표로 구분한 목록입니다.
계산.

-올림 max1,max2, ...
통계에 포함할 데이터 범위에 대한 쉼표로 구분된 상한 목록
계산.

-범위 min1,max1,min2,max2, ...
포함할 데이터 범위에 대한 하한 및 상한의 쉼표로 구분된 목록
통계 계산.

-binvalue val1,val2, ...
통계 계산에 포함할 정수 값의 쉼표로 구분된 목록입니다. 범위
지정된 각 값 주위에는 +/- 0.5가 정의됩니다.

-마스크 파일명.mnc
통계 계산에 포함된 데이터를 마스킹하는 데 사용할 파일 이름입니다. 을 위한
효과가 있으려면 다음 중 하나를 사용하여 마스크 범위를 지정해야 합니다.
옵션을 제공합니다.

-마스크_바닥 min1,min2,...:
처럼 -바닥이지만 마스크 파일에 적용됩니다.

-mask_ceil max1,max2, ...
처럼 -올림이지만 마스크 파일에 적용됩니다.

-마스크_범위 min1,max1,min2,max2, ...
처럼 -범위이지만 마스크 파일에 적용됩니다.

-mask_bin값 val1,val2, ...
처럼 -binvalue이지만 마스크 파일에 적용됩니다.

히스토그램 옵션

-히스토그램 파일 이름
히스토그램이 기록되는 파일 이름을 지정합니다. 범위가 여러 개인 경우
또는 마스크 범위가 지정되면 모든 히스토그램이 이 파일에 기록됩니다.
빈 줄로 구분됩니다. 각 히스토그램을 설명하는 정보는 이전에 작성됩니다.
해시(파운드) 문자로 시작하는 행에 있습니다. 이러한 파일을 로드할 수 있습니다.
gnuplot에.

-hist_bins 빈 수
히스토그램의 빈 수를 지정합니다.

-빈 빈 수
동의어 -hist_bins.

-히스트_플로어 분
히스토그램의 하한을 지정합니다.

-hist_ceil 최대
히스토그램의 상한을 지정합니다.

-히스트_범위 분 최대
히스토그램의 범위 지정

-integer_histogram
정수 값을 중심으로 단위 너비의 Bin을 만듭니다. 이는 다음과 같은 경우에 유용합니다.
라벨과 같은 정수 데이터. 히스토그램 범위는 가장 가까운 정수로 반올림됩니다.
그러면 최소값이 낮아지고 최대값이 0.5씩 높아집니다. 빈의 수를 가져옵니다
이 두 값의 차이로. 0.01이 최소값에 추가되고
반올림 전에 최대값에서 빼서
올바르게 지정된 범위(예: [0.5,255.5])는 유지됩니다. 갖고 싶다면
XNUMX보다 넓은 정수 빈의 경우 히스토그램 범위를 계산해야 합니다.
그리고 이 옵션을 사용하지 마세요.

-discrete_히스토그램
입력 데이터의 이산화에 히스토그램을 일치시키려고 시도합니다. 이것은
정수 표현으로 저장된 연속 데이터에 적합하며
이산화에 가까운 빈 너비가 필요한 경우. 이는 다음과 유사합니다.
-integer_histogram, 히스토그램 범위가 먼저 복셀로 변환된다는 점을 제외하고
반올림되고 양쪽에서 Bin의 절반만큼 확장되는 값입니다. 이 새로운 복셀
범위는 실제 값으로 다시 변환됩니다. 빈의 수는 다음과 같이 간주됩니다.
복셀 값 범위의 차이. 이것은 변형을 설명하지 않습니다.
슬라이스 간 스케일링에서는 여전히 이상한 히스토그램 효과가 발생할 수 있습니다. 이 옵션은
의 것과 유사한 동작을 제공하기 위한 것입니다. 볼륨 통계.

-int_max_bins 빈 수
위와 같이 자동으로 크기를 조정할 수 있는 가장 큰 히스토그램을 지정합니다.
옵션. 이 제한은 실수로 거대한 히스토그램이 생성되는 것을 방지합니다. 이 옵션
오래된 교체 -max_bins MINC 1.1의 옵션.

Basic 통계

-모두 모든 통계 측정값을 계산합니다. 이것이 기본값입니다.

-없음 동의어 -카운트 (volume_stats와 유사함). 비록 이것이
에 필요한 볼륨 통계, 다음 중 하나를 지정하기 때문에 여기서는 필요하지 않습니다.
옵션이 자동으로 꺼집니다 -모두

-카운트 범위 및 마스크 내에 있는 복셀 수를 계산합니다.

-퍼센트
범위 및 마스크 내의 복셀 백분율을 인쇄합니다.

-음량
범위 내 복셀의 부피와 마스크(mm 큐브)를 인쇄합니다.

-분 최소값을 인쇄합니다.

-최대 최대값을 인쇄합니다.

-합집합 모든 값의 합계를 인쇄합니다.

-sum2 모든 값의 제곱합을 인쇄합니다.

-평균 평균을 인쇄하십시오.

-변화
차이를 인쇄합니다.

-stddev
표준편차를 인쇄합니다.

-왜곡
샘플 왜곡도(3차 모멘트)를 인쇄합니다.

-첨도
샘플 첨도(4번째 적률)를 인쇄합니다.

-컴 질량 중심을 인쇄합니다. 복셀 좌표와 월드 좌표는 모두
인쇄. 복셀 좌표는 파일 순서대로 인쇄되지만 세계는
좌표는 x,y,z 순서로 인쇄됩니다.

-com 동의어 -컴.

-세계_만
질량 중심을 세계 좌표로만 인쇄합니다.

히스토그램 통계

히스토그램 통계는 히스토그램 카운트 및 빈에서만 파생됩니다.
따라서 중앙값과 같은 결과는 실제 값과 정확히 동일하지 않습니다.
모두 포함된 복셀. 예를 들어 중앙값의 오차는 Bin의 절반만큼 클 수 있습니다.
너비. 또한 히스토그램 범위가 포함된 복셀의 범위보다 작으면
결과는 히스토그램에 포함된 복셀에만 적용됩니다.

-hist_count
히스토그램의 복셀 수를 인쇄합니다. 이것은 갯수와 다를 수 있습니다.
히스토그램 범위가
포함된 데이터.

-hist_percent
히스토그램에 포함된 복셀의 비율을 인쇄합니다.

-중앙값
히스토그램 중앙값을 인쇄합니다.

-다수
카운트가 가장 많은 빈에 대한 빈 중심(강도 값)을 인쇄합니다.

-biModalT
볼륨을 두 클래스로 분리하는 이중 모드 임계값을 인쇄합니다. 기본값은 다음과 같습니다.
otsu 방법을 사용하려면(아래 옵션 참조)

-오츠 Otsu N, "A Threshold Selection Method from Grey-level"에 설명된 방법을 사용합니다.
히스토그램", IEEE Trans on Systems, Man and Cybernetics. 1979, 9:1; 62-66 ~
임계값을 계산

-키틀러
Kittler&Illingworth '86 알고리즘을 사용하여 이중 모드 임계값을 계산합니다.
Kittler, J. & Illingworth J., "최소 오류 임계값", 패턴 인식,
19권, 41-47페이지, 1986.

-카푸르 Kapur 등을 사용하십시오. 바이모달 임계값을 계산하는 '85 알고리즘. 카푸르,
Sahoo & Wong "의 엔트로피를 사용한 그레이 레벨 그림 임계값을 위한 새로운 방법
히스토그램", 컴퓨터 비전, 그래픽 및 이미지 처리, vol 29, pp
273-285, 1985.

-단순한
간단한 평균 평균 알고리즘을 사용하여 바이모달 임계값을 계산합니다.
일부 대안보다 계산 비용이 많이 들고
잘 했어. 그러나 다른 방법보다 더 강력한 것 같습니다.

-pctT 히스토그램의 특정 임계 백분율에 필요한 임계값을 인쇄합니다.

-엔트로피
Shannon 엔트로피를 인쇄하십시오.

H(x) = - 합계(P(i) * log2(P(i))

여기서 P(i)는 빈 확률입니다.

일반적인 옵션 for 모든 명령 :

-도움 명령줄 옵션의 요약을 인쇄하고 종료합니다.

-번역
프로그램의 버전 번호를 인쇄하고 종료합니다.

onworks.net 서비스를 사용하여 온라인으로 mincstats를 사용하세요.