이것은 FFP-Feature Frequency Profile Phylogeny라는 이름의 Linux 앱으로 Linux 온라인에서 실행되며 최신 릴리스는 ffp-3.19.tar.gz로 다운로드할 수 있습니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체 OnWorks에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.
FFP-Feature Frequency Profile Phylogeny라는 이름의 이 앱을 온라인으로 다운로드하여 온라인으로 실행하여 OnWorks와 함께 Linux에서 무료로 실행하십시오.
이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.
- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.
- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.
- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.
- 4. 이 웹사이트에서 OnWorks Linux 온라인 또는 Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MACOS 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.
- 5. 방금 시작한 OnWorks Linux OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.
- 6. 응용 프로그램을 다운로드하여 설치하고 실행합니다.
FFP-Feature Frequency Profile 계통발생은 Linux에서 온라인으로 실행됩니다.
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기술
FFP(Feature Frequency Profile)는 계통 발생 분석 및 텍스트 비교를 위한 정렬이 필요 없는 비교 도구입니다. 뉴클레오티드 시퀀스, 완전한 게놈, 프로테옴에 적용할 수 있으며 텍스트 비교에도 사용할 수 있습니다.기능
- FASTA 형식의 게놈, 단백질 및 핵산 서열 비교
- Phylip 스타일 거리 행렬 출력
- XNUMX가지 이상의 거리 측정
- 빠른 정렬이 필요 없는 비교 방법 사용
- k-mer 카운팅을 위한 빠른 Rabin-Karp 해싱 구현
- Spaced-seed/masking 해시 기능은 DNA/아미노산 불일치를 허용합니다.
오디언스 (Audience)
과학/연구, 교육
사용자 인터페이스
명령줄
프로그래밍 언어
유닉스 쉘, 펄, C
데이터베이스 환경
플랫 파일
이것은 https://sourceforge.net/projects/ffp-phylogeny/에서도 가져올 수 있는 응용 프로그램입니다. 무료 운영 체제 중 하나에서 가장 쉬운 방법으로 온라인으로 실행하기 위해 OnWorks에서 호스팅되었습니다.
