이것은 최신 릴리스를 GapFiller-1.1.1.zip으로 다운로드할 수 있는 GapFiller라는 Linux 앱입니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체인 OnWorks에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.
OnWorks와 함께 GapFiller라는 이 앱을 무료로 다운로드하여 온라인에서 실행하십시오.
이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.
- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.
- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.
- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.
- 4. 이 웹사이트에서 OnWorks Linux 온라인 또는 Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MACOS 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.
- 5. 방금 시작한 OnWorks Linux OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.
- 6. 응용 프로그램을 다운로드하여 설치하고 실행합니다.
갭필러
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기술
GapFiller는 쌍을 이루는 읽기 내의 간격을 채우기 위한 시드 및 확장 로컬 어셈블러입니다.
DNA와 RNA 모두에 사용할 수 있으며 Illumina 데이터에서 테스트되었습니다.
GapFiller는 시퀀스 길이의 대략적인 추정치를 제공할 때 끝 부분에 있는 읽기부터 시작하여 시퀀스를 조립할 때마다 사용할 수 있습니다.
기능
- 지원되는 입력 형식: FASTQ(.gz, .bz2), FASTA(.gz, .bz2), SAM, BAM
- 고도로 사용자 정의 가능한 어셈블리 매개변수
- 시드 및 조립을 위해 다른 데이터 세트를 지정할 가능성
- 레이아웃 정보 저장 가능성(조립된 컨티그 내에서 위치 및 방향 읽기)
사용자 인터페이스
명령줄
프로그래밍 언어
C + +
카테고리
이것은 https://sourceforge.net/projects/gapfiller/에서도 가져올 수 있는 애플리케이션입니다. 무료 운영 체제 중 하나에서 가장 쉬운 방법으로 온라인으로 실행하기 위해 OnWorks에서 호스팅되었습니다.
