이것은 최신 릴리스를 quast-5.0.2.tar.gz로 다운로드할 수 있는 QUAST라는 Linux 앱입니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체인 OnWorks에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.
OnWorks와 함께 QUAST라는 이 앱을 무료로 다운로드하여 온라인에서 실행하십시오.
이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.
- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.
- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.
- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.
- 4. 이 웹사이트에서 OnWorks Linux 온라인 또는 Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MACOS 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.
- 5. 방금 시작한 OnWorks Linux OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.
- 6. 응용 프로그램을 다운로드하여 설치하고 실행합니다.
스크린 샷
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콰스트
기술
QUAST는 게놈 어셈블리의 빠르고 편리한 품질 평가 및 비교를 수행합니다.
QUAST는 contig 정확도, 발견된 유전자 수, N50 등 잘 알려진 여러 메트릭을 계산하고 NA50과 같은 새로운 메트릭을 도입합니다(자세한 내용은 논문 및 매뉴얼 참조). 요약 테이블(일반 텍스트, 탭으로 구분 및 LaTeX 형식) 및 다채로운 플롯의 포괄적인 분석 결과. 또한 이 도구는 탐색하기 쉬운 하나의 파일에 모든 정보를 압축한 웹 기반 보고서를 생성합니다.
QUAST에는 직관적인 명령줄 인터페이스와 사용자가 실행하고 출력을 이해하는 데 도움이 되는 자세한 설명서가 있습니다. 또한 연구소는 web-QUAST의 베타 버전을 시작했습니다. http://quast.bioinf.spbau.ru/ 품질 평가를 더욱 간단하게 만듭니다.
QUAST 및 MetaQUAST(metagenomic assemblies의 확장) 논문이 Bioinformatics에 게재되었습니다.
기능
- 웹 기반 보고서, 일반 txt의 표, 탭으로 구분된 LaTeX 형식
- 다채로운 플롯과 히스토그램
- 참조 게놈 유무에 따른 품질 평가
- metagenomic 어셈블리의 품질 평가
- 인터랙티브 컨티그 브라우저
오디언스 (Audience)
과학/연구, 개발자, 최종 사용자/데스크톱
사용자 인터페이스
웹 기반, 명령줄
프로그래밍 언어
파이썬, 자바스크립트
카테고리
이것은 https://sourceforge.net/projects/quast/에서도 가져올 수 있는 애플리케이션입니다. 무료 운영 체제 중 하나에서 가장 쉬운 방법으로 온라인으로 실행하기 위해 OnWorks에서 호스팅되었습니다.
