ນີ້ແມ່ນຄໍາສັ່ງ extractseqe ທີ່ສາມາດດໍາເນີນການໄດ້ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີໂດຍໃຊ້ຫນຶ່ງໃນຫຼາຍບ່ອນເຮັດວຽກອອນໄລນ໌ຂອງພວກເຮົາເຊັ່ນ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator ຫຼື MAC OS online emulator
ໂຄງການ:
NAME
extractseq - ສະກັດພາກພື້ນຈາກລໍາດັບ
ສະຫຼຸບສັງລວມ
ສານສະກັດຈາກ - ລໍາດັບ ລໍາດັບ - ພາກພື້ນ ລະດັບ [- ແຍກຕ່າງຫາກ ປຸ້ຍ] - outseq ລໍາດັບ
ສານສະກັດຈາກ -ຊ່ວຍ
ລາຍລະອຽດ
ສານສະກັດຈາກ ແມ່ນໂຄງການເສັ້ນຄໍາສັ່ງຈາກ EMBOSS ("The European Molecular Biology Open
Software Suite”). ມັນແມ່ນສ່ວນຫນຶ່ງຂອງ "ແກ້ໄຂ" ກຸ່ມຄໍາສັ່ງ.
OPTIONS
ການປ້ອນຂໍ້ມູນ ສ່ວນ
- ລໍາດັບ ລໍາດັບ
ທີ່ກໍານົດໄວ້ ສ່ວນ
- ພາກພື້ນ ລະດັບ
ພາກພື້ນທີ່ຈະສະກັດ. ຊຸດຂອງພາກພື້ນແມ່ນຖືກກໍານົດໂດຍຊຸດຂອງຄູ່ຕໍາແຫນ່ງ. ໄດ້
ຕຳແໜ່ງແມ່ນຈຳນວນເຕັມ. ພວກມັນຖືກແຍກອອກດ້ວຍຕົວອັກສອນທີ່ບໍ່ແມ່ນຕົວເລກ, ບໍ່ແມ່ນອັກຂະລະ.
ຕົວຢ່າງຂອງສະເພາະພາກພື້ນແມ່ນ: 24-45, 56-78 1:45, 67=99;765..888
1,5,8,10,23,45,57,99 ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: $(sequence.begin)-$(sequence.end)
ເພີ່ມເຕີມ ສ່ວນ
- ແຍກຕ່າງຫາກ ປຸ້ຍ
ຖ້າອັນນີ້ຖືກຕັ້ງເປັນຄວາມຈິງ, ແຕ່ລະຂົງເຂດທີ່ລະບຸຈະຖືກຂຽນອອກເປັນລໍາດັບແຍກຕ່າງຫາກ.
ຊື່ຂອງລໍາດັບແມ່ນສ້າງຂຶ້ນຈາກຊື່ຂອງລໍາດັບຕົ້ນສະບັບທີ່ມີ
ຕໍາແຫນ່ງເລີ່ມຕົ້ນແລະການສິ້ນສຸດຂອງໄລຍະຕໍ່ທ້າຍທີ່ມີຕົວອັກສອນ underscore ລະຫວ່າງພວກເຂົາ,
ຕົວຢ່າງ: XYZ ພາກພື້ນ 2 ຫາ 34 ຖືກຂຽນເປັນ: XYZ_2_34 ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: N
ຜົນຜະລິດ ສ່ວນ
- outseq ລໍາດັບ
ໃຊ້ extractseqe ອອນໄລນ໌ໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net