kmc_tools-complex - ອອນລາຍໃນຄລາວ

ໂຄງການ:

NAME

kmc_tools-complex - ການເຮັດວຽກທີ່ຊັບຊ້ອນດ້ວຍຖານຂໍ້ມູນການປ້ອນຂໍ້ມູນຈຳນວນໜຶ່ງ

ສະຫຼຸບສັງລວມ

kmc_tools complex

ລາຍລະອຽດ

ຄໍາສັ່ງນີ້ປະຕິບັດການປະສົມປະສານຂອງການດໍາເນີນງານຕາມທີ່ກໍານົດໂດຍ
. ມັນເປັນໄຟລ໌ຂໍ້ຄວາມທີ່ມີ syntax ດັ່ງຕໍ່ໄປນີ້:

__________________________________________________________________
|ການປ້ອນຂໍ້ມູນ: |
| = [params] |
| = [params] |
|... |
| = [params] |
| ອອກ: |
| = [ […] |
|[OUTPUT_PARAMS: __|
| ] | /
| | /
|___________________________________________________________________________|/

PARAMETERS

ວັດສະດຸປ້ອນ1, ວັດສະດຸປ້ອນ2, ..., inputN
ຊື່ຂອງວັດສະດຸປ້ອນທີ່ໃຊ້ເພື່ອກໍານົດສົມຜົນ

input1_db_path, input2_db_path, ..., inputN_db_path
ເສັ້ນທາງໄປຫາຊຸດ k-mers

ສໍາລັບການປ້ອນຂໍ້ມູນແຕ່ລະອັນມີຕົວກໍານົດການເພີ່ມເຕີມທີ່ສາມາດກໍານົດໄດ້:

-ci
ຍົກເວັ້ນ k-mers ທີ່ເກີດຂຶ້ນໜ້ອຍກວ່າ ເທື່ອ

cx
ຍົກເວັ້ນ k-mers ທີ່ເກີດຂຶ້ນຫຼາຍກ່ວາ ເທື່ອ

out_db_path
ເສັ້ນທາງໄປສູ່ຖານຂໍ້ມູນຜົນຜະລິດ

ref_input
ຫນຶ່ງໃນ input1, input2, ..., inputN

ການດໍາເນີນງານ
ໜຶ່ງໃນ {*,-,~,+}, ເຊິ່ງໝາຍເຖິງ {intersect, kmers_subtract, counters_subtract,
ສະຫະພັນ}

ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການ '*' ມີບູລິມະສິດສູງສຸດ. ຜູ້ປະກອບການອື່ນໆມີບູລິມະສິດເທົ່າທຽມກັນ. ຄໍາສັ່ງຂອງ
ການດໍາເນີນງານສາມາດປ່ຽນແປງໄດ້ດ້ວຍວົງເລັບ.

ຕົວກໍານົດການອອກ:

-ci
ຍົກເວັ້ນ k-mers ທີ່ເກີດຂຶ້ນໜ້ອຍກວ່າ ເທື່ອ

-cx
ຍົກເວັ້ນ k-mers ທີ່ເກີດຂຶ້ນຫຼາຍກ່ວາ ເທື່ອ

-cs
ຄ່າສູງສຸດຂອງຕົວນັບ

EXAMPLE

__________________________________________________________________
|ການປ້ອນຂໍ້ມູນ: |
|set1 = kmc_o1 -ci5 |
|set2 = kmc_o2|
|set3 = kmc_o3 -ci10 -cx100 __|
| ອອກ: | /
|ຜົນໄດ້ຮັບ=(set3+set1)*set2| /
|___________________________________________________________________________|/

ໃຊ້ kmc_tools-complex ອອນໄລນ໌ ໂດຍໃຊ້ການບໍລິການ onworks.net