ນີ້ແມ່ນຄໍາສັ່ງ kmc_tools ທີ່ສາມາດດໍາເນີນການໄດ້ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີໂດຍໃຊ້ຫນຶ່ງໃນຫຼາຍໆບ່ອນເຮັດວຽກອອນໄລນ໌ຂອງພວກເຮົາເຊັ່ນ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator ຫຼື MAC OS online emulator
ໂຄງການ:
NAME
kmc_tools - ການດໍາເນີນງານເພີ່ມເຕີມໃນຖານຂໍ້ມູນ k-mer
ສະຫຼຸບສັງລວມ
kmc_tools [ຕົວກໍານົດການທົ່ວໂລກ] [ຕົວກໍານົດການການດໍາເນີນງານ]
ລາຍລະອຽດ
ຄໍາສັ່ງນີ້ແລະຄໍາເຫັນຍ່ອຍຕ່າງໆຂອງຕົນປະຕິບັດຈໍານວນຫນຶ່ງຂອງການດໍາເນີນງານກ່ຽວກັບ KMC
ຖານຂໍ້ມູນ.
k-mers ຊຸດ ການດໍາເນີນງານ ສໍາລັບການ 2 KMC ຖານຂໍ້ມູນ
ຕັດກັນ
ຕັດກັນຂອງ 2 k-mers ຊຸດ
kmers_subtract
ການຫັກລົບຂອງ 2 k-mers ຊຸດ
counters_subtract
ການຄິດໄລ່ການຫັກລົບຂອງ 2 k-mer ຊຸດ
ສະຫະພາບ
ສະຫະພັນຂອງ 2 k-mers ຊຸດ
ການດໍາເນີນງານ ສໍາລັບການ ດຽວ kmc ຖານຂໍ້ມູນ
ການຈັດລຽງ
ຈັດຮຽງ k-mers ຈາກຖານຂໍ້ມູນທີ່ສ້າງຂຶ້ນໂດຍ KMC2.x
ຫຼຸດຜ່ອນ
ຍົກເວັ້ນ k-mers ທີ່ຫາຍາກເກີນໄປ ແລະ ເລື້ອຍໆເກີນໄປ
ຫນາແຫນ້ນ
ເອົາເຄົາເຕີອອກ (ເກັບສະເພາະ k-mers)
histogram
histogram ຂອງ ences ທີ່ເກີດຂຶ້ນ k-mers
dump
dump k-mers ແລະ counters ກັບໄຟລ໌ຂໍ້ຄວາມ
ເພີ່ມເຕີມ ສະລັບສັບຊ້ອນ ການປະຕິບັດງານ:
ສະລັບສັບຊ້ອນ
ການດໍາເນີນງານສະລັບສັບຊ້ອນທີ່ມີຈໍານວນຂອງຖານຂໍ້ມູນການປ້ອນຂໍ້ມູນ
ອື່ນໆ ການປະຕິບັດງານ:
ການກັ່ນຕອງ
ກັ່ນຕອງການອ່ານອອກດ້ວຍຈຳນວນ k-mers ນ້ອຍເກີນໄປ
OPTIONS
ທົ່ວໂລກ ພາລາມິເຕີ:
-t
ຈໍານວນທັງຫມົດຂອງກະທູ້ (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: no. ຂອງ CPU cores)
-v
ເປີດໃຊ້ຮູບແບບ verbose (ສະແດງຂໍ້ມູນບາງຢ່າງ) (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: false)
-hp
ເຊື່ອງຄວາມຄືບໜ້າຂອງເປີເຊັນ (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: false)
EXAMPLE
kmc_tools union db1 -ci3 db2 -ci5 -cx300 db1_union_db2 -ci10
ໃຊ້ kmc_tools ອອນໄລນ໌ໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net
