mia-3dmotioncompica-nonrigid - ອອນລາຍໃນຄລາວ

ໂຄງການ:

NAME

mia-3dmotioncompica-nonrigid - ການລົງທະບຽນແບບບໍ່ມີເສັ້ນຂອງຊຸດຮູບພາບ 3 ມິຕິ.

ສະຫຼຸບສັງລວມ

mia-3dmotioncompica-nonrigid -i -o [ທາງເລືອກ]

ລາຍລະອຽດ

mia-3dmotioncompica-nonrigid ໂຄງ​ການ​ນີ້​ປະ​ຕິ​ບັດ​ສະ​ບັບ 3D ຂອງ​ການ​ເຄື່ອນ​ໄຫວ​
ຂັ້ນຕອນການຊົດເຊີຍທີ່ອະທິບາຍໄວ້ໃນ Wollny G, Kellman P, Santos A, Ledesma-Carbayo MJ,
"ການຊົດເຊີຍການເຄື່ອນໄຫວອັດຕະໂນມັດຂອງການຫາຍໃຈຟຣີໄດ້ຮັບຂໍ້ມູນ Myocardial Perfusion ໂດຍ
ການນໍາໃຊ້ການວິເຄາະອົງປະກອບເອກະລາດ", ການວິເຄາະຮູບພາບທາງການແພດ, 2012,
DOI:10.1016/j.media.2012.02.004.

OPTIONS

ໄຟລ໌-IO
-i --in-file=(ການປ້ອນຂໍ້ມູນ, ຕ້ອງການ); ໄອໂອ
ປ້ອນ​ຮູບ​ພາບ​ຂອງ​ຕົວ​ເລກ​ຕິດ​ຕໍ່​ກັນ (nameXXXX.ext) ສໍາ​ລັບ​ການ​ສະ​ຫນັບ​ສະ​ຫນູນ​
ປະເພດໄຟລ໌ເບິ່ງ PLUGINS:3dimage/io

-o --out-file=(ອອກ, ຕ້ອງການ); ໄອໂອ
ຊື່ຮູບພາບອອກ (ເປັນສະຕຣິງຮູບແບບ C ລວມທັງ %04d ເພື່ອກໍານົດ
ໝາຍເລກໄຟລ໌) ສໍາລັບປະເພດໄຟລ໌ທີ່ຮອງຮັບເບິ່ງ PLUGINS:3dimage/io

--save-refs=
ຊ່ວຍ​ປະ​ຢັດ​ຮູບ​ພາບ​ກະ​ສານ​ອ້າງ​ອີງ​, ຊ່ອຍ​ແນ່​ທີ່​ໄດ້​ຮັບ​ການ​ນໍາ​ໃຊ້​ເປັນ​ຖານ​ຊື່​ໄຟລ​໌​, ໄດ້​
ຮູບ​ແບບ​ຈໍາ​ນວນ​ດັ່ງ​ຕໍ່​ໄປ​ນີ້​ຮູບ​ພາບ​ການ​ປ້ອນ​ຂໍ້​ມູນ​, ແລະ​ຮູບ​ແບບ​ຜົນ​ຜະ​ລິດ​ແມ່ນ​ສະ​ເຫມີ​ໄປ​
'ວິ​ໄສ​ທັດ'

--save-regs=
ຊ່ວຍ​ປະ​ຢັດ​ຮູບ​ພາບ​ທີ່​ລົງ​ທະ​ບຽນ​ລະ​ດັບ​ປານ​ກາງ​, ສະ​ຕ​ຣິງ​ທີ່​ໄດ້​ຮັບ​ການ​ນໍາ​ໃຊ້​ເປັນ​ຊື່​ໄຟລ​໌​
ພື້ນຖານ, ຮູບແບບຕົວເລກປະຕິບັດຕາມຮູບພາບການປ້ອນຂໍ້ມູນ, ແລະຮູບແບບຜົນຜະລິດແມ່ນ
ສະເຫມີ 'vista'

--save-coefs=
ບັນທຶກການປະສົມເມທຣິກໃສ່ໄຟລ໌ຂໍ້ຄວາມ

--save-features=
ບັນທຶກຮູບພາບຄຸນສົມບັດເປັນ PNG

ຊ່ວຍເຫຼືອ & ຂໍ້ມູນ
-V --verbose=ຄຳ​ເຕືອນ
verbosity ຂອງ​ຜົນ​ຜະ​ລິດ​, ພິມ​ຂໍ້​ຄວາມ​ຂອງ​ລະ​ດັບ​ທີ່​ໄດ້​ຮັບ​ແລະ​ບູ​ລິ​ມະ​ສິດ​ສູງ​ກວ່າ​.
ບຸລິມະສິດທີ່ສະໜັບສະໜູນໂດຍເລີ່ມຈາກລະດັບຕໍ່າສຸດແມ່ນ:
ຂໍ້ມູນ - ຂໍ້​ຄວາມ​ໃນ​ລະ​ດັບ​ຕ​່​ໍ​າ​
trace - Function ໂທຕິດຕາມ
ບໍ່ - ລາຍ​ງານ​ຄວາມ​ລົ້ມ​ເຫຼວ​ຂອງ​ການ​ທົດ​ສອບ​
ການເຕືອນໄພ - ຄໍາ​ເຕືອນ​
ຄວາມຜິດພາດ - ລາຍ​ງານ​ຄວາມ​ຜິດ​ພາດ​
debug - ຜົນ​ຜະ​ລິດ​ແກ້​ໄຂ​ບັນ​ຫາ​
ຂໍ້ຄວາມ - ຂໍ້​ຄວາມ​ປົກ​ກະ​ຕິ​
ຄວາມຕາຍ - ລາຍ​ງານ​ຄວາມ​ຜິດ​ພາດ​ຕາຍ​ເທົ່າ​ນັ້ນ​

--ລິຂະສິດ
ພິມຂໍ້ມູນລິຂະສິດ

-h --help
ພິມການຊ່ວຍເຫຼືອນີ້

- ? -- ການ​ນໍາ​ໃຊ້​
ພິມການຊ່ວຍເຫຼືອສັ້ນ

- ການປ່ຽນແປງ
ພິມຕົວເລກສະບັບແລະອອກ

ICE
-C --ສ່ວນປະກອບ=0
ອົງປະກອບ ICA 0 = ການຄາດຄະເນອັດຕະໂນມັດ ອົງປະກອບ ICA 0 = ອັດຕະໂນມັດ
ການຄາດຄະເນ

--no-normalize
ບໍ່ປົກກະຕິ ICs

-- ບໍ່ມີທາງອອກ
ຢ່າເອົາຄ່າສະເລ່ຍອອກຈາກເສັ້ນໂຄ້ງປະສົມ

-k --ຂ້າມ=0
ຂ້າມ​ຮູບ​ພາບ​ໃນ​ຕອນ​ຕົ້ນ​ຂອງ​ຊຸດ​ເຊັ່ນ​ເນື່ອງ​ຈາກ​ວ່າ​ພວກ​ເຂົາ​ເຈົ້າ​ແມ່ນ​ຂອງ​ອື່ນໆ​
modalitiesskip ຮູບພາບໃນຕອນຕົ້ນຂອງຊຸດຕົວຢ່າງເຊັ່ນຍ້ອນວ່າພວກເຂົາ
ມີ​ວິ​ທີ​ການ​ອື່ນໆ​

-m --max-ica-iter=400
ຈໍາ​ນວນ​ສູງ​ສຸດ​ຂອງ iterations ໃນ ICA ຈໍາ​ນວນ​ສູງ​ສຸດ​ຂອງ iterations ໃນ ICA​

ການປະມວນຜົນ
--ກະທູ້=-1
ຈໍາ​ນວນ​ສູງ​ສຸດ​ຂອງ​ກະ​ທູ້​ທີ່​ຈະ​ນໍາ​ໃຊ້​ສໍາ​ລັບ​ການ​ປຸງ​ແຕ່ງ​, ຈໍາ​ນວນ​ນີ້​ຄວນ​ຈະ​ຕ​່​ໍ​າ​
ຫຼືເທົ່າກັບຈໍານວນຂອງແກນໂຮງງານຜະລິດຕາມເຫດຜົນໃນເຄື່ອງ. (-1:
ການ​ຄາດ​ຄະ​ເນ​ອັດ​ຕະ​ໂນ​ມັດ​)​.​ຈໍາ​ນວນ​ສູງ​ສຸດ​ຂອງ​ກະ​ທູ້​ທີ່​ຈະ​ນໍາ​ໃຊ້​ສໍາ​ລັບ​ການ​ປຸງ​ແຕ່ງ​, ນີ້​
ຈໍາ​ນວນ​ຄວນ​ຈະ​ຕ​່​ໍ​າ​ຫຼື​ເທົ່າ​ທຽມ​ກັບ​ຈໍາ​ນວນ​ຂອງ​ຫຼັກ​ການ​ປະ​ມວນ​ຜົນ​ທີ່​ມີ​ເຫດ​ຜົນ​ໃນ​
ເຄື່ອງ. (-1: ການຄາດຄະເນອັດຕະໂນມັດ).

ການລົງທະບຽນ
-O --optimizer=gsl:opt=gd,step=0.1
Optimizer ໃຊ້ສໍາລັບການຫຼຸດຫນ້ອຍລົງ

-a --start-c-rate=32
ເລີ່ມອັດຕາ coefficinet ໃນກະດູກສັນຫຼັງ, ຖືກແບ່ງອອກໂດຍ --c-rate-divider ກັບ
ທຸກໆອັດຕາ coefficinet passstart ໃນກະດູກສັນຫຼັງ, ຖືກແບ່ງອອກໂດຍ --c-rate-divider
ກັບທຸກ pass

--c-rate-divider=4
ຕົວແບ່ງອັດຕາຄ່າສຳປະສິດສຳລັບແຕ່ລະຕົວຫານອັດຕາຄ່າສຳປະສິດສຳລັບແຕ່ລະ pass

-d --start-divcurl=20
ເລີ່ມນ້ໍາຫນັກ divcurl, ຖືກແບ່ງອອກໂດຍ --divcurl-divider ກັບທຸກໆ passstart
ນ້ໍາຫນັກ divcurl, ຖືກແບ່ງອອກໂດຍ --divcurl-divider ກັບທຸກ pass

--divcurl-divider=4
ການ​ຂະ​ຫຍາຍ​ຕົວ​ນ​້​ໍາ​ຫນັກ divcurl ກັບ​ການ​ປັບ​ຂະ​ຫນາດ​ນ​້​ໍ​າ passdivcurl ໃຫມ່​ແຕ່​ລະ​ຄົນ​
ຜ່ານໃໝ່

-w --imagecost=image:weight=1,cost=ssd,
ຄ່າ​ໃຊ້​ຈ່າຍ​ຮູບ​ພາບ​

-l --mg-levels=3
ຫຼາຍລະດັບຄວາມລະອຽດຫຼາຍລະດັບ

-P --passes=3
ການລົງທະບຽນ passesregistration passes

ປລັກອິນ: 3dimage/io

ວິເຄາະ ວິເຄາະພາບ 7.5

ນາມສະກຸນໄຟລ໌ທີ່ຮັບຮູ້: .HDR, .hdr

ປະ​ເພດ​ອົງ​ປະ​ກອບ​ສະ​ຫນັບ​ສະ​ຫນູນ​:
unsigned 8 bit, ເຊັນ 16 bit, ເຊັນ 32 bit, floating point 32 bit,
ຈຸດລອຍ 64 bit

ຖານຂໍ້ມູນ Virtual IO ໄປແລະຈາກສະນຸກເກີຂໍ້ມູນພາຍໃນ

ການຂະຫຍາຍໄຟລ໌ທີ່ຮັບຮູ້: .@

ດິຄອມ ຊຸດຮູບພາບ Dicom ເປັນ 3D

ນາມສະກຸນໄຟລ໌ທີ່ຮັບຮູ້: .DCM, .dcm

ປະ​ເພດ​ອົງ​ປະ​ກອບ​ສະ​ຫນັບ​ສະ​ຫນູນ​:
ເຊັນ 16 bit, unsigned 16 bit

hdf5 HDF5 ຮູບ 3D IO

ການຂະຫຍາຍໄຟລ໌ທີ່ຮັບຮູ້: .H5, .h5

ປະ​ເພດ​ອົງ​ປະ​ກອບ​ສະ​ຫນັບ​ສະ​ຫນູນ​:
ຂໍ້ມູນຖານສອງ, ລົງນາມ 8 ບິດ, ບໍ່ໄດ້ເຊັນ 8 ບິດ, ເຊັນ 16 ບິດ, ບໍ່ໄດ້ເຊັນ 16 ບິດ,
ເຊັນ 32 ບິດ, ບໍ່ໄດ້ເຊັນ 32 ບິດ, ເຊັນ 64 ບິດ, ບໍ່ໄດ້ເຊັນ 64 ບິດ, ລອຍ
ຈຸດ 32 ບິດ, ຈຸດລອຍ 64 ບິດ

ອິນເດຍ ຮູບພາບ INRIA

ນາມສະກຸນໄຟລ໌ທີ່ຮັບຮູ້: .INR, .inr

ປະ​ເພດ​ອົງ​ປະ​ກອບ​ສະ​ຫນັບ​ສະ​ຫນູນ​:
ເຊັນ 8 ບິດ, ເຊັນ 8 ບິດ, ເຊັນ 16 ບິດ, ບໍ່ໄດ້ເຊັນ 16 ບິດ, ເຊັນ 32
bit, unsigned 32 bit, floating point 32 bit, floating point 64 bit

mhd MetaIO ຮູບພາບ 3D IO ໂດຍໃຊ້ການປະຕິບັດ VTK (ທົດລອງ).

ນາມສະກຸນໄຟລ໌ທີ່ຮັບຮູ້: .MHA, .MHD, .mha, .mhd

ປະ​ເພດ​ອົງ​ປະ​ກອບ​ສະ​ຫນັບ​ສະ​ຫນູນ​:
ເຊັນ 8 ບິດ, ເຊັນ 8 ບິດ, ເຊັນ 16 ບິດ, ບໍ່ໄດ້ເຊັນ 16 ບິດ, ເຊັນ 32
bit, unsigned 32 bit, floating point 32 bit, floating point 64 bit

nifti NIFTI-1 ຮູບ 3D IO

ນາມສະກຸນໄຟລ໌ທີ່ຮັບຮູ້: .NII, .nii

ປະ​ເພດ​ອົງ​ປະ​ກອບ​ສະ​ຫນັບ​ສະ​ຫນູນ​:
ເຊັນ 8 ບິດ, ເຊັນ 8 ບິດ, ເຊັນ 16 ບິດ, ບໍ່ໄດ້ເຊັນ 16 ບິດ, ເຊັນ 32
bit, unsigned 32 bit, signed 64 bit, unsigned 64 bit, floating point 32
bit, ຈຸດລອຍ 64 bit

vff ຮູບແບບ raster VFF Sun

ການຂະຫຍາຍໄຟລ໌ທີ່ຮັບຮູ້: .VFF, .vff

ປະ​ເພດ​ອົງ​ປະ​ກອບ​ສະ​ຫນັບ​ສະ​ຫນູນ​:
unsigned 8 bit, ເຊັນ 16 bit

vista ມຸມມອງ 3D

ນາມສະກຸນໄຟລ໌ທີ່ຮັບຮູ້: .V, .VISTA, .v, .vista

ປະ​ເພດ​ອົງ​ປະ​ກອບ​ສະ​ຫນັບ​ສະ​ຫນູນ​:
ຂໍ້ມູນຖານສອງ, ລົງນາມ 8 ບິດ, ບໍ່ໄດ້ເຊັນ 8 ບິດ, ເຊັນ 16 ບິດ, ບໍ່ໄດ້ເຊັນ 16 ບິດ,
ເຊັນ 32 bit, unsigned 32 bit, floating point 32 bit, floating point 64
Bit

vti ຮູບພາບ 3D VTK-XML ຢູ່ໃນ- ແລະຜົນຜະລິດ (ທົດລອງ).

ການຂະຫຍາຍໄຟລ໌ທີ່ຮັບຮູ້: .VTI, .vti

ປະ​ເພດ​ອົງ​ປະ​ກອບ​ສະ​ຫນັບ​ສະ​ຫນູນ​:
ເຊັນ 8 ບິດ, ເຊັນ 8 ບິດ, ເຊັນ 16 ບິດ, ບໍ່ໄດ້ເຊັນ 16 ບິດ, ເຊັນ 32
bit, unsigned 32 bit, floating point 32 bit, floating point 64 bit

vtk ຮູບພາບ 3D VTK ຂາເຂົ້າ-ຂາອອກ (ການທົດລອງ).

ນາມສະກຸນໄຟລ໌ທີ່ຮັບຮູ້: .VTK, .VTKIMAGE, .vtk, .vtkimage

ປະ​ເພດ​ອົງ​ປະ​ກອບ​ສະ​ຫນັບ​ສະ​ຫນູນ​:
ຂໍ້ມູນຖານສອງ, ລົງນາມ 8 ບິດ, ບໍ່ໄດ້ເຊັນ 8 ບິດ, ເຊັນ 16 ບິດ, ບໍ່ໄດ້ເຊັນ 16 ບິດ,
ເຊັນ 32 bit, unsigned 32 bit, floating point 32 bit, floating point 64
Bit

EXAMPLE

ລົງທະບຽນຊຸດ perfusion ທີ່ໃຫ້ຢູ່ໃນຮູບພາບ imagesXXXX.v ໂດຍໃຊ້ ICA 4 ຊັ້ນ
ການ​ຄາດ​ຄະ​ເນ​. ຂ້າມສອງຮູບໃນຕອນເລີ່ມຕົ້ນ, ໃຊ້ຫຼາຍທີ່ສຸດ 4 ກະທູ້ລົງທະບຽນ, nlopt
optimizer ອີງໃສ່ແລະຖ້າບໍ່ດັ່ງນັ້ນການນໍາໃຊ້ຕົວກໍານົດການເລີ່ມຕົ້ນ. ເກັບຮັກສາຜົນໄດ້ຮັບໃນ
ລົງທະບຽນXXXX.v

mia-3dmotioncompica-nonrigid -i images0000.v -o ລົງທະບຽນ%04d.v -k 2 -C 4 -t 4 -O
nlopt:opt=ld-var1,xtola=0.001,ftolr=0.001,maxiter=300

ຜູ້ຂຽນ

Gert Wollny

COPYRIGHT

ຊອບແວນີ້ແມ່ນລິຂະສິດ (c) 1999-2015 Leipzig, ເຢຍລະມັນແລະ Madrid, ສະເປນ. ມັນມາ
ໂດຍບໍ່ມີການຮັບປະກັນຢ່າງແທ້ຈິງແລະທ່ານສາມາດແຈກຢາຍມັນຄືນໃຫມ່ພາຍໃຕ້ເງື່ອນໄຂຂອງ GNU
ໃບອະນຸຍາດສາທາລະນະທົ່ວໄປສະບັບ 3 (ຫຼືຫຼັງຈາກນັ້ນ). ສໍາລັບຂໍ້ມູນເພີ່ມເຕີມດໍາເນີນການໂຄງການທີ່ມີ
ທາງເລືອກ '--ລິຂະສິດ'.

ໃຊ້ mia-3dmotioncompica-nonrigid ອອນໄລນ໌ໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net