ນີ້ແມ່ນແອັບ Linux ທີ່ມີຊື່ວ່າ Grinder ເຊິ່ງລຸ້ນຫຼ້າສຸດສາມາດດາວໂຫຼດໄດ້ໃນນາມ Grinder-0.5.4.tar.gz. ມັນສາມາດດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ຢູ່ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີສໍາລັບບ່ອນເຮັດວຽກ.
ດາວນ໌ໂຫລດແລະດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ app ນີ້ມີຊື່ Grinder ກັບ OnWorks ໄດ້ຟຣີ.
ປະຕິບັດຕາມຄໍາແນະນໍາເຫຼົ່ານີ້ເພື່ອດໍາເນີນການ app ນີ້:
- 1. ດາວໂຫຼດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກນີ້ໃນ PC ຂອງທ່ານ.
- 2. ໃສ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 3. ອັບໂຫລດແອັບພລິເຄຊັນນີ້ຢູ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ດັ່ງກ່າວ.
- 4. ເລີ່ມ OnWorks Linux ອອນລາຍ ຫຼື Windows online emulator ຫຼື MACOS online emulator ຈາກເວັບໄຊທ໌ນີ້.
- 5. ຈາກ OnWorks Linux OS ທີ່ເຈົ້າຫາກໍ່ເລີ່ມຕົ້ນ, ໄປທີ່ຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 6. ດາວນ໌ໂຫລດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກ, ຕິດຕັ້ງມັນແລະດໍາເນີນການ.
Grinder
Ad
ລາຍລະອຽດ
Grinder ເປັນເຄື່ອງມື bioinformatic open-source ທີ່ຫຼາກຫຼາຍເພື່ອສ້າງ omic shotgun ແລະຫ້ອງສະຫມຸດລໍາດັບ amplicon simulated ສໍາລັບເວທີການລໍາດັບຕົ້ນຕໍທັງຫມົດ.
ຄຸນລັກສະນະ
- shotgun ຫຼື amplicon (ເຊັ່ນ: 16S rRNA) ອ່ານຫ້ອງສະຫມຸດ
- omics ສະຫນັບສະຫນູນເພື່ອສ້າງຊຸດຂໍ້ມູນ genomic, transcriptomic, proteomic, metaagenomic, metatranscriptomic ຫຼື metaproteomic datasets
- ການແຜ່ກະຈາຍຄວາມຍາວການອ່ານໂດຍຕົນເອງ ແລະຈຳນວນການອ່ານ
- ການຈໍາລອງ PCR ແລະຄວາມຜິດພາດຕາມລໍາດັບ (chimeras, ການປ່ຽນແປງຈຸດ, homopolymers)
- ຮອງຮັບຊຸດຂໍ້ມູນຄູ່ທ້າຍ (ຄູ່ຄູ່).
- ການຕັ້ງຄ່າລະດັບຄວາມອຸດົມສົມບູນສະເພາະ ຫຼືຄວາມອຸດົມສົມບູນທີ່ມອບໃຫ້ດ້ວຍຕົນເອງສໍາລັບແຕ່ລະ genome, gene ຫຼືທາດໂປຼຕີນ
- ການສ້າງຊຸດຂໍ້ມູນທີ່ມີຄວາມອຸດົມສົມບູນໃຫ້ (ຄວາມຫຼາກຫຼາຍອັນຟາ)
- ຊຸດຂໍ້ມູນທີ່ກ່ຽວຂ້ອງສາມາດແບ່ງປັນຈໍານວນຕົວແປຂອງ genomes (ຄວາມຫຼາກຫຼາຍຂອງເບຕ້າ)
- ການສ້າງແບບຈໍາລອງຂອງຄວາມລໍາອຽງທີ່ສ້າງຂຶ້ນໂດຍຄວາມຍາວຂອງ genome ທີ່ແຕກຕ່າງກັນຫຼືຈໍານວນການຄັດລອກ gene
- ກົນໄກໂປຣໄຟລ໌ເພື່ອເກັບຮັກສາຕົວເລືອກທີ່ຕ້ອງການ
- ມີໃຫ້ນັກຊີວະວິທະຍາ ຫຼືຜູ້ໃຊ້ພະລັງງານຜ່ານຫຼາຍການໂຕ້ຕອບ: GUI, CLI ແລະ API
Audience
ວິທະຍາສາດ/ການຄົ້ນຄວ້າ
ໃນການໂຕ້ຕອບຜູ້ໃຊ້
Console/Terminal
ພາສາການຂຽນໂປຣແກຣມ
Perl
ປະເພດ
ນີ້ແມ່ນແອັບພລິເຄຊັນທີ່ຍັງສາມາດເອົາມາຈາກ https://sourceforge.net/projects/biogrinder/. ມັນໄດ້ຖືກຈັດຢູ່ໃນ OnWorks ເພື່ອໃຫ້ດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ໃນວິທີທີ່ງ່າຍທີ່ສຸດຈາກຫນຶ່ງໃນລະບົບປະຕິບັດງານຟຣີຂອງພວກເຮົາ.
