ഡെയ്ൻ - ക്ലൗഡിൽ ഓൺലൈനിൽ

പട്ടിക:

NAME

ഡാൻ - ന്യൂക്ലിക് ആസിഡ് ഉരുകൽ താപനില കണക്കാക്കുന്നു

സിനോപ്സിസ്

ദാൻ - ക്രമം തുടർച്ചയായി - വിൻഡോ വലുപ്പം പൂർണ്ണസംഖ്യ - ഷിഫ്റ്റ് ഇൻക്രിമെൻ്റ് പൂർണ്ണസംഖ്യ -dnaconc ഫ്ലോട്ട്
-saltconc ഫ്ലോട്ട് [-ഉൽപ്പന്നം ടോഗിൾ ചെയ്യുക] -ഫോർമമൈഡ് ഫ്ലോട്ട് -പൊരുത്തക്കേട് ഫ്ലോട്ട് -പ്രൊദ്ലെന് പൂർണ്ണസംഖ്യ
[-തെർമോ ടോഗിൾ ചെയ്യുക] - താപനില ഫ്ലോട്ട് -ആർന ബൂളിയൻ -പ്ലോട്ട് ടോഗിൾ ചെയ്യുക -mintemp ഫ്ലോട്ട്
-ഗ്രാഫ് xygraph - outfile റിപ്പോർട്ട്

ദാൻ -ഹെൽപ്പ്

വിവരണം

ദാൻ EMBOSS-ൽ നിന്നുള്ള ഒരു കമാൻഡ് ലൈൻ പ്രോഗ്രാമാണ് ("യൂറോപ്യൻ മോളിക്യുലാർ ബയോളജി ഓപ്പൺ സോഫ്റ്റ്‌വെയർ
സ്യൂട്ട്"). ഇത് "Nucleic:Properties,Nucleic:Composition" കമാൻഡ് ഗ്രൂപ്പിൻ്റെ(കളുടെ) ഭാഗമാണ്.

ഓപ്ഷനുകൾ

ഇൻപുട്ട് വിഭാഗം
- ക്രമം തുടർച്ചയായി

ആവശ്യമായ വിഭാഗം
- വിൻഡോ വലുപ്പം പൂർണ്ണസംഖ്യ
ദ്രവണാങ്കത്തിൻ്റെ മൂല്യങ്ങളും ക്രമത്തിൻ്റെ മറ്റ് തെർമോഡൈനാമിക് ഗുണങ്ങളും
ഒരു ജാലകം എന്നറിയപ്പെടുന്ന ഒരു ചെറിയ ദൈർഘ്യം എടുത്ത് നിർണ്ണയിക്കുന്നു
ആ വിൻഡോയിലെ ക്രമത്തിൻ്റെ സവിശേഷതകൾ. ജാലകം ക്രമാനുഗതമായി നീക്കുന്നു
ഓരോ പുതിയ സ്ഥാനത്തും കണക്കാക്കുന്ന പ്രോപ്പർട്ടികൾക്കൊപ്പം ക്രമം. സ്ഥിര മൂല്യം: 20

- ഷിഫ്റ്റ് ഇൻക്രിമെൻ്റ് പൂർണ്ണസംഖ്യ
ഓരോ ഇൻക്രിമെൻ്റിലും വിൻഡോ ചലിപ്പിക്കുന്ന തുകയാണിത്
ദ്രവണാങ്കവും മറ്റ് ഗുണങ്ങളും ക്രമത്തിൽ. സ്ഥിര മൂല്യം: 1

-dnaconc ഫ്ലോട്ട്
സ്ഥിര മൂല്യം: 50.

-saltconc ഫ്ലോട്ട്
സ്ഥിര മൂല്യം: 50.

അധികമായ വിഭാഗം
ഉത്പന്നം ഓപ്ഷനുകൾ
-ഉൽപ്പന്നം ടോഗിൾ ചെയ്യുക
ഇത് ശതമാനം ഫോർമൈഡ്, അനുവദനീയമായ പൊരുത്തക്കേടുകളുടെ ശതമാനം, ഉൽപ്പന്ന ദൈർഘ്യം എന്നിവ ആവശ്യപ്പെടുന്നു.

-ഫോർമമൈഡ് ഫ്ലോട്ട്
കണക്കുകൂട്ടലുകളിൽ ഉപയോഗിക്കേണ്ട ഫോർമൈഡിൻ്റെ ശതമാനം ഇത് വ്യക്തമാക്കുന്നു (അല്ലാതെ ഇത് അവഗണിക്കപ്പെടും
- ഉൽപ്പന്നം ഉപയോഗിക്കുന്നു). സ്ഥിര മൂല്യം: 0.

-പൊരുത്തക്കേട് ഫ്ലോട്ട്
കണക്കുകൂട്ടലുകളിൽ ഉപയോഗിക്കേണ്ട ശതമാനം പൊരുത്തക്കേട് ഇത് വ്യക്തമാക്കുന്നു (അല്ലാതെ ഇത് അവഗണിക്കപ്പെടും
- ഉൽപ്പന്നം ഉപയോഗിക്കുന്നു). സ്ഥിര മൂല്യം: 0.

-പ്രൊദ്ലെന് പൂർണ്ണസംഖ്യ
കണക്കുകൂട്ടലുകളിൽ ഉപയോഗിക്കേണ്ട ഉൽപ്പന്ന ദൈർഘ്യം ഇത് വ്യക്തമാക്കുന്നു (അല്ലാതെ ഇത് അവഗണിക്കപ്പെടും
- ഉൽപ്പന്നം ഉപയോഗിക്കുന്നു). സ്ഥിര മൂല്യം: $(വിൻഡോസൈസ്)

തെർമോഡൈനാമിക് ഓപ്ഷനുകൾ
-തെർമോ ടോഗിൾ ചെയ്യുക
ഔട്ട്പുട്ട് ഡാറ്റയിലേക്ക് സീക്വൻസ് വിൻഡോകളുടെ DeltaG, DeltaH, DeltaS മൂല്യങ്ങൾ ഔട്ട്പുട്ട് ചെയ്യുക
ഫയൽ.

- താപനില ഫ്ലോട്ട്
-തെർമോ വ്യക്തമാക്കിയിട്ടുണ്ടെങ്കിൽ, ഏത് താപനിലയാണ് ഇത് വ്യക്തമാക്കുന്നത്
DeltaG, DeltaH, DeltaS മൂല്യങ്ങൾ കണക്കാക്കുക. സ്ഥിര മൂല്യം: 25.

വിപുലമായ വിഭാഗം
-ആർന ബൂളിയൻ
അനുക്രമം ഒരു ആർഎൻഎ സീക്വൻസാണെന്നും ഡിഎൻഎ സീക്വൻസല്ലെന്നും ഇത് വ്യക്തമാക്കുന്നു.

ഔട്ട്പുട്ട് വിഭാഗം
-പ്ലോട്ട് ടോഗിൾ ചെയ്യുക
ഇത് വ്യക്തമാക്കിയിട്ടില്ലെങ്കിൽ, ഔട്ട്പുട്ട് ഡാറ്റയുടെ ഫയൽ നിർമ്മിക്കപ്പെടും, അല്ലെങ്കിൽ ഒരു പ്ലോട്ട്
ക്രമത്തിൽ ദ്രവണാങ്കം ഉത്പാദിപ്പിക്കപ്പെടുന്നു.

-mintemp ഫ്ലോട്ട്
പ്ലോട്ടിൻ്റെ താപനില സ്കെയിലിന് (y-axis) ഏറ്റവും കുറഞ്ഞ മൂല്യം നൽകുക. സ്ഥിര മൂല്യം:
55.

-ഗ്രാഫ് xygraph

- outfile റിപ്പോർട്ട്
ഒരു പ്ലോട്ട് നിർമ്മിക്കപ്പെടുന്നില്ലെങ്കിൽ, ഓരോ വിൻഡോയിലും ദ്രവണാങ്കം മുതലായവയെക്കുറിച്ചുള്ള ഡാറ്റ
ക്രമത്തിൽ ഫയലിലേക്ക് ഔട്ട്പുട്ട് ചെയ്യുന്നു.

onworks.net സേവനങ്ങൾ ഉപയോഗിച്ച് ഡെയ്ൻ ഓൺലൈനായി ഉപയോഗിക്കുക