Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator അല്ലെങ്കിൽ MAC OS ഓൺലൈൻ എമുലേറ്റർ എന്നിങ്ങനെയുള്ള ഞങ്ങളുടെ ഒന്നിലധികം സൗജന്യ ഓൺലൈൻ വർക്ക്‌സ്റ്റേഷനുകളിലൊന്ന് ഉപയോഗിച്ച് OnWorks സൗജന്യ ഹോസ്റ്റിംഗ് ദാതാവിൽ പ്രവർത്തിപ്പിക്കാനാകുന്ന ഫാസ്‌റ്റാക്ക് കമാൻഡ് ആണിത്.
പട്ടിക:
NAME
ഫാസ്‌റ്റാക്ക് - ഫാസ്റ്റയും ഫാസ്‌റ്റ്‌ക്യു ഫയൽ കൃത്രിമത്വവും
സിനോപ്സിസ്
ഫാസ്റ്റഖ് [ഓപ്ഷനുകൾ]
DESCRIPTION0nf
ഒരു കമാൻഡ് ഉപയോഗത്തിന് കുറഞ്ഞ ഉപയോഗം ലഭിക്കുന്നതിന്: fastaq കമാൻഡ്
ഒരു കമാൻഡിനായി പൂർണ്ണ സഹായം ലഭിക്കുന്നതിന് ഇനിപ്പറയുന്നതിൽ ഒന്ന് ഉപയോഗിക്കുക: fastaq കമാൻഡ് -h fastaq കമാൻഡ് --സഹായിക്കൂ
ലഭ്യമായ കമാൻഡുകൾ:
add_indels തന്നിരിക്കുന്ന സ്ഥാനത്ത്(കളിൽ) caf_to_fastq ബേസ് ഇല്ലാതാക്കുകയോ ചേർക്കുകയോ ചെയ്യുന്നു
ഒരു CAF ഫയൽ FASTQ ഫോർമാറ്റിലേക്ക് പരിവർത്തനം ചെയ്യുന്നു capillary_to_pairs കാപ്പിലറിയുടെ ഫയൽ പരിവർത്തനം ചെയ്യുന്നു
ജോടിയാക്കിയതും ജോടിയാക്കാത്തതുമായ ഫയലുകൾ ചങ്കർ വായിക്കുന്നു, ക്രമങ്ങളെ തുല്യമായി വിഭജിക്കുന്നു
വലിപ്പത്തിലുള്ള ചങ്കുകൾ കൗണ്ട്_സീക്വൻസുകൾ ഇൻപുട്ട് ഫയലിലെ സീക്വൻസുകൾ കണക്കാക്കുന്നു
ഇന്റർലീവ്ഡ് ജോടിയാക്കിയ ഫയലിനെ രണ്ട് വ്യത്യസ്ത ഫയലുകളായി വിഭജിക്കുന്നു enumerate_names Renames
ഒരു ഫയലിലെ സീക്വൻസുകൾ, അവയെ 1,2,3... എന്നിങ്ങനെ വിളിക്കുന്നു Expand_nucleotides ഓരോന്നും ഉണ്ടാക്കുന്നു
ഡീജനറേറ്റ് ന്യൂക്ലിയോടൈഡുകളുടെ സംയോജനം fasta_to_fastq FASTA, .qual എന്നിവയിലേക്ക് പരിവർത്തനം ചെയ്യുക
FASTQ ഫിൽട്ടർ സീക്വൻസുകളുടെ ഒരു ഉപവിഭാഗം get_ids ലഭിക്കുന്നതിന് ഫിൽട്ടർ ചെയ്യുക
ഓരോ സീക്വൻസിന്റെയും ഐഡി നേടുക get_seq_flanking_gaps സീക്വൻസുകൾ ഫ്ലാങ്കിംഗ് വിടവുകൾ നേടുന്നു
interleave രണ്ട് ഫയലുകൾ ഇന്റർലീവ് ചെയ്യുന്നു, ഔട്ട്പുട്ട് fwd/rev റീഡുകൾക്കിടയിൽ മാറിമാറി വരുന്നു
make_random_contigs റാൻഡം സീക്വൻസ് മെർജ് കൺവേർട്ടുകൾ ഉണ്ടാക്കുക
മൾട്ടി സീക്വൻസ് ഫയൽ ഒരു സിംഗിൾ സീക്വൻസ് റീപ്ലേസ്_ബേസിലേക്ക് എല്ലാ സംഭവങ്ങളും മാറ്റിസ്ഥാപിക്കുന്നു
ഒരു അക്ഷരത്തിന്റെ മറ്റൊരു റിവേഴ്സ്_കോംപ്ലിമെന്റ് റിവേഴ്സ് കംപ്ലിമെന്റ് എല്ലാ സീക്വൻസുകളും
scaffolds_to_contigs സ്കഫോൾഡ്സ് search_for_seq എന്ന ഫയലിൽ നിന്ന് contigs-ന്റെ ഒരു ഫയൽ സൃഷ്ടിക്കുന്നു
ഒരു സ്‌ട്രിംഗിന്റെ (അതിന്റെ റിവേഴ്സ് കോംപ്ലിമെന്റ്) sequence_trim-ലേക്കുള്ള എല്ലാ കൃത്യമായ പൊരുത്തങ്ങളും കണ്ടെത്തുക
ഓരോ സീക്വൻസിന്റെയും സോർട്ട്_ബൈ_സൈസിന്റെ ആരംഭത്തിൽ നിന്ന് തന്നിരിക്കുന്ന സ്‌ട്രിംഗിലേക്ക് കൃത്യമായ പൊരുത്തങ്ങൾ ട്രിം ചെയ്യുക
സ്പ്ലിറ്റ്_ബൈ_ബേസ്_കൗണ്ട് സ്പ്ലിറ്റ് മൾട്ടി സീക്വൻസ് ഫയലിലേക്ക് നീളമുള്ള ക്രമത്തിൽ സീക്വൻസുകൾ അടുക്കുന്നു
പ്രത്യേക ഫയലുകൾ strip_illumina_suffix സ്ട്രിപ്പുകൾ /1 or /2 വായിക്കുന്ന ഓരോ പേരിന്റെയും അവസാനം
to_boulderio Boulder-IO ഫോർമാറ്റിലേക്ക് പരിവർത്തനം ചെയ്യുന്നു, പ്രൈമർ3 to_fake_qual ഉപയോഗിക്കുന്നു
വ്യാജ ഗുണമേന്മയുള്ള സ്കോറുകൾ ഫയൽ ഉണ്ടാക്കുക to_fasta വൈവിധ്യമാർന്ന ഇൻപുട്ട് ഫോർമാറ്റുകൾ പരിവർത്തനം ചെയ്യുന്നു
മനോഹരമായി ഫോർമാറ്റ് ചെയ്ത ഫാസ്റ്റ ഫോർമാറ്റിലേക്ക് to_mira_xml ഒരു ഫയലിൽ നിന്ന് ഒരു xml ഫയൽ സൃഷ്ടിക്കുക
വായിക്കുന്നു, മിറ അസംബ്ലർ to_orfs_gff ഉപയോഗിച്ച് ഉപയോഗിക്കുന്നതിന് ഓപ്പണിന്റെ ഒരു GFF ഫയൽ എഴുതുന്നു
റീഡിംഗ് ഫ്രെയിമുകൾ to_perfect_reads റഫറൻസിൽ നിന്ന് പെർഫെക്റ്റ് ജോടിയാക്കിയ റീഡുകൾ ഉണ്ടാക്കുക
to_random_subset സീക്വൻസുകളുടെ ക്രമരഹിതമായ സാമ്പിൾ ഉണ്ടാക്കുക (ഒപ്പം ഓപ്ഷണലായി ഇണകളും)
to_tiling_bam ഇൻപുട്ടിലുടനീളം ഒരേപോലെ വ്യാപിച്ചിരിക്കുന്ന റീഡുകളുടെ ഒരു BAM ഫയൽ ഉണ്ടാക്കുക
reference to_unique_by_id ഡ്യൂപ്ലിക്കേറ്റ് സീക്വൻസുകൾ അവയുടെ പേരുകൾ അടിസ്ഥാനമാക്കി നീക്കം ചെയ്യുക. സൂക്ഷിക്കുക
ദൈർഘ്യമേറിയ സെക്‌സ് വിവർത്തനം ചെയ്യുക ഇൻപുട്ട് ന്യൂക്ലിയോടൈഡ് സീക്വൻസുകളിലെ എല്ലാ സീക്വൻസുകളും വിവർത്തനം ചെയ്യുക
trim_Ns_at_end എല്ലാ സീക്വൻസുകളുടെയും ആരംഭത്തിലും അവസാനത്തിലും എല്ലാ N-കളും ട്രിം ചെയ്യുക trim_contigs
എല്ലാ contig trim_ends ന്റെയും അവസാനം ഒരു കൂട്ടം ബേസുകൾ ട്രിം ചെയ്യുന്നു ട്രിം ഫിക്സഡ്
ഓരോ സീക്വൻസ് പതിപ്പിന്റെയും പ്രിന്റ് പതിപ്പിന്റെ ആരംഭത്തിന്റെയും/അല്ലെങ്കിൽ അവസാനത്തിന്റെയും അടിസ്ഥാനങ്ങളുടെ എണ്ണം
നമ്പറും എക്സിറ്റും
onworks.net സേവനങ്ങൾ ഉപയോഗിച്ച് ഫാസ്‌റ്റാക്ക് ഓൺലൈനായി ഉപയോഗിക്കുക
