Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator เด เดฒเตเดฒเตเดเตเดเดฟเตฝ MAC OS เดเตบเดฒเตเตป เดเดฎเตเดฒเตเดฑเตเดฑเตผ เดเดจเตเดจเดฟเดเตเดเดจเตเดฏเตเดณเตเดณ เดเดเตเดเดณเตเดเต เดเดจเตเดจเดฟเดฒเดงเดฟเดเด เดธเตเดเดจเตเดฏ เดเตบเดฒเตเตป เดตเตผเดเตเดเตเดธเตเดฑเตเดฑเตเดทเดจเตเดเดณเดฟเดฒเตเดจเตเดจเต เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเต OnWorks เดธเตเดเดจเตเดฏ เดนเตเดธเตเดฑเตเดฑเดฟเดเดเต เดฆเดพเดคเดพเดตเดฟเตฝ เดชเตเดฐเดตเตผเดคเตเดคเดฟเดชเตเดชเดฟเดเตเดเดพเดตเตเดจเตเดจ เดเดฎเดพเตปเดกเต เดฒเดฟเตปเดธเดฟเดฏเดพเดฃเดฟเดคเต.
เดชเดเตเดเดฟเด:
NAME
mafft - เด เดฎเดฟเดจเต เดเดธเดฟเดกเต เด เดฒเตเดฒเตเดเตเดเดฟเตฝ เดจเตเดฏเตเดเตเดฒเดฟเดฏเตเดเตเดกเต เดธเตเดเตเดตเตปเดธเตเดเตพเดเตเดเดพเดฏเตเดณเตเดณ เดเดจเตเดจเดฟเดฒเดงเดฟเดเด เดตเดฟเดจเตเดฏเดพเดธ เดชเดฐเดฟเดชเดพเดเดฟ
เดธเดฟเดจเตเดชเตเดธเดฟเดธเต
เดฎเดพเดซเตเดฑเตเดฑเต [เดเดชเตเดทเดจเตเดเตพ] เดเตปเดชเตเดเตเดเต [> เดเดเตเดเตเดชเตเดเตเดเต]
เดฒเดฟเตปเดธเดฟ เดเตปเดชเตเดเตเดเต [> เดเดเตเดเตเดชเตเดเตเดเต]
เดเดฟเตปเดธเดฟ เดเตปเดชเตเดเตเดเต [> เดเดเตเดเตเดชเตเดเตเดเต]
เดเตปเดธเดฟ เดเตปเดชเตเดเตเดเต [> เดเดเตเดเตเดชเตเดเตเดเต]
fftnsi เดเตปเดชเตเดเตเดเต [> เดเดเตเดเตเดชเตเดเตเดเต]
fftns เดเตปเดชเตเดเตเดเต [> เดเดเตเดเตเดชเตเดเตเดเต]
nwns เดเตปเดชเตเดเตเดเต [> เดเดเตเดเตเดชเตเดเตเดเต]
nwnsi เดเตปเดชเตเดเตเดเต [> เดเดเตเดเตเดชเตเดเตเดเต]
mafft-เดชเตเดฐเตเดซเตเตฝ เดเตเดฐเตเดเดชเตเดเตเดธเดจเตเดฎเตเดเตเดธ เดเตเดฐเตเดเดชเตเดเตเดธเดจเตเดฎเตเดเตเดธ [> เดเดเตเดเตเดชเตเดเตเดเต]
เดเตปเดชเตเดเตเดเต, เดเตเดฐเตเดเดชเตเดเตเดธเดจเตเดฎเตเดเตเดธ เดเดชเตเดชเด เดเตเดฐเตเดเดชเตเดเตเดธเดจเตเดฎเตเดเตเดธ เดซเดพเดธเตเดฑเตเดฑ เดซเตเตผเดฎเดพเดฑเตเดฑเดฟเตฝ เดเดฏเดฟเดฐเดฟเดเตเดเดฃเด.
เดตเดฟเดตเดฐเดฃเด
MAFFT unix เดชเตเดฒเตเดณเตเดณ เดเดชเตเดชเดฑเตเดฑเตเดฑเดฟเดเดเต เดธเดฟเดธเตเดฑเตเดฑเดเตเดเตพเดเตเดเดพเดฏเตเดณเตเดณ เดเดฐเต เดฎเตพเดเตเดเดฟเดชเตเดชเดฟเตพ เดธเตเดเตเดตเตปเดธเต เด เดฒเตเตปเดฎเตเดจเตเดฑเต เดชเตเดฐเตเดเตเดฐเดพเดฎเดพเดฃเต. เดเดคเต เดตเดพเดเตเดฆเดพเดจเด เดเตเดฏเตเดฏเตเดจเตเดจเต
เดเดจเตเดจเดฟเดฒเดงเดฟเดเด เดตเดฟเดจเตเดฏเดพเดธ เดฐเตเดคเดฟเดเดณเตเดเต เดเดฐเต เดถเตเดฐเตเดฃเดฟ.
เดเตเดคเตเดฏเดค-เด เดงเดฟเดทเตเด เดฟเดค เดฐเตเดคเดฟเดเตพ:
ยท L-INS-i (เดเดฐเตเดชเดเตเดทเต เดเดฑเตเดฑเดตเตเด เดเตเดคเตเดฏเดฎเดพเดฃเต; <200 เดธเตเดเตเดตเตปเดธเตเดเตพเดเตเดเต เดถเตเดชเดพเตผเดถ เดเตเดฏเตเดฏเตเดจเตเดจเต; เดเดตเตผเดคเตเดคเดจ เดชเดฐเดฟเดทเตเดเดฐเดฃเด
เดฒเตเดเตเดเตฝ เดชเตเดฏเตผเดตเตเดธเต เด เดฒเตเตปเดฎเตเดจเตเดฑเต เดตเดฟเดตเดฐเดเตเดเตพ เดเตพเดเตเดเตเดณเตเดณเตเดจเตเดจ เดฐเตเดคเดฟ):
เดฎเดพเดซเตเดฑเตเดฑเต --เดฒเตเดเตเดเตฝ เดชเตเดฏเตผ --เดชเดฐเดฎเดพเดตเดงเดฟ 1000 เดเตปเดชเตเดเตเดเต [> เดเดเตเดเตเดชเตเดเตเดเต]
เดฒเดฟเตปเดธเดฟ เดเตปเดชเตเดเตเดเต [> เดเดเตเดเตเดชเตเดเตเดเต]
ยท G-INS-i (เดธเดฎเดพเดจ เดฆเตเตผเดเตเดฏเดฎเตเดณเตเดณ เดธเตเดเตเดตเตปเดธเตเดเตพเดเตเดเต เด เดจเตเดฏเตเดเตเดฏเด; <200 เดธเตเดเตเดตเตปเดธเตเดเตพเดเตเดเต เดถเตเดชเดพเตผเดถ เดเตเดฏเตเดฏเตเดจเตเดจเต;
เดเดเตเดณ เดชเตเดฏเตผเดตเตเดธเต เด เดฒเตเตปเดฎเตเดจเตเดฑเต เดตเดฟเดตเดฐเดเตเดเตพ เดเตพเดเตเดเตเดณเตเดณเตเดจเตเดจ เดเดตเตผเดคเตเดคเดจ เดชเดฐเดฟเดทเตเดเดฐเดฃ เดฐเตเดคเดฟ):
เดฎเดพเดซเตเดฑเตเดฑเต --เดเตเดฒเตเดฌเตฝ เดชเตเดฏเตผ --เดชเดฐเดฎเดพเดตเดงเดฟ 1000 เดเตปเดชเตเดเตเดเต [> เดเดเตเดเตเดชเตเดเตเดเต]
เดเดฟเตปเดธเดฟ เดเตปเดชเตเดเตเดเต [> เดเดเตเดเตเดชเตเดเตเดเต]
ยท E-INS-i (เดตเดฒเดฟเดฏ เดตเดฟเดจเตเดฏเดธเดฟเดเตเดเดพเดจเดพเดตเดพเดคเตเดค เดชเตเดฐเดฆเตเดถเดเตเดเตพ เด เดเดเตเดเดฟเดฏ เดธเตเดเตเดตเตปเดธเตเดเตพเดเตเดเต เด เดจเตเดฏเตเดเตเดฏเด; เดเดคเดฟเดจเดพเดฏเดฟ เดถเตเดชเดพเตผเดถ เดเตเดฏเตเดฏเตเดจเตเดจเต
<200 เดธเตเดเตเดตเตปเดธเตเดเตพ):
เดฎเดพเดซเตเดฑเตเดฑเต --เดเดชเตเดชเดฟ 0 --genafpair --เดชเดฐเดฎเดพเดตเดงเดฟ 1000 เดเตปเดชเตเดเตเดเต [> เดเดเตเดเตเดชเตเดเตเดเต]
เดเตปเดธเดฟ เดเตปเดชเตเดเตเดเต [> เดเดเตเดเตเดชเตเดเตเดเต]
E-INS-i-เดจเต, the --เดเดชเตเดชเดฟ 0 เดตเดฒเดฟเดฏ เดตเดฟเดเดตเตเดเตพ เด เดจเตเดตเดฆเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเดคเดฟเดจเต เดเดชเตเดทเตป เดถเตเดชเดพเตผเดถ เดเตเดฏเตเดฏเตเดจเตเดจเต.
เดธเตเดชเตเดกเต-เดเดฑเดฟเดฏเดจเตเดฑเดกเต เดฐเตเดคเดฟเดเตพ:
ยท FFT-NS-i (เดเดตเตผเดคเตเดคเดจ เดชเดฐเดฟเดทเตเดเดฐเดฃ เดฐเตเดคเดฟ; เดฐเดฃเตเดเต เดธเตเดเตเดเดฟเดณเตเดเตพ เดฎเดพเดคเตเดฐเด):
เดฎเดพเดซเตเดฑเตเดฑเต --เดฑเดฟเดเตเดฐเต 2 --เดชเดฐเดฎเดพเดตเดงเดฟ 2 เดเตปเดชเตเดเตเดเต [> เดเดเตเดเตเดชเตเดเตเดเต]
fftnsi เดเตปเดชเตเดเตเดเต [> เดเดเตเดเตเดชเตเดเตเดเต]
ยท FFT-NS-i (เดเดตเตผเดคเตเดคเดจ เดชเดฐเดฟเดทเตเดเดฐเดฃ เดฐเตเดคเดฟ; เดชเดฐเดฎเดพเดตเดงเดฟ 1000 เดเดตเตผเดคเตเดคเดจเดเตเดเตพ):
เดฎเดพเดซเตเดฑเตเดฑเต --เดฑเดฟเดเตเดฐเต 2 --เดชเดฐเดฎเดพเดตเดงเดฟ 1000 เดเตปเดชเตเดเตเดเต [> เดเดเตเดเตเดชเตเดเตเดเต]
ยท FFT-NS-2 (เดตเตเดเดคเดฏเตเดณเตเดณ; เดชเตเดฐเตเดเดฎเดจ เดฐเตเดคเดฟ):
เดฎเดพเดซเตเดฑเตเดฑเต --เดฑเดฟเดเตเดฐเต 2 --เดชเดฐเดฎเดพเดตเดงเดฟ 0 เดเตปเดชเตเดเตเดเต [> เดเดเตเดเตเดชเตเดเตเดเต]
fftns เดเตปเดชเตเดเตเดเต [> เดเดเตเดเตเดชเตเดเตเดเต]
ยท FFT-NS-1 (เดตเดณเดฐเต เดตเตเดเดคเตเดคเดฟเตฝ; 2000 เดธเตเดเตเดตเตปเดธเตเดเตพเดเตเดเต เดถเตเดชเดพเตผเดถ เดเตเดฏเตเดฏเตเดจเตเดจเต; เดชเดฐเตเดเตเดเตป เดฐเตเดคเดฟเดฏเดฟเดฒเตเดณเตเดณ เดชเตเดฐเตเดเดฎเดจ เดฐเตเดคเดฟ
เดตเดดเดฟเดเดพเดเตเดเดฟ เดตเตเดเตเดทเด):
เดฎเดพเดซเตเดฑเตเดฑเต --เดฑเดฟเดเตเดฐเต 1 --เดชเดฐเดฎเดพเดตเดงเดฟ 0 เดเตปเดชเตเดเตเดเต [> เดเดเตเดเตเดชเตเดเตเดเต]
ยท NW-NS-i (FFT เดเดเดฆเตเดถเด เดเดฒเตเดฒเดพเดคเต เดเดตเตผเดคเตเดคเดจ เดชเดฐเดฟเดทเตเดเดฐเดฃ เดฐเตเดคเดฟ; เดฐเดฃเตเดเต เดธเตเดเตเดเดฟเดณเตเดเตพ เดฎเดพเดคเตเดฐเด):
เดฎเดพเดซเตเดฑเตเดฑเต --เดฑเดฟเดเตเดฐเต 2 --เดชเดฐเดฎเดพเดตเดงเดฟ 2 --เดจเตเดซเต เดเตปเดชเตเดเตเดเต [> เดเดเตเดเตเดชเตเดเตเดเต]
nwnsi เดเตปเดชเตเดเตเดเต [> เดเดเตเดเตเดชเตเดเตเดเต]
ยท NW-NS-2 (FFT เดเดเดฆเตเดถเด เดเดฒเตเดฒเดพเดคเต เดตเตเดเดคเดฏเตเดณเตเดณ; เดชเตเดฐเตเดเดฎเดจ เดฐเตเดคเดฟ):
เดฎเดพเดซเตเดฑเตเดฑเต --เดฑเดฟเดเตเดฐเต 2 --เดชเดฐเดฎเดพเดตเดงเดฟ 0 --เดจเตเดซเต เดเตปเดชเตเดเตเดเต [> เดเดเตเดเตเดชเตเดเตเดเต]
nwns เดเตปเดชเตเดเตเดเต [> เดเดเตเดเตเดชเตเดเตเดเต]
ยท NW-NS-PartTree-1 (~10,000 เดฎเตเดคเตฝ ~50,000 เดตเดฐเต เดธเตเดเตเดตเตปเดธเตเดเตพเดเตเดเต เดถเตเดชเดพเตผเดถ เดเตเดฏเตเดฏเตเดจเตเดจเต; เดชเตเดฐเตเดเดฎเดจ เดฐเตเดคเดฟ
PartTree เด เตฝเดเตเดฐเดฟเดคเด เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเต):
เดฎเดพเดซเตเดฑเตเดฑเต --เดฑเดฟเดเตเดฐเต 1 --เดชเดฐเดฎเดพเดตเดงเดฟ 0 --เดจเตเดซเต --เดชเดพเตผเดเตเดเตเดเตเดฐเต เดเตปเดชเตเดเตเดเต [> เดเดเตเดเตเดชเตเดเตเดเต]
เดเตเดฐเตเดชเตเดชเต-เดเต-เดเตเดฐเตเดชเตเดชเต เดตเดฟเดจเตเดฏเดพเดธเดเตเดเตพ
mafft-เดชเตเดฐเตเดซเตเตฝ เดเตเดฐเตเดเดชเตเดเตเดธเดจเตเดฎเตเดเตเดธ เดเตเดฐเตเดเดชเตเดเตเดธเดจเตเดฎเตเดเตเดธ [> เดเดเตเดเตเดชเตเดเตเดเต]
เด เดฅเดตเดพ:
เดฎเดพเดซเตเดฑเตเดฑเต --เดชเดฐเดฎเดพเดตเดงเดฟ 1000 --เดตเดฟเดคเตเดคเต เดเตเดฐเตเดเดชเตเดเตเดธเดจเตเดฎเตเดเตเดธ --เดตเดฟเดคเตเดคเต เดเตเดฐเตเดเดชเตเดเตเดธเดจเตเดฎเตเดเตเดธ /dev/null [> เดเดเตเดเตเดชเตเดเตเดเต]
เดเดชเตเดทเดจเตเดเตพ
เด เตฝเดเตเดพเดฐเดฟเดคเด
--เดเดเตเดเต
L-INS-i, FFT-NS-i, FFT-NS-2 เดเดจเตเดจเดฟเดตเดฏเดฟเตฝ เดจเดฟเดจเตเดจเต เด เดจเตเดฏเตเดเตเดฏเดฎเดพเดฏ เดเดฐเต เดคเดจเตเดคเตเดฐเด เดฏเดพเดจเตเดคเตเดฐเดฟเดเดฎเดพเดฏเดฟ เดคเดฟเดฐเดเตเดเตเดเตเดเตเดเตเดจเตเดจเต,
เดกเดพเดฑเตเดฑ เดตเดฒเดฟเดชเตเดชเด เด เดจเตเดธเดฐเดฟเดเตเดเต. เดกเดฟเดซเตเตพเดเตเดเต: เดเดซเต (เดเดฒเตเดฒเดพเดฏเตโเดชเตเดชเตเดดเตเด FFT-NS-2)
--6 เดฎเตเตผเดชเตเดฏเตผ
เดชเดเตเดเดฟเดเตเด 6เดฎเตเดฑเตเดเดณเตเดเต เดเดฃเตเดฃเดคเตเดคเต เด เดเดฟเดธเตเดฅเดพเดจเดฎเดพเดเตเดเดฟเดฏเดพเดฃเต เดฆเตเดฐเด เดเดฃเดเตเดเดพเดเตเดเตเดจเตเดจเดคเต. เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ: เดเตบ
--เดเตเดฒเตเดฌเตฝ เดชเตเดฏเตผ
เดเดฒเตเดฒเดพ เดชเตเดฏเตผเดตเตเดธเต เด เดฒเตเตปเดฎเตเดจเตเดฑเตเดเดณเตเด เดจเตเดกเดฟเตฝเดฎเดพเตป-เดตเตเตบเดทเต เด เตฝเดเตเดฐเดฟเดคเด เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเดพเดฃเต เดเดฃเดเตเดเดพเดเตเดเตเดจเตเดจเดคเต. เดเตเดเตเดคเตฝ
เดเตเดคเตเดฏเดตเตเด เดเดจเตเดจเดพเตฝ เดตเตเดเดค เดเตเดฑเดเตเดเดคเตเด --6merpair. เดเดเตเดณเดคเดฒเดคเตเดคเดฟเตฝ เดตเดฟเดจเตเดฏเดธเดฟเดเตเดเดพเดตเตเดจเตเดจ เดเดฐเต เดเตเดเตเดเดคเตเดคเดฟเดจเต เด เดจเตเดฏเตเดเตเดฏเด
เดเตเดฐเดฎเดเตเดเตพ. ~200 เดธเตเดเตเดตเตปเดธเตเดเตพ เดตเดฐเต เดฌเดพเดงเดเดฎเดพเดฃเต. --maxiterate 1000 เดฎเดพเดฏเดฟ เดเดฐเต เดเตเดฎเตเดชเดฟเดจเตเดทเตป
เดถเตเดชเดพเตผเดถ เดเตเดฏเตเดฏเตเดจเตเดจเต (G-INS-i). เดกเดฟเดซเตเตพเดเตเดเต: เดเดซเต (6 เดฎเตเดฑเตเดฑเตผ เดฆเตเดฐเด เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเต)
--เดฒเตเดเตเดเตฝ เดชเตเดฏเตผ
เดเดฒเตเดฒเดพ เดเตเดกเดฟ เด เดฒเตเตปเดฎเตเดจเตเดฑเตเดเดณเตเด เดธเตเดฎเดฟเดคเตเดคเต-เดตเดพเดเตเดเตผเดฎเดพเตป เด เตฝเดเตเดฐเดฟเดคเด เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเดพเดฃเต เดเดฃเดเตเดเดพเดเตเดเตเดจเตเดจเดคเต. เดเตเดเตเดคเตฝ เดเตเดคเตเดฏเดค
เดเดจเตเดจเดพเตฝ --6merpair-เดจเตเดเตเดเดพเตพ เดตเตเดเดค เดเตเดฑเดตเดพเดฃเต. เดชเตเดฐเดพเดฆเตเดถเดฟเดเดฎเดพเดฏเดฟ เดตเดฟเดจเตเดฏเดธเดฟเดเตเดเดพเดตเตเดจเตเดจ เดเดฐเต เดเตเดเตเดเด เดธเตเดเตเดตเตปเดธเตเดเตพเดเตเดเต เด เดจเตเดฏเตเดเตเดฏเด.
~200 เดธเตเดเตเดตเตปเดธเตเดเตพ เดตเดฐเต เดฌเดพเดงเดเดฎเดพเดฃเต. --maxiterate 1000 เดเดจเตเดจเดคเตเดฎเดพเดฏเตเดณเตเดณ เดธเดเดฏเตเดเดจเดฎเดพเดฃเต
เดถเตเดชเดพเตผเดถ เดเตเดฏเตเดคเดคเต (L-INS-i). เดกเดฟเดซเตเตพเดเตเดเต: เดเดซเต (6 เดฎเตเดฑเตเดฑเตผ เดฆเตเดฐเด เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเต)
--genafpair
เดเดฒเตเดฒเดพ เดชเตเดฏเตผเดตเตเดธเต เด เดฒเตเตปเดฎเตเดจเตเดฑเตเดเดณเตเด เดธเดพเดฎเดพเดจเตเดฏเดตเตฝเดเตเดเดฐเดฟเดเตเด เดเดฐเต เดชเตเดฐเดพเดฆเตเดถเดฟเด เด เตฝเดเตเดฐเดฟเดคเด เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเดพเดฃเต เดเดฃเดเตเดเดพเดเตเดเตเดจเตเดจเดคเต
เด เดซเตเตป เดตเดฟเดเดตเต เดเตเดฒเดตเต (Altschul 1998). --6merpair-เดจเตเดเตเดเดพเตพ เดเตเดเตเดคเตฝ เดเตเดคเตเดฏเดคเดฏเตเดณเตเดณเดคเตเด เดเดจเตเดจเดพเตฝ เดตเตเดเดค เดเตเดฑเดเตเดเดคเตเดฎเดพเดฃเต. เด เดจเตเดฏเตเดเตเดฏเด
เดตเดฒเดฟเดฏ เดเดจเตเดคเดฐเดฟเด เดตเดฟเดเดตเตเดเตพ เดชเตเดฐเดคเตเดเตเดทเดฟเดเตเดเตเดฎเตเดชเตเตพ. ~200 เดธเตเดเตเดตเตปเดธเตเดเตพ เดตเดฐเต เดฌเดพเดงเดเดฎเดพเดฃเต. เด
--maxiterate 1000 เดเดจเตเดจเดคเตเดฎเดพเดฏเตเดณเตเดณ เดธเดเดฏเตเดเดจเดฎเดพเดฃเต เดถเตเดชเดพเตผเดถ เดเตเดฏเตเดฏเตเดจเตเดจเดคเต (E-INS-i). เดกเดฟเดซเตเตพเดเตเดเต: เดเดซเต (6 เดฎเดฟ
เดฆเตเดฐเด เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเต)
--เดซเดพเดธเตเดฑเตเดฑเดชเตเดฏเตผ
เดเดฒเตเดฒเดพ เดชเตเดฏเตผเดตเตเดธเต เด เดฒเตเตปเดฎเตเดจเตเดฑเตเดเดณเตเด เดซเดพเดธเตเดฑเตเดฑ (เดชเดฟเดฏเตเดดเตเดธเดฃเตเด เดฒเดฟเดชเตเดฎเดพเดจเตเด 1988) เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเต เดเดฃเดเตเดเดพเดเตเดเตเดจเตเดจเต. เดซเดพเดธเตเดฑเตเดฑ เดเดฃเต
เดเดตเดถเตเดฏเดฎเดพเดฃเต. เดกเดฟเดซเตเตพเดเตเดเต: เดเดซเต (6 เดฎเตเดฑเตเดฑเตผ เดฆเตเดฐเด เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเต)
--เดตเตเดฏเตเดฑเตเดฑเดฟ เด เดเตเดเด
เดชเตเดฏเตผเดตเตเดธเต เด เดฒเตเตปเดฎเตเดจเตเดฑเตเดเดณเดฟเตฝ เดจเดฟเดจเตเดจเต เดเดฃเดเตเดเดพเดเตเดเดฟเดฏ เดธเตเดฅเดฟเดฐเดค เดเดพเดฒเดพเดตเดงเดฟเดเตเดเตเดณเตเดณ เดตเตเดฏเตเดฑเตเดฑเดฟเดเดเต เดเดเดเด. เดธเดพเดงเตเดตเดพเดฃเต
เดเดชเตเดชเตเตพ --เดเตเดฒเตเดฌเตฝเดชเตเดฏเตผ, --เดฒเตเดเตเดเตฝเดชเตเดฏเตผ, --เดเตเดจเดพเดซเตเดชเตเดฏเตผ, --เดซเดพเดธเตเดฑเตเดฑเดชเตเดฏเตผ เด เดฒเตเดฒเตเดเตเดเดฟเตฝ --เดฌเตเดฒเดพเดธเตเดฑเตเดฑเตเดชเตเดฏเตผ
เดคเดฟเดฐเดเตเดเตเดเตเดคเตเดคเต. เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ: 2.7
--เดฑเดฟเดเตเดฐเต เด เดเตเดเด
เดเตเดกเต เดเตเดฐเต เดจเดฟเตผเดฎเตเดฎเดฟเดเตเดเดฟเดฐเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเต เด เดเตเดเด เดชเตเดฐเตเดเดฎเดจ เดเดเตเดเดคเตเดคเดฟเดฒเต เดธเดฎเดฏเด. 6 เดฎเตเดฑเตเดฑเตผ เดฆเตเดฐเดคเตเดคเดฟเตฝ เดธเดพเดงเตเดคเดฏเตเดฃเตเดเต.
เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ: 2
--เดชเดฐเดฎเดพเดตเดงเดฟ เด เดเตเดเด
เด เดเตเดเด เดเดตเตผเดคเตเดคเดจ เดถเตเดฆเตเดงเตเดเดฐเดฃ เดเดเตเดฐเดเตเดเตพ เดจเดเดคเตเดคเตเดจเตเดจเต. เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ: 0
--ft
เดเตเดฐเตเดชเตเดชเต-เดเต-เดเตเดฐเตเดชเตเดชเต เดตเดฟเดจเตเดฏเดพเดธเดคเตเดคเดฟเตฝ FFT เดเดเดฆเตเดถเด เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเตเด. เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ: เดเตบ
--เดจเตเดซเต
เดเตเดฐเตเดชเตเดชเต-เดเต-เดเตเดฐเตเดชเตเดชเต เดตเดฟเดจเตเดฏเดพเดธเดคเตเดคเดฟเตฝ FFT เดเดเดฆเตเดถเด เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเดฐเตเดคเต. เดกเดฟเดซเตเตพเดเตเดเต: เดเดซเต
--เดจเตเดธเตเดเตเตผ
เดเดตเตผเดคเตเดคเดจ เดชเดฐเดฟเดทเตเดเดฐเดฃ เดเดเตเดเดคเตเดคเดฟเตฝ เด เดฒเตเตปเดฎเตเดจเตเดฑเต เดธเตเดเตเตผ เดชเดฐเดฟเดถเตเดงเดฟเดเตเดเดฟเดเตเดเดฟเดฒเตเดฒ. เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ: เดเดซเต (เดธเตเดเตเตผ
เดชเดฐเดฟเดถเตเดงเดฟเดเตเดเต)
--เดฎเตเดเดธเตเดตเต
Myers-Miller (1988) เด เตฝเดเตเดฐเดฟเดคเด เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเตเด. เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ: เดเดชเตเดชเตเตพ เดฏเดพเดจเตเดคเตเดฐเดฟเดเดฎเดพเดฏเดฟ เดเดฃเดพเดเตเดเตเดจเตเดจเต
เดตเดฟเดจเตเดฏเดพเดธ เดฆเตเตผเดเตเดฏเด 10,000 (aa/nt) เดเดตเดฟเดฏเตเดจเตเดจเต.
--เดชเดพเตผเดเตเดเตเดเตเดฐเต
2007 เดฎเตเดฑเตเดฑเตผ เดฆเตเดฐเดคเตเดคเดฟเตฝ เดตเตเดเดคเตเดคเดฟเตฝ เดเตเดฐเต-เดจเดฟเตผเดฎเตเดฎเดพเดฃ เดฐเตเดคเดฟ เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเตเด (PartTree, Katoh and Toh 6).
เดเดฐเต เดตเดฒเดฟเดฏ เดเดฃเตเดฃเด (> ~10,000) เดธเตเดเตเดตเตปเดธเตเดเตพ เดเตปเดชเตเดเตเดเต เดเตเดฏเตเดฏเดพเตป เดถเตเดชเดพเตผเดถ เดเตเดฏเตเดฏเตเดจเตเดจเต. เดกเดฟเดซเตเตพเดเตเดเต: เดเดซเต
--dpparttree
เดกเดฟเดชเดฟเดฏเต เด เดเดฟเดธเตเดฅเดพเดจเดฎเดพเดเตเดเดฟเดฏเตเดณเตเดณ เดฆเตเดฐเดเตเดเตพเดเตเดเตเดชเตเดชเด PartTree เด เตฝเดเตเดฐเดฟเดคเด เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเต. เดเตเดฑเดเตเดเตเดเตเดเดฟ เดเตเดคเตเดฏเดตเตเด
--parttree-เดจเตเดเตเดเดพเตพ เดชเดคเตเดเตเดเต. เดเดฐเต เดตเดฒเดฟเดฏ เดธเดเดเตเดฏ (> ~10,000) เดธเตเดเตเดตเตปเดธเตเดเตพเดเตเดเดพเดฏเดฟ เดถเตเดชเดพเตผเดถ เดเตเดฏเตเดฏเตเดจเตเดจเต
เดเตปเดชเตเดเตเดเต. เดกเดฟเดซเตเตพเดเตเดเต: เดเดซเต
--เดซเดพเดธเตเดฑเตเดฑเตเดชเดพเตผเดเตเดเตเดเตเดฐเต
เดซเดพเดธเตเดฑเตเดฑเดฏเต เด เดเดฟเดธเตเดฅเดพเดจเดฎเดพเดเตเดเดฟเดฏเตเดณเตเดณ เดฆเตเดฐเดเตเดเตพเดเตเดเตเดชเตเดชเด PartTree เด เตฝเดเตเดฐเดฟเดคเด เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเต. เดเตเดฑเดเตเดเตเดเตเดเดฟ เดเตเดคเตเดฏเดค
--parttree-เดจเตเดเตเดเดพเตพ เดตเตเดเดค เดเตเดฑเดตเดพเดฃเต. เดเดฐเต เดตเดฒเดฟเดฏ เดธเดเดเตเดฏ (> ~10,000) เดธเตเดเตเดตเตปเดธเตเดเตพเดเตเดเดพเดฏเดฟ เดถเตเดชเดพเตผเดถ เดเตเดฏเตเดฏเตเดจเตเดจเต
เดเตปเดชเตเดเตเดเต เดเดเตเดจเตเดจเต. เดซเดพเดธเตเดฑเตเดฑ เดเดตเดถเตเดฏเดฎเดพเดฃเต. เดกเดฟเดซเตเตพเดเตเดเต: เดเดซเต
--partsize เด เดเตเดเด
PartTree เด เตฝเดเตเดฐเดฟเดคเดคเตเดคเดฟเดฒเต เดชเดพเตผเดเตเดเตเดทเดจเตเดเดณเตเดเต เดเดฃเตเดฃเด. เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ: 50
--เดเตเดฐเตเดชเตเดชเตเดธเตเดธเต เด เดเตเดเด
เด เดฒเตเตปเดฎเตเดจเตเดฑเต เดตเดฒเตเดคเดพเดเตเดเดฐเตเดคเต เด เดเตเดเด เดเตเดฐเดฎเดเตเดเตพ. --*เดชเดพเตผเดเตเดเตเดเตเดฐเตเดฏเตโเดเตเดเต เดฎเดพเดคเตเดฐเดฎเต เดธเดพเดงเตเดคเดฏเตเดณเตเดณเต
เดเดชเตเดทเดจเตเดเตพ. เดกเดฟเดซเตเตพเดเตเดเต: เดเตปเดชเตเดเตเดเต เดธเตเดเตเดตเตปเดธเตเดเดณเตเดเต เดเดฃเตเดฃเด
เดชเดพเดฐเดพเดฎเตเดฑเตเดฑเตผ
--op เด เดเตเดเด
เดเตเดฐเตเดชเตเดชเต-เดเต-เดเตเดฐเตเดชเตเดชเต เดตเดฟเดจเตเดฏเดพเดธเดคเตเดคเดฟเตฝ เดเตเดฏเดพเดชเตเดชเต เดเดชเตเดชเดฃเดฟเดเดเต เดชเตเดจเดพเตฝเดฑเตเดฑเดฟ. เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ: 1.53
--เดเดชเตเดชเดฟ เด เดเตเดเด
เดเตเดฐเตเดชเตเดชเต-เดเต-เดเตเดฐเตเดชเตเดชเต เด เดฒเตเตปเดฎเตเดจเตเดฑเดฟเดจเดพเดฏเดฟ, เดเตเดฏเดพเดชเตเดชเต เดเดเตเดธเตเดฑเตเดฑเตปเดทเตป เดชเตเดจเดพเตฝเดฑเตเดฑเดฟ เดชเตเดฒเต เดชเตเดฐเดตเตผเดคเตเดคเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจ เดเดซเตเดธเตเดฑเตเดฑเต เดฎเตเดฒเตเดฏเด.
เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ: 0.123
--เดฒเตเดชเตเดชเต เด เดเตเดเด
เดฒเตเดเตเดเตฝ เดชเตเดฏเตผเดตเตเดธเต เด เดฒเตเตปเดฎเตเดจเตเดฑเดฟเตฝ เดเตเดฏเดพเดชเตเดชเต เดเดชเตเดชเดฃเดฟเดเดเต เดชเตเดจเดพเตฝเดฑเตเดฑเดฟ. --เดฒเตเดเตเดเตฝเดชเตเดฏเตผ เด เดฒเตเดฒเตเดเตเดเดฟเตฝ
--genafpair เดเดชเตเดทเตป เดคเดฟเดฐเดเตเดเตเดเตเดคเตเดคเต. เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ: -2.00
--เดฒเตเดชเต เด เดเตเดเด
เดฒเตเดเตเดเตฝ เดชเตเดฏเตผเดตเตเดธเต เด เดฒเตเตปเดฎเตเดจเตเดฑเดฟเตฝ เดเดซเตเดธเตเดฑเตเดฑเต เดฎเตเดฒเตเดฏเด. --localpair เด เดฒเตเดฒเตเดเตเดเดฟเตฝ --genafpair เดเดฏเดฟเดฐเดฟเดเตเดเตเดฎเตเดชเตเตพ เดธเดพเดงเตเดคเดฏเตเดฃเตเดเต
เดเดชเตเดทเตป เดคเดฟเดฐเดเตเดเตเดเตเดคเตเดคเต. เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ: 0.1
--lexp เด เดเตเดเด
เดฒเตเดเตเดเตฝ เดชเตเดฏเตผเดตเตเดธเต เด เดฒเตเตปเดฎเตเดจเตเดฑเดฟเตฝ เดเตเดฏเดพเดชเตเดชเต เดเดเตเดธเตเดฑเตเดฑเตปเดทเตป เดชเตเดจเดพเตฝเดฑเตเดฑเดฟ. --เดฒเตเดเตเดเตฝเดชเตเดฏเตผ เด เดฒเตเดฒเตเดเตเดเดฟเตฝ
--genafpair เดเดชเตเดทเตป เดคเดฟเดฐเดเตเดเตเดเตเดคเตเดคเต. เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ: -0.1
--LOP เด เดเตเดเด
เด เดฒเตเตปเดฎเตเดจเตเดฑเต เดเดดเดฟเดตเดพเดเตเดเดพเดจเตเดณเตเดณ เดเตเดฏเดพเดชเตเดชเต เดเดชเตเดชเดฃเดฟเดเดเต เดชเตเดจเดพเตฝเดฑเตเดฑเดฟ. --genafpair เดเดชเตเดทเตป เดเดฏเดฟเดฐเดฟเดเตเดเตเดฎเตเดชเตเตพ เดธเดพเดงเตเดคเดฏเตเดฃเตเดเต
เดคเดฟเดฐเดเตเดเตเดเตเดคเตเดคเต. เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ: -6.00
--เดฒเตเดเตเดธเตเดชเดฟ เด เดเตเดเด
เด เดฒเตเตปเดฎเตเดจเตเดฑเต เดเดดเดฟเดตเดพเดเตเดเดพเดจเตเดณเตเดณ เดเตเดฏเดพเดชเตเดชเต เดเดเตเดธเตเดฑเตเดฑเตปเดทเตป เดชเตเดจเดพเตฝเดฑเตเดฑเดฟ. --genafpair เดเดชเตเดทเตป เดเดฏเดฟเดฐเดฟเดเตเดเตเดฎเตเดชเตเตพ เดธเดพเดงเตเดคเดฏเตเดฃเตเดเต
เดคเดฟเดฐเดเตเดเตเดเตเดคเตเดคเต. เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ: 0.00
--bl เด เดเตเดเด
เดฌเตเดฒเตเดธเด เด เดเตเดเด เดฎเดพเดเตเดฐเดฟเดเตเดธเต (Henikoff and Henikoff 1992) เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเต. เด เดเตเดเด=30, 45, 62 เด เดฒเตเดฒเตเดเตเดเดฟเตฝ 80.
เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ: 62
--jtt เด เดเตเดเด
JTT PAM เด เดเตเดเด (Jones et al. 1992) เดฎเดพเดเตเดฐเดฟเดเตเดธเต เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเต. เด เดเตเดเด>0. เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ: BLOSUM62
--เดเดฟเดเด เด เดเตเดเด
เดเตเดฐเดพเตปเดธเตเดฎเตเดเดฌเตเดฐเตเตป PAM เด เดเตเดเด (Jones et al. 1994) เดฎเดพเดเตเดฐเดฟเดเตเดธเต เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเต. เด เดเตเดเด>0. เดกเดฟเดซเตเตพเดเตเดเต:
BLOSUM62
--เด เดฎเดพเดเตเดฐเดฟเดเตเดธเต เดฎเดพเดเตเดฐเดฟเดเตเดธเต เดซเดฏเตฝ
เดเดชเดฏเตเดเตเดคเดพเดตเต เดจเดฟเตผเดตเดเดฟเดเตเด AA เดธเตโเดเตเดฑเดฟเดเดเต เดฎเดพเดเตเดฐเดฟเดเตโเดธเต เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเตเด. เดเดจเตเดจ เดซเตเตผเดฎเดพเดฑเตเดฑเต เดฎเดพเดเตเดฐเดฟเดเตเดธเต เดซเดฏเตฝ เดเดจเตเดจเดคเดฟเดจเต เดธเดฎเดพเดจเดฎเดพเดฃเต
เดธเตเดซเตเดเดจเด. เดจเตเดฏเตเดเตเดฒเดฟเดฏเตเดเตเดกเต เดธเตเดเตเดตเตปเดธเตเดเตพ เดเตปเดชเตเดเตเดเต เดเตเดฏเตเดฏเตเดฎเตเดชเตเตพ เด เดตเดเดฃเดฟเดเตเดเดชเตเดชเตเดเตเด. เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ: BLOSUM62
--fmodel
เดธเตโเดเตเดฑเดฟเดเดเต เดฎเดพเดเตเดฐเดฟเดเตโเดธเดฟเตฝ AA/nuc เดเตเดฎเตเดชเตเดธเดฟเดทเตป เดตเดฟเดตเดฐเดเตเดเตพ เดเตพเดชเตเดชเตเดเตเดคเตเดคเตเด. เดกเดฟเดซเตเตพเดเตเดเต: เดเดซเต
เดเดเตเดเตเดชเตเดเตเดเต
--เดเตเดฒเดธเตเดฑเตเดฑเดฒเตเดเตเดเต
เดเดเตเดเตเดชเตเดเตเดเต เดซเตเตผเดฎเดพเดฑเตเดฑเต: เดเตเดฒเดธเตเดฑเตเดฑเตฝ เดซเตเตผเดฎเดพเดฑเตเดฑเต. เดกเดฟเดซเตเตพเดเตเดเต: เดเดซเต (เดซเดพเดธเตเดฑเตเดฑ เดซเตเตผเดฎเดพเดฑเตเดฑเต)
--เดเตปเดชเตเดเตเดเตผเดกเตผ
เดเดเตเดเตเดชเตเดเตเดเต เดเตผเดกเตผ: เดเตปเดชเตเดเตเดเต เดชเตเดฒเต เดคเดจเตเดจเต. เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ: เดเตบ
--เดชเตเดจเดเดเตเดฐเดฎเตเดเดฐเดฟเดเตเดเตเด
เดเดเตเดเตเดชเตเดเตเดเต เดเตผเดกเตผ: เดตเดฟเดจเตเดฏเดธเดฟเดเตเดเต. เดกเดฟเดซเตเตพเดเตเดเต: เดเดซเต (เดเตปเดชเตเดเตเดเตเดเตผเดกเตผ)
--เดเตเดฐเตเดเดเตเดเต
เดเตเดกเต เดเตเดฐเต เดเดเตเดเตเดชเตเดเตเดเต เดเดฃเต เดเตปเดชเตเดเตเดเต.เดเตเดฐเต เดซเดฏเตฝ. เดกเดฟเดซเตเตพเดเตเดเต: เดเดซเต
--เดจเดฟเดถเดฌเตเดฆเดฎเดพเดฏเดฟ
เดชเตเดฐเตเดเดคเดฟ เดฑเดฟเดชเตเดชเตเตผเดเตเดเต เดเตเดฏเตเดฏเดฐเตเดคเต. เดกเดฟเดซเตเตพเดเตเดเต: เดเดซเต
เดเตปเดชเตเดเตเดเต
--nuc
เดธเตเดเตเดตเตปเดธเตเดเตพ เดจเตเดฏเตเดเตเดฒเดฟเดฏเตเดเตเดกเต เดเดฃเตเดจเตเดจเต เดเดฐเตเดคเตเด. เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ: เดเดเตเดเต
--เด เดฎเดฟเดจเต
เดธเตเดเตเดตเตปเดธเตเดเตพ เด เดฎเดฟเดจเต เดเดธเดฟเดกเต เดเดฃเตเดจเตเดจเต เดเดฐเตเดคเตเด. เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ: เดเดเตเดเต
--เดตเดฟเดคเตเดคเต เดตเดฟเดจเตเดฏเดพเดธเด1 [--เดตเดฟเดคเตเดคเต เดตเดฟเดจเตเดฏเดพเดธเด2 --เดตเดฟเดคเตเดคเต เดตเดฟเดจเตเดฏเดพเดธเด3 ...]
เดตเดฟเดคเตเดคเต เดตเดฟเดจเตเดฏเดพเดธเด เดจเตฝเดเดฟเดฏเดฟเดฐเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเต เดตเดฟเดจเตเดฏเดพเดธเด_n (เดซเดพเดธเตเดฑเตเดฑ เดซเตเตผเดฎเดพเดฑเตเดฑเต) เดธเตเดเตเดตเตปเดธเตเดเดณเตเดฎเดพเดฏเดฟ เดตเดฟเดจเตเดฏเดธเดฟเดเตเดเดฟเดฐเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเต
เดเตปเดชเตเดเตเดเต. เดเดฐเต เดตเดฟเดคเตเดคเดฟเดจเดเดคเตเดคเตเด เดตเดฟเดจเตเดฏเดพเดธเด เดธเดเดฐเดเตเดทเดฟเดเตเดเดชเตเดชเตเดเตเดจเตเดจเต.
onworks.net เดธเตเดตเดจเดเตเดเตพ เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเต เดฒเดฟเตปเดธเดฟ เดเตบเดฒเตเดจเดพเดฏเดฟ เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเตเด