lutefisk - ക്ലൗഡിൽ ഓൺലൈനിൽ

പട്ടിക:

NAME

lutefisk - പെപ്റ്റൈഡ് CID സ്പെക്ട്രയുടെ ഡി നോവോ വ്യാഖ്യാനത്തിനുള്ള സോഫ്റ്റ്‌വെയർ

സിനോപ്സിസ്

lutefisk [-q ] [ -m ] [ -d] [ -p ] [ -r ] [ -s ] [ -v] [ -h] [-o ]

വിവരണം

lutefisk പെപ്റ്റൈഡ് സിഐഡി സ്പെക്ട്രയുടെ ഡി നോവോ വ്യാഖ്യാനത്തിനുള്ള ഒരു സോഫ്റ്റ്‌വെയർ ആണ്. അതെടുക്കും
പെപ്റ്റൈഡ് CID ഡാറ്റയും ചില അനുബന്ധ ഡാറ്റ ഫയലുകളും (അതിൽ ലൊക്കേഷൻ വ്യക്തമാക്കിയിരിക്കുന്നു
കമാൻഡ് ലൈൻ) കൂടാതെ എല്ലാ സീക്വൻസുകളും സാങ്കൽപ്പികമായി അടങ്ങുന്ന ഫലങ്ങളുടെ ഫയൽ ഔട്ട്പുട്ട് ചെയ്യുന്നു
CID ഡാറ്റയുമായി പൊരുത്തപ്പെടുന്നു.

നിങ്ങൾ വിളിക്കുമ്പോൾ lutefisk കൂടെ -h ഓപ്ഷൻ, പ്രോഗ്രാം എല്ലാം കമാൻഡ് ലൈനിലേക്ക് ലിസ്റ്റ് ചെയ്യുന്നു
ലഭ്യമായ ഓപ്ഷനുകൾ.

ഓപ്ഷനുകൾ

-h ഓപ്ഷനുകളുടെ ഒരു ലിസ്റ്റ് പ്രിന്റ് ചെയ്യുക

-q നിശബ്ദ മോഡിൽ പ്രവർത്തിപ്പിക്കുക

-m മുൻഗാമി അയോൺ പിണ്ഡം

-d വിശദാംശ ഫയലിലേക്കുള്ള പാതയുടെ പേര്

-p params ഫയലിലേക്കുള്ള പാതയുടെ പേര്

-r അവശിഷ്ടങ്ങളുടെ ഫയലിലേക്കുള്ള പാതയുടെ പേര്

-s സ്കോർ ചെയ്യാനുള്ള ഡാറ്റാബേസ് സീക്വൻസുകളുള്ള ഫയലിന്റെ പാതയുടെ പേര്

-v വെർബോസ് മോഡിൽ പ്രവർത്തിപ്പിക്കുക

-o ഔട്ട്പുട്ട് ഫയൽ


CID ഡാറ്റ ഫയൽ

പ്രോഗ്രാം ഡാറ്റ

പ്രോഗ്രാം പ്രവർത്തിപ്പിക്കുന്നതിന് ആവശ്യമായ ഡാറ്റ സ്ഥിതിചെയ്യുന്നു /usr/share/lutefisk.

ഉദാഹരണം ഡാറ്റ

ഉദാഹരണ ഡാറ്റ സ്ഥിതി ചെയ്യുന്നത് /usr/share/doc/lutefisk/ഉദാഹരണങ്ങൾ.

ഗ്രന്ഥസൂചിക അവലംബം TO BE ഉദ്ധരിച്ചിരിക്കുന്നത്

RS ജോൺസണും JA ടെയ്‌ലറും (2002) "ഡി നോവോ പെപ്റ്റൈഡ് വഴിയുള്ള സീക്വൻസ് ഡാറ്റാബേസുകൾ തിരയുന്നു
സീക്വൻസിങ് ബൈ ടാൻഡം മാസ് സ്പെക്ട്രോമെട്രി", മോൾ. ബയോടെക്നോളജി വാല്യം. 22, നമ്പർ 3. (നവംബർ
2002), പേജ്. 301-315.

JA ടെയ്‌ലറും RS ജോൺസണും (2000) "ഓട്ടോമേറ്റഡ് ഡി നോവോയുടെ നടപ്പാക്കലും ഉപയോഗവും
പെപ്റ്റൈഡ് സീക്വൻസിങ് ബൈ ടാൻഡം മാസ് സ്പെക്ട്രോമെട്രി". അനൽ. കെം. 73:2594-2604.

RS ജോൺസണും JA ടെയ്‌ലറും (2000) "ഡി നോവോ പെപ്റ്റൈഡ് വഴിയുള്ള സീക്വൻസ് ഡാറ്റാബേസുകൾ തിരയുന്നു
ടാൻഡം മാസ് സ്പെക്ട്രോമെട്രിയുടെ ക്രമം", "പ്രോട്ടീൻ ആൻഡ് പെപ്റ്റൈഡ് വിശകലനം: പുരോഗതി
മാസ് സ്പെക്ട്രോമെട്രിയുടെ ഉപയോഗം", 146:41-61 (മോളിക്യുലർ ബയോളജി സീരീസിലെ രീതികൾ, ഹ്യൂമാന പ്രസ്സ്).

ജെ എ ടെയ്‌ലറും ആർ എസ് ജോൺസണും (1997) "ഡി നോവോ പെപ്റ്റൈഡ് വഴിയുള്ള ഡാറ്റാബേസ് തിരയലുകൾ
ടാൻഡം മാസ് സ്പെക്ട്രോമെട്രിയുടെ ക്രമം". റാപ്പിഡ് കോം. മാസ് സ്പെക്. 11:1067-1075.

onworks.net സേവനങ്ങൾ ഉപയോഗിച്ച് lutefisk ഓൺലൈനായി ഉപയോഗിക്കുക