Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator അല്ലെങ്കിൽ MAC OS ഓൺലൈൻ എമുലേറ്റർ എന്നിങ്ങനെയുള്ള ഞങ്ങളുടെ ഒന്നിലധികം സൗജന്യ ഓൺലൈൻ വർക്ക്സ്റ്റേഷനുകളിലൊന്ന് ഉപയോഗിച്ച് OnWorks സൗജന്യ ഹോസ്റ്റിംഗ് ദാതാവിൽ പ്രവർത്തിപ്പിക്കാവുന്ന miconv കമാൻഡ് ഇതാണ്.
പട്ടിക:
NAME
miconv - ഫോർമാറ്റുകൾക്കിടയിൽ മെഡിക്കൽ ഇമേജ് ഡാറ്റ പരിവർത്തനം ചെയ്യുന്നു.
സിനോപ്സിസ്
miconv [ഓപ്ഷനുകൾ] []
വിവരണം
miconv: ഫോർമാറ്റുകൾക്കിടയിൽ മെഡിക്കൽ ഇമേജ് ഡാറ്റ പരിവർത്തനം ചെയ്യുന്നു.
ഫയൽ ഫോർമാറ്റുകൾ അവയുടെ ഫയൽ എക്സ്റ്റൻഷൻ വഴി സ്വയമേവ തിരിച്ചറിയുന്നു. ഇത് പ്രതീക്ഷിക്കുന്നു
ഏറ്റവും കുറഞ്ഞത് രണ്ട് ഫയൽനാമങ്ങൾ/ഡയറക്ടറികൾ (ഇൻപുട്ടിനും ഔട്ട്പുട്ട് ഫയലിനും വേണ്ടി).
കമാൻഡ് ലൈൻ. ഒരെണ്ണം മാത്രം ആവശ്യമുള്ള '-l' ഓപ്ഷനാണ് ഒരു അപവാദം
ഫയലിന്റെ പേര്/ഡയറക്ടറി അതിന്റെ ഉള്ളടക്കം പട്ടികപ്പെടുത്തുക.
പൊതുവായ ഓപ്ഷനുകൾ:
-l: സ്പെയ്സ്-വേർതിരിക്കപ്പെട്ട പ്രോട്ടോക്കോൾ പാരാമീറ്ററുകളും എക്സിറ്റുകളും ലിസ്റ്റുചെയ്യുന്നു. ഒരു ലഭിക്കാൻ '-l സഹായം' ഉപയോഗിക്കുക
സാധ്യമായ പരാമീറ്ററുകളുടെ പട്ടികയും എല്ലാ പരാമീറ്ററുകളും ലിസ്റ്റുചെയ്യാൻ '-l all'. പരാമീറ്റർ
ഈ ഓപ്ഷൻ ഉപയോഗിക്കുമ്പോൾ 'output-file' ഒഴിവാക്കണം.
-p: ഡിഫോൾട്ടുകൾക്കായി ഈ പ്രോട്ടോക്കോൾ ലോഡ് ചെയ്യുക
പ്രോട്ടോകോൾ ഓപ്ഷനുകൾ:
- തീയതി: സ്കാൻ തീയതി [yyyymmdd] (സ്ഥിരസ്ഥിതി=20140807yyyymmdd)
-fp: ഘട്ടം ദിശയിൽ FOV [mm] (സ്ഥിരസ്ഥിതി=220.0mm)
-fr: FOV വായന ദിശയിൽ [mm] (സ്ഥിരസ്ഥിതി=220.0mm)
-എഫ്എസ്: FOV സ്ലൈസ് ദിശയിൽ [mm] (സ്ഥിരസ്ഥിതി=5.0mm)
-nr: തുടർച്ചയായ അളവുകളുടെ എണ്ണം (സ്ഥിരസ്ഥിതി=1)
-nx: വായന ദിശയിലുള്ള പോയിന്റുകളുടെ എണ്ണം (സ്ഥിരസ്ഥിതി=128)
-നി: ഘട്ടം ദിശയിലുള്ള പോയിന്റുകളുടെ എണ്ണം (സ്ഥിരസ്ഥിതി=128)
-nz: സ്ലൈസ് ദിശയിലുള്ള പോയിന്റുകളുടെ എണ്ണം (സ്ഥിരസ്ഥിതി=1)
-പിബർത്ത്: രോഗികളുടെ ജനനത്തീയതി [yyyymmdd] (സ്ഥിരസ്ഥിതി=00000000yyyymmdd)
-പിഡ്: അദ്വിതീയ രോഗി ഐഡന്റിഫയർ (സ്ഥിരസ്ഥിതി=അജ്ഞാതം)
- പേര്: രോഗിയുടെ മുഴുവൻ പേര് (സ്ഥിരസ്ഥിതി=അജ്ഞാതം)
-psex: രോഗികളുടെ ലൈംഗികത (ഓപ്ഷനുകൾ=MFO , default=O)
-പൗണ്ട്: രോഗികളുടെ ഭാരം [കിലോ] (സ്ഥിരസ്ഥിതി=50.0kg)
-ശാസ്ത്രജ്ഞൻ: ശാസ്ത്രജ്ഞന്റെ പേര് (സ്ഥിരസ്ഥിതി=അജ്ഞാതം)
-sd: ഇന്റർ-സ്ലൈസ് ദൂരം (മധ്യത്തിൽ നിന്ന് മധ്യത്തിലേക്ക്) [mm] (സ്ഥിരസ്ഥിതി=10.0mm)
-സെർഡ്: സീരീസ് വിവരണം (സ്ഥിരസ്ഥിതി=അജ്ഞാതം)
-സെർനോ: സീരീസ് നമ്പർ (ഡിഫോൾട്ട്=1)
-സെന്റ്: സ്ലൈസ് കനം [mm] (സ്ഥിരസ്ഥിതി=5.0mm)
- സ്റ്റഡ്: പഠന വിവരണം (സ്ഥിരസ്ഥിതി=അജ്ഞാതം)
-tcname: ട്രാൻസ്മിറ്റ് കോയിലിന്റെ പേര് (സ്ഥിരസ്ഥിതി=അജ്ഞാതം)
-ചായ: ടൈം-ടു-എക്കോ സീക്വൻസ് [മി.എസ്] (സ്ഥിരസ്ഥിതി=80.0മി.എസ്)
- സമയം: സ്കാൻ സമയം [hhmmss] (സ്ഥിരസ്ഥിതി=091009hhmmss)
-tr: തുടർച്ചയായ ആവേശങ്ങൾക്കിടയിലുള്ള സമയം [മി.സെ.] (സ്ഥിരസ്ഥിതി=1000.0മി.സെ.)
ഫയല് വായിക്കുക ഓപ്ഷനുകൾ:
-cplx: ഡാറ്റയെ സങ്കീർണ്ണമായി കണക്കാക്കി തന്നിരിക്കുന്ന ഘടകം എക്സ്ട്രാക്റ്റ് ചെയ്യുക (ഓപ്ഷനുകൾ=എബിഎസ് ഫാ റിയൽ ഒന്നുമില്ല
ഇമേജ് , ഡിഫോൾട്ട്=ഒന്നുമില്ല)
-ദെസ്: ഒന്നിലധികം ഡാറ്റാസെറ്റുകൾ വായിച്ചാൽ എക്സ്ട്രാക്റ്റുചെയ്യാനുള്ള ഡാറ്റാസെറ്റ് സൂചിക
-ഫിൽട്ടർ: പ്രോട്ടോക്കോൾ പാരാമീറ്റർ 'കീ'യിൽ സ്ട്രിംഗ് അടങ്ങിയിരിക്കുന്ന ഡാറ്റാസെറ്റുകൾ മാത്രം വായിക്കുക
'മൂല്യം' ('കീ=മൂല്യം' ഫോർമാറ്റിൽ നൽകിയിരിക്കുന്നു)
-fmap: കുറഞ്ഞ മെമ്മറി ഉപയോഗത്തിന്, (റോ) ഡാറ്റ വായിച്ചതിനുശേഷം ഫയൽമാപ്പിംഗ് തുടരുക, പക്ഷേ എഴുതിയത്
അറേയിൽ പ്രവേശിക്കുന്നത് ഒരു തകർച്ചയിൽ കലാശിക്കും
-jdx: ഒന്നിലധികം JDX അറേകൾ ഉണ്ടെങ്കിൽ, ഇത് തിരഞ്ഞെടുക്കുക
- ഉപഭാഷ: ഫോർമാറ്റിന്റെ നൽകിയിരിക്കുന്ന ഭാഷ ഉപയോഗിച്ച് ഡാറ്റ വായിക്കുക. (ഡിഫോൾട്ട് ഭാഷാഭേദമല്ല)
-ആർഎഫ്: ഫോർമാറ്റ് വായിക്കുക, ഫയൽ എക്സ്റ്റൻഷൻ അസാധുവാക്കാൻ ഇത് ഉപയോഗിക്കുക (options=autodetect 3db analysis asc
coi dat dcm ഇരട്ട ഫ്ലോട്ട് gz hdr idx ima ഇന്റർഫിൽ jdx mag mhd nii ph png pos pro
reg s16bit s32bit s8bit smp u16bit u32bit u8bit , default=autodetect)
-ഒഴിവാക്കുക: റോ ഡാറ്റ വായിക്കുന്നതിന് മുമ്പ് ഈ അളവിലുള്ള ബൈറ്റുകൾ ഒഴിവാക്കുക (സ്ഥിരസ്ഥിതി=0)
ഫയല് എഴുതുക ഓപ്ഷനുകൾ:
- കൂട്ടിച്ചേർക്കുക: നിലവിലുള്ള ഫയലിലേക്ക് കൂട്ടിച്ചേർക്കുക, റോ ഡാറ്റയ്ക്ക് മാത്രം
-fnamepar: അതുല്യമായ സൃഷ്ടിക്കുമ്പോൾ ഉൾപ്പെടുത്തേണ്ട പ്രോട്ടോക്കോൾ പാരാമീറ്ററുകളുടെ സ്പേസ്-വേർതിരിക്കപ്പെട്ട ലിസ്റ്റ്
ഫയൽ നാമങ്ങൾ
-നോസ്കെയിൽ: പൂർണ്ണസംഖ്യകൾ സംഭരിക്കുമ്പോൾ മൂല്യങ്ങൾ പുനഃക്രമീകരിക്കരുത്
-രണ്ടായി പിരിയുക: പ്രോട്ടോക്കോൾ-ഡാറ്റ ജോഡികളെ പ്രത്യേക ഫയലുകളായി വിഭജിക്കാൻ നിർബന്ധിക്കുക.
-തരം: ഇമേജ് പ്രാതിനിധ്യ തരം (ഓപ്ഷനുകൾ=ഓട്ടോമാറ്റിക് ഫ്ലോട്ട് ഡബിൾ s32bit u32bit s16bit
u16bit s8bit u8bit , default=ഓട്ടോമാറ്റിക്)
-വൈദ്യഭാഷ: ഫോർമാറ്റിന്റെ നൽകിയിരിക്കുന്ന ഭാഷാഭേദം ഉപയോഗിച്ച് ഡാറ്റ എഴുതുക. (ഡിഫോൾട്ട് ഭാഷാഭേദമല്ല)
-wf: ഫോർമാറ്റ് എഴുതുക, ഫയൽ എക്സ്റ്റൻഷൻ അസാധുവാക്കാൻ ഇത് ഉപയോഗിക്കുക (options=autodetect 3db analysis asc
coi dat dcm ഇരട്ട ഫ്ലോട്ട് gz hdr idx ima ഇന്റർഫിൽ jdx mag mhd nii ph png pos pro
reg s16bit s32bit s8bit smp u16bit u32bit u8bit , default=autodetect)
-wp: ഈ ഫയലിലേക്ക് പ്രോട്ടോക്കോൾ പ്രത്യേകം സംഭരിക്കുക.
ഫിൽട്ടറുകൾ:
- വിന്യസിക്കുക : ന്റെ ജ്യാമിതിയിലേക്ക് (വോക്സൽ ലൊക്കേഷനുകൾ) ഡാറ്റ വിന്യസിക്കുക
ഒരു ബാഹ്യ ഫയൽ
- ഓട്ടോമാസ്ക് : ഓട്ടോമാറ്റിക് ഹിസ്റ്റോഗ്രാം അടിസ്ഥാനമാക്കിയുള്ള ത്രെഷോൾഡ് ഉപയോഗിച്ച് മാസ്ക് സൃഷ്ടിക്കുക
-ക്ലസ്റ്റർ : വലുപ്പമനുസരിച്ച് അടുക്കിയ പൂജ്യമല്ലാത്ത തൊട്ടടുത്തുള്ള/അടുത്ത അയൽവാസികളുടെ വോക്സലുകളുടെ ക്ലസ്റ്ററുകൾ സൃഷ്ടിക്കുക
- convolve <കൺവലൂഷൻ കേർണൽ (ഗാസ് നോഫിൽറ്റർ ട്രയാംഗിൾ ഹാൻ ഹാമിംഗ് കോസ്സ്ക് ബ്ലാക്ക്മാൻ
BlackmanNuttall Exp ),കേർണൽ വ്യാസം [mm]> : സ്പേഷ്യൽ അളവുകളിൽ കൺവ്യൂഷൻ
- പിന്തിരിപ്പിക്കുക <നീക്കം ചെയ്യേണ്ട കുറഞ്ഞ ഫ്രീക്വൻസി ഘടകങ്ങളുടെ എണ്ണം, ഫലത്തിന്റെ പൂജ്യം ശരാശരി
timecourse> : കാലക്രമേണ സ്ലോ ഡ്രിഫ്റ്റ് നീക്കം ചെയ്യുക
-തിരുത്തുക <ഫോർമാറ്റിലെ സ്ഥാനം/ശ്രേണി സ്ട്രിംഗ് (ടൈംഫ്രെയിം, സ്ലൈസ്പോസ്, ഫേസ്പോസ്, റീഡ്പോസ്),പുതിയ മൂല്യം
ഓഫ് voxel> : സിംഗിൾ വോക്സൽ മൂല്യങ്ങൾ എഡിറ്റ് ചെയ്യുക
-ജെൻമാസ്ക് : മൂല്യമുള്ള എല്ലാ വോക്സലുകളും ഉൾപ്പെടെ മാസ്ക് സൃഷ്ടിക്കുക
നൽകിയിരിക്കുന്ന ശ്രേണിയിൽ
-ഐസോട്രോപ്പ് : ഇന്റർപോളേഷനിലൂടെ ഇമേജ് വോക്സൽ ഐസോട്രോപ്പ് ഉണ്ടാക്കുക (ചിത്രം
ജ്യാമിതി മാറില്ല)
- ലോപാസ് : ലോപാസ് ഫിൽട്ടറിംഗ്
-പരമാവധി : പരമാവധി മൂല്യത്തിന് മുകളിലുള്ള എല്ലാ മൂല്യങ്ങളും ക്ലിപ്പ് ചെയ്യുക
- പരമാവധി : പരമാവധി തീവ്രത പ്രൊജക്ഷൻ നടത്തുക
ഓവർ നൽകിയിരിക്കുന്ന ദിശ
- ലയിപ്പിക്കുക : സമയ മാനം വികസിപ്പിച്ചുകൊണ്ട് ഡാറ്റാസെറ്റുകളെ ഒരൊറ്റ ഡാറ്റാസെറ്റിലേക്ക് ലയിപ്പിക്കുക
-മിനിറ്റ് : കുറഞ്ഞ മൂല്യത്തിന് താഴെയുള്ള എല്ലാ മൂല്യങ്ങളും ക്ലിപ്പ് ചെയ്യുക
- മിനിപ്പ് : കുറഞ്ഞ തീവ്രത പ്രൊജക്ഷൻ നടത്തുക
ഓവർ നൽകിയിരിക്കുന്ന ദിശ
-noNaN : ഓരോ NaN-നും നൽകിയിരിക്കുന്ന മൂല്യം ഉപയോഗിച്ച് മാറ്റിസ്ഥാപിക്കുന്നു
-pflip : ഘട്ടം ദിശയിൽ ഡാറ്റ ഫ്ലിപ്പുചെയ്യുക
-പ്രാഞ്ച് : ശ്രേണി തിരഞ്ഞെടുക്കുക
ഘട്ടം ദിശ
-പ്രോജ് : കൊടുത്തിരിക്കുന്നതിനേക്കാൾ ശരാശരി പ്രൊജക്ഷൻ നടത്തുക
സംവിധാനം
- ക്വാണ്ടിൽമാസ്ക് : നൽകിയിരിക്കുന്ന ഫ്രാക്ഷണലിന് മുകളിലുള്ള എല്ലാ വോക്സലുകളും ഉൾപ്പെടെ മാസ്ക് സൃഷ്ടിക്കുക
ഉമ്മറം
-പുനർസാമ്പിൾ : ഇമേജ് ഡാറ്റയുടെ താൽക്കാലിക വലുപ്പം
-വലുപ്പം മാറ്റുക : ഇമേജ് ഡാറ്റയുടെ സ്പേഷ്യൽ വലുപ്പം
- റെസ്ലൈസ് : നൽകിയിരിക്കുന്നതിലേക്ക് ചിത്രം പുനഃസ്ഥാപിക്കുന്നു
ഓറിയന്റേഷൻ
-rflip : വായന ദിശയിൽ ഡാറ്റ ഫ്ലിപ്പുചെയ്യുക
- ചെംചീയൽ : ഇൻ-പ്ലെയ്ൻ റൊട്ടേഷൻ
- ക്രമീകരിക്കുക : ശ്രേണി തിരഞ്ഞെടുക്കുക
ദിശ വായിക്കുക
- സ്കെയിൽ : ഇമേജ് മൂല്യങ്ങൾ പുനഃക്രമീകരിക്കുക
-sflip : സ്ലൈസ് ദിശയിൽ ഡാറ്റ ഫ്ലിപ്പുചെയ്യുക
-ഷിഫ്റ്റ് <readDirection shift [pixel],phaseDirection shift [pixel],sliceDirection shift
[പിക്സൽ]> : ഡാറ്റ സ്പേഷ്യൽ ആയി മാറ്റുക
- സ്ലൈസ്ടൈം : ശരിയായത്
സ്ലൈസുകളുടെ വ്യത്യസ്ത ഏറ്റെടുക്കൽ സമയ പോയിന്റുകൾ
-സ്പ്ലൈസ് : splices the
തന്നിരിക്കുന്ന ദിശയിലുള്ള ചിത്രം
-സ്റേഞ്ച് : ശ്രേണി തിരഞ്ഞെടുക്കുക
സ്ലൈസ് ദിശ
-സ്വപ്ഡിം <[rps][-],[rps][-],[rps][-]> : ഒരു ദിശ വ്യക്തമാക്കി അളവുകൾ സ്വാപ്പ് ചെയ്യുക/പ്രതിഫലിക്കുക
ഓപ്ഷണൽ റിഫ്ളക്ഷൻ ചിഹ്നത്തോടുകൂടിയ ട്രിപ്പിൾ
-ടൈൽ : ഒരു ചതുരാകൃതിയിലുള്ള 2D ഇമേജിലേക്ക് സ്ലൈസുകൾ സംയോജിപ്പിക്കുക
-ട്രാഞ്ച് : ശ്രേണി തിരഞ്ഞെടുക്കുക
സമയ ദിശ
-tshift : കൃത്യസമയത്ത് ഡാറ്റ മാറ്റുക
-ടൈപ്പ്മാക്സ് : ഒരു നിർദ്ദിഷ്ട ഡാറ്റാടൈപ്പിന്റെ പരമാവധി മുകളിലുള്ള എല്ലാ മൂല്യങ്ങളും ക്ലിപ്പ് ചെയ്യുക
-ടൈപ്പമിൻ : ഒരു നിർദ്ദിഷ്ട ഡാറ്റാടൈപ്പിന്റെ മിനിനത്തിന് താഴെയുള്ള എല്ലാ മൂല്യങ്ങളും ക്ലിപ്പ് ചെയ്യുക
- യൂസ്മാസ്ക് : ഫയലിൽ നിന്ന് മാസ്കിനുള്ളിലെ എല്ലാ മൂല്യങ്ങളും ഉൾപ്പെടെ 1D ഡാറ്റാസെറ്റ് സൃഷ്ടിക്കുക
മറ്റു ഓപ്ഷനുകൾ:
-v അഥവാ ഡീബഗ്ഗിംഗ്/എല്ലാ ഘടകങ്ങളും അല്ലെങ്കിൽ ഒറ്റത്തവണ കണ്ടെത്തുന്നതിന്
ഘടകം, യഥാക്രമം. ലോഗ്ലെവലിനുള്ള സാധ്യമായ മൂല്യങ്ങൾ ഇവയാണ്: 0(noLog), 1(errorLog),
2(മുന്നറിയിപ്പ് ലോഗ്), 3(ഇൻഫോലോഗ്).
-h, --സഹായിക്കൂ, -ഹെൽപ്പ്, --പതിപ്പ് : സഹായ വാചകം അല്ലെങ്കിൽ പതിപ്പ് വിവരങ്ങൾ അച്ചടിക്കുക
പിന്തുണയുള്ള ഫയല് വിപുലീകരണങ്ങൾ(ഫോർമാറ്റുകൾ):
3db (Iris3D ബൈനറി ഡാറ്റ)
വിശകലനം ചെയ്യുക
(NIFTI/ANYZE, ഭാഷാഭേദങ്ങൾ: fsl )
asc (ASCII, ഭാഷാഭേദങ്ങൾ: tcourse )
coi (JCAMP-DX ഡാറ്റാ സെറ്റുകൾ)
dat (Matlab ascii 2D ഡാറ്റ മാട്രിക്സ്)
dcm (DICOM, ഭാഷാഭേദങ്ങൾ: സീമെൻസ്)
ഇരട്ട (ഇരട്ട അസംസ്കൃത ഡാറ്റ)
ഫ്ലോട്ട് (ഫ്ലോട്ട് റോ ഡാറ്റ)
gz (മറ്റ് ഫോർമാറ്റുകൾക്കുള്ള GNU-Zip കണ്ടെയ്നർ)
എച്ച്ഡിആർ (ഇന്റർഫയൽ, ഭാഷാഭേദങ്ങൾ: ന്യൂറോസ്റ്റാറ്റ്)
hdr (NIFTI/ANYZE, ഭാഷാഭേദങ്ങൾ: fsl )
idx (ASCII-യിലെ പൂജ്യമല്ലാത്തതിന്റെ 3D സൂചികകൾ)
ima (DICOM, ഭാഷാഭേദങ്ങൾ: സീമെൻസ്)
ഇന്റർഫിൽ
(ഇന്റർഫയൽ, ഭാഷാഭേദങ്ങൾ: ന്യൂറോസ്റ്റാറ്റ്)
jdx (JCAMP-DX ഇമേജ് ഫോർമാറ്റ്)
മാഗ് (DICOM, ഭാഷാഭേദങ്ങൾ: സീമെൻസ്)
mhd (മെറ്റാ ഇമേജ്)
nii (NIFTI/ANYZE, ഭാഷാഭേദങ്ങൾ: fsl )
ph (DICOM, ഭാഷാഭേദങ്ങൾ: സീമെൻസ്)
png (പോർട്ടബിൾ നെറ്റ്വർക്ക് ഗ്രാഫിക്സ്)
pos (ASCII-ൽ പൂജ്യമല്ലാത്തതിന്റെ xy സ്ഥാനങ്ങൾ)
പ്രോ (ODIN മെഷർമെന്റ് പ്രോട്ടോക്കോളുകൾ)
reg (Ansoft HFSS ASCII)
s16bit (ഒപ്പിട്ട 16 ബിറ്റ് റോ ഡാറ്റ)
s32bit (ഒപ്പിട്ട 32 ബിറ്റ് റോ ഡാറ്റ)
s8bit (ഒപ്പിട്ട 8 ബിറ്റ് റോ ഡാറ്റ)
smp (JCAMP-DX ഡാറ്റാ സെറ്റുകൾ)
u16bit (ഒപ്പ് ചെയ്യാത്ത 16 ബിറ്റ് റോ ഡാറ്റ)
u32bit (ഒപ്പ് ചെയ്യാത്ത 32 ബിറ്റ് റോ ഡാറ്റ)
u8bit (ഒപ്പ് ചെയ്യാത്ത 8 ബിറ്റ് റോ ഡാറ്റ)
onworks.net സേവനങ്ങൾ ഉപയോഗിച്ച് miconv ഓൺലൈനായി ഉപയോഗിക്കുക