Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator അല്ലെങ്കിൽ MAC OS ഓൺലൈൻ എമുലേറ്റർ എന്നിങ്ങനെയുള്ള ഞങ്ങളുടെ ഒന്നിലധികം സൗജന്യ ഓൺലൈൻ വർക്ക്‌സ്റ്റേഷനുകളിലൊന്ന് ഉപയോഗിച്ച് OnWorks സൗജന്യ ഹോസ്റ്റിംഗ് പ്രൊവൈഡറിൽ പ്രവർത്തിപ്പിക്കാൻ കഴിയുന്ന കമാൻഡ് ഇതാണ്.
പട്ടിക:
NAME
mirabait - ഒരു വായനാ ശേഖരത്തിൽ നിന്ന് വായന തിരഞ്ഞെടുക്കുക
സിനോപ്സിസ്
മീരാബൈറ്റ് [-f ] [-t [-ടി ...]] [-ഇക്ലോർ] ബെയ്റ്റ്ഫയൽ ഇൻഫൈൽ
വിവരണം
മീരാബൈറ്റ് ഭാഗികമായി സമാനമോ തുല്യമോ ആയ ഒരു വായനാ ശേഖരത്തിൽ നിന്ന് വായന തിരഞ്ഞെടുക്കുന്നു
ലക്ഷ്യ ഭോഗങ്ങളായി നിർവചിച്ചിരിക്കുന്ന ക്രമങ്ങൾ. ഉപയോക്താക്കൾക്ക് ക്രമീകരിക്കാവുന്നവ കണ്ടെത്തുന്നതിലൂടെ സമാനത നിർവചിക്കപ്പെടുന്നു
ഭോഗങ്ങളിൽ തുല്യമായ സാധാരണ കെ-മെറുകളുടെ എണ്ണം (കെ തുടർച്ചയായ ബേസുകളുടെ സീക്വൻസുകൾ)
സീക്വൻസുകളും സ്‌ക്രീൻ ചെയ്ത സീക്വൻസുകളും ഫോർവേഡ് അല്ലെങ്കിൽ റിവേഴ്‌സ് തിരഞ്ഞെടുക്കണം
പൂരക ദിശ.
ഓപ്ഷനുകൾ
-f
ഈ തരത്തിലുള്ള പ്രോജക്റ്റ് ഫയലുകൾ ലോഡ് ചെയ്യുക, ഇവിടെ fromtype:
CAF-ൽ നിന്നുള്ള കഫ് സീക്വൻസുകൾ
MAF-ൽ നിന്നുള്ള maf സീക്വൻസുകൾ
പിഎച്ച്ഡിയിൽ നിന്നുള്ള പിഎച്ച്ഡി സീക്വൻസുകൾ
ഒരു GBF-ൽ നിന്നുള്ള gbf സീക്വൻസുകൾ
ഒരു ഫാസ്റ്റയിൽ നിന്നുള്ള ഫാസ്റ്റ സീക്വൻസുകൾ
ഒരു FASTQ-ൽ നിന്നുള്ള ഫാസ്റ്റ്ക് സീക്വൻസുകൾ
-t
ഈ തരത്തിലുള്ള ക്രമങ്ങൾ എഴുതുക (ഒന്നിലധികം പരാമർശങ്ങൾ -t അനുവദനീയമാണ്):
ഫാസ്റ്റയിലേക്കുള്ള ഫാസ്റ്റ സീക്വൻസുകൾ
FASTQ-ലേക്കുള്ള ഫാസ്റ്റ്ക് സീക്വൻസുകൾ
CAF-ലേക്കുള്ള കഫ് സീക്വൻസുകൾ
MAF-ലേക്കുള്ള maf സീക്വൻസുകൾ
ടെക്സ്റ്റ് ഫയലിലേക്കുള്ള txt സീക്വൻസ് നാമങ്ങൾ
-k k-mer, ബെയ്റ്റിന്റെ ദൈർഘ്യം (<32, default=31)
-n മിനി. ആവശ്യമുള്ള കെ-മെർ ബെയ്റ്റുകളുടെ എണ്ണം (സ്ഥിരസ്ഥിതി=1)
-i വിപരീത ഹിറ്റ്: ബെയ്റ്റ് അടിക്കാത്ത സീക്വൻസുകൾ മാത്രം എഴുതുന്നു
-r വിപരീത പൂരക ദിശ പരിശോധിക്കുന്നില്ല
-o ഫാസ്റ്റ്ക് ക്വാളിറ്റി ഓഫ്‌സെറ്റ് (ഇതിനായി മാത്രം -f = 'fastq') FASTQ-ലെ ഗുണനിലവാര മൂല്യങ്ങളുടെ ഓഫ്‌സെറ്റ്
ഫയൽ. സ്ഥിരസ്ഥിതി: 33 0-ന്റെ ഒരു മൂല്യം സ്വയമേവ തിരിച്ചറിയാൻ ശ്രമിക്കുന്നു.
-f
ഈ തരത്തിലുള്ള പ്രോജക്റ്റ് ഫയലുകൾ ലോഡ് ചെയ്യുക, ഇവിടെ fromtype:
CAF-ൽ നിന്നുള്ള കഫ് സീക്വൻസുകൾ
MAF-ൽ നിന്നുള്ള maf സീക്വൻസുകൾ
പിഎച്ച്ഡിയിൽ നിന്നുള്ള പിഎച്ച്ഡി സീക്വൻസുകൾ
ഒരു GBF-ൽ നിന്നുള്ള gbf സീക്വൻസുകൾ
ഒരു ഫാസ്റ്റയിൽ നിന്നുള്ള ഫാസ്റ്റ സീക്വൻസുകൾ
ഒരു FASTQ-ൽ നിന്നുള്ള ഫാസ്റ്റ്ക് സീക്വൻസുകൾ
-t
ഈ തരത്തിലുള്ള ക്രമങ്ങൾ എഴുതുക (ഒന്നിലധികം പരാമർശങ്ങൾ -t അനുവദനീയമാണ്):
ഫാസ്റ്റയിലേക്കുള്ള ഫാസ്റ്റ സീക്വൻസുകൾ
FASTQ-ലേക്കുള്ള ഫാസ്റ്റ്ക് സീക്വൻസുകൾ
CAF-ലേക്കുള്ള കഫ് സീക്വൻസുകൾ
MAF-ലേക്കുള്ള maf സീക്വൻസുകൾ
ടെക്സ്റ്റ് ഫയലിലേക്കുള്ള txt സീക്വൻസ് നാമങ്ങൾ
-k k-mer, ബെയ്റ്റിന്റെ ദൈർഘ്യം (<32, default=31)
-n മിനി. ആവശ്യമുള്ള കെ-മെർ ബെയ്റ്റുകളുടെ എണ്ണം (സ്ഥിരസ്ഥിതി=1)
-i വിപരീത ഹിറ്റ്: ബെയ്റ്റ് അടിക്കാത്ത സീക്വൻസുകൾ മാത്രം എഴുതുന്നു
-r വിപരീത പൂരക ദിശ പരിശോധിക്കുന്നില്ല
-o ഫാസ്റ്റ്ക് ക്വാളിറ്റി ഓഫ്‌സെറ്റ് (ഇതിനായി മാത്രം -f = 'fastq') FASTQ-ലെ ഗുണനിലവാര മൂല്യങ്ങളുടെ ഓഫ്‌സെറ്റ്
ഫയൽ. സ്ഥിരസ്ഥിതി: 33 0-ന്റെ ഒരു മൂല്യം സ്വയമേവ തിരിച്ചറിയാൻ ശ്രമിക്കുന്നു.
onworks.net സേവനങ്ങൾ ഉപയോഗിച്ച് mirabait ഓൺലൈനായി ഉപയോഗിക്കുക
