PPSeq: സമാന്തര NGS വിശകലനം ലിനക്സ് ഓൺലൈൻ ഡൗൺലോയിൽ പ്രവർത്തിക്കും

ഇതാണ് PPSeq എന്ന് പേരിട്ടിരിക്കുന്ന Linux ആപ്പ്: ലിനക്സിൽ ഓൺലൈനിൽ പ്രവർത്തിപ്പിക്കുന്നതിനുള്ള സമാന്തര NGS അനാലിസിസ്, ഇതിന്റെ ഏറ്റവും പുതിയ പതിപ്പ് ppseq-1.3-Linux-x86_64-pthread.gz ആയി ഡൗൺലോഡ് ചെയ്യാം. വർക്ക്സ്റ്റേഷനുകൾക്കായുള്ള സൗജന്യ ഹോസ്റ്റിംഗ് ദാതാവായ OnWorks-ൽ ഇത് ഓൺലൈനായി പ്രവർത്തിപ്പിക്കാം.

സ്ക്രീൻഷോട്ടുകൾ

PPSeq: ലിനക്സിൽ ഓൺലൈനിൽ പ്രവർത്തിക്കാൻ സമാന്തര NGS വിശകലനം

വിവരണം

ഹൈ-ത്രൂപുട്ട് നെക്സ്റ്റ് ജനറേഷൻ സീക്വൻസിംഗ് (NGS) സാങ്കേതികവിദ്യ ബയോമെഡിക്കൽ ഗവേഷണത്തിന്റെ പല വശങ്ങളിലും ശക്തമായ ഒരു ഉപകരണമായി അതിവേഗം ഉയർന്നുവന്നിട്ടുണ്ട്. എന്നിരുന്നാലും, അതിന്റെ ദ്രുതഗതിയിലുള്ള വികസനത്തോടൊപ്പം, NGS-നുള്ള ഡാറ്റാ മാഗ്നിറ്റ്യൂഡും വിശകലന സങ്കീർണ്ണതയും, സ്റ്റാൻഡേലോൺ വർക്ക്സ്റ്റേഷനുകളിലെ മൾട്ടിത്രെഡിംഗ് അൽഗോരിതങ്ങൾ പോലെയുള്ള പരമ്പരാഗത ചെറുകിട കമ്പ്യൂട്ടിംഗ് സൗകര്യങ്ങളുടെ ശേഷിയും ശേഷിയും കവിയുന്നു. ഈ പ്രശ്‌നം പരിഹരിക്കുന്നതിന്, മാസിവ് പാരലൽ പ്രോസസ്സിംഗ് (എംപിപി) സംവിധാനങ്ങൾ വഴി വർദ്ധിച്ചുവരുന്ന പ്രോസസ്സിംഗ് പവറിന്റെ വിതരണം ഉപയോഗിച്ച് ഞങ്ങൾ ഇവിടെ ഒരു പരിഹാരം അവതരിപ്പിക്കുന്നു.

സവിശേഷതകൾ

• ppalgn - ദൈർഘ്യമേറിയ റഫറൻസ് സീക്വൻസുകളിലേക്ക് സീക്വൻസിംഗ് റീഡ് ചെയ്യുന്നു
• ppbwt - ഒരു കൂട്ടം ഡിഎൻഎ സീക്വൻസുകളിൽ നിന്ന് ഒരു എഫ്എം-ഇൻഡക്സ് നിർമ്മിക്കുന്നു

പ്രേക്ഷകർ

വിദ്യാഭ്യാസം, എഞ്ചിനീയറിംഗ്, ഹെൽത്ത്കെയർ ഇൻഡസ്ട്രി, ഇൻഫർമേഷൻ ടെക്നോളജി, നോൺ പ്രോഫിറ്റ് ഓർഗനൈസേഷനുകൾ, ശാസ്ത്രം/ഗവേഷണം

ഉപയോക്തൃ ഇന്റർഫേസ്

കമാൻഡ്-ലൈൻ

പ്രോഗ്രാമിംഗ് ഭാഷ

സി ++

https://sourceforge.net/projects/ppseq/ എന്നതിൽ നിന്നും ലഭിക്കാവുന്ന ഒരു ആപ്ലിക്കേഷനാണിത്. ഞങ്ങളുടെ സൗജന്യ ഓപ്പറേറ്റീവ് സിസ്റ്റങ്ങളിലൊന്നിൽ നിന്ന് ഏറ്റവും എളുപ്പമുള്ള രീതിയിൽ ഓൺലൈനിൽ പ്രവർത്തിപ്പിക്കുന്നതിനായി ഇത് OnWorks-ൽ ഹോസ്റ്റ് ചെയ്‌തിരിക്കുന്നു.