Ini ialah arahan dotmatchere yang boleh dijalankan dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks menggunakan salah satu daripada berbilang stesen kerja dalam talian percuma kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MAC OS.
JADUAL:
NAMA
dotmatcher - Lukis titik titik ambang dua jujukan
SINOPSIS
dotmatcher -urutan turutan -berturutan turutan [-fail matriks matriks]
[-saiz tingkap integer] [-ambang integer] -regangkan togol -graf graf
-xygraph xygraph
dotmatcher -membantu
DESCRIPTION
dotmatcher ialah program baris arahan daripada EMBOSS (“The European Molecular Biology Open
Suite Perisian”). Ia adalah sebahagian daripada kumpulan arahan "Penjajaran:Dot plots".
PILIHAN
Input seksyen
-urutan turutan
-berturutan turutan
-fail matriks matriks
Ini ialah fail matriks pemarkahan yang digunakan semasa membandingkan jujukan. Secara lalai ia adalah
fail 'EBLOSUM62' (untuk protein) atau fail 'EDNAFULL' (untuk jujukan nukleik). Ini
fail ditemui dalam direktori 'data' pemasangan EMBOSS.
Tambahan seksyen
-saiz tingkap integer
Nilai lalai: 10
-ambang integer
Nilai lalai: 23
Output seksyen
-regangkan togol
Paparkan graf tidak berkadar Nilai lalai: N
-graf graf
-xygraph xygraph
Gunakan dotmatchere dalam talian menggunakan perkhidmatan onworks.net
