Ini ialah arahan gt-matchtool yang boleh dijalankan dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks menggunakan salah satu daripada berbilang stesen kerja dalam talian percuma kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MAC OS.
JADUAL:
NAMA
gt-matchtool - Menghuraikan format padanan dan/atau menggunakan alat padanan.
SINOPSIS
gt alat mancis [pilihan...]
DESCRIPTION
Jenis [...]
pilih padanan format fail: OPENMATCH: membuka sepadan dengan format, cth vmatch BLASTOUT : jadual
Keluaran BLAST (-m 8) BLASTALLP: gunakan BLASTALL dengan blastp BLASTALLN: gunakan BLASTALL
dengan blastn BLASTP : invoke blastp BLASTN : invoke blastn LAST : invoke LAST SW : gunakan
Smith-Waterman (lalai: OPENMATCH)
-fail perlawanan [nama fail]
tetapkan nama fail input (lalai: tidak ditentukan)
-db [nama fail]
tetapkan nama fail pangkalan data (lalai: tidak ditentukan)
-swminlen [nilai]
tetapkan panjang penjajaran minimum yang diperlukan (untuk penjajaran Smith-Waterman) (lalai: 10)
-swmaxedist [nilai]
tetapkan jarak edit maksimum yang dibenarkan (untuk penjajaran Smith-Waterman) (lalai: 0)
-pertanyaan [nama fail]
tetapkan nama fail pertanyaan (lalai: tidak ditentukan)
-membantu
paparan bantuan dan keluar
-turun
memaparkan maklumat versi dan keluar
PELAPORAN BUANG
Laporkan pepijat kepada[e-mel dilindungi]>.
Gunakan gt-matchtool dalam talian menggunakan perkhidmatan onworks.net