Ini ialah arahan gt-tallymer-mkindex yang boleh dijalankan dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks menggunakan salah satu daripada berbilang stesen kerja dalam talian percuma kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MAC OS.
JADUAL:
NAMA
gt-tallymer-mkindex - Kira dan indeks k-mer dalam tatasusunan akhiran dipertingkat yang diberikan untuk
nilai tetap k.
SINOPSIS
gt penghitung mkindex [pilihan] -esa suffixerator-index [pilihan]
DESCRIPTION
-esa [rentetan]
nyatakan indeks pengakhiran (pilihan wajib) (lalai: tidak ditentukan)
-merize [nilai]
Nyatakan saiz mer. (lalai: 20)
-minocc [nilai]
Tentukan nombor kejadian minimum untuk mers untuk output/indeks (lalai: 0)
-maxocc [nilai]
Tentukan nombor kejadian maksimum untuk mers untuk output/indeks (lalai: 0)
-pl [nilai]
nyatakan panjang awalan untuk pengesyoran pembinaan sempadan baldi: gunakan tanpa
hujah; maka panjang awalan yang munasabah ditentukan secara automatik (lalai: 0)
-nama indeks [rentetan]
simpan mers yang ditentukan oleh pilihan -maxocc dan -minocc dalam indeks (lalai:
tidak ditentukan)
-kira [ya|tidak]
kiraan kedai mers (lalai: tidak)
-imbas [ya|tidak]
baca tatasusunan akhiran yang dipertingkatkan secara berurutan dan bukannya memetakannya ke memori (lalai: tidak)
-v [ya|tidak]
bertele-tele (lalai: tidak)
-membantu
paparan bantuan dan keluar
-turun
memaparkan maklumat versi dan keluar
PELAPORAN BUANG
Laporkan pepijat kepada[e-mel dilindungi]>.
Gunakan gt-tallymer-mkindex dalam talian menggunakan perkhidmatan onworks.net
