Ini ialah arahan kmc_tools-complex yang boleh dijalankan dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks menggunakan salah satu daripada berbilang stesen kerja dalam talian percuma kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MAC OS.
JADUAL:
NAMA
kmc_tools-complex - operasi kompleks dengan beberapa pangkalan data input
SINOPSIS
kmc_tools complex
DESCRIPTION
Perintah ini melaksanakan gabungan operasi seperti yang ditakrifkan oleh
. Ia adalah fail teks dengan sintaks berikut:
__________________________________________________________________
|INPUT: |
| = [params] |
| = [params] |
|... |
| = [params] |
|OUTPUT: |
| = [ [...] |
|[OUTPUT_PARAMS: __|
| ] | /
| | /
|________________________________________________________________|/
PARAMETER
input1, input2, ... inputN
nama input yang digunakan untuk mentakrifkan persamaan
input1_db_path, input2_db_path, ... inputN_db_path
laluan ke set k-mers
Untuk setiap input terdapat parameter tambahan yang boleh ditetapkan:
-ci
tidak termasuk k-mers yang berlaku kurang daripada kali
cx
tidak termasuk k-mers yang berlaku lebih daripada kali
out_db_path
laluan ke pangkalan data output
ref_input
satu daripada input1, input2, ..., inputN
beroperasi
salah satu daripada {*,-,~,+}, yang merujuk kepada {bersilang, kmers_tolak, pembilang_tolak,
kesatuan}
Operator '*' mempunyai keutamaan tertinggi. Pengendali lain mempunyai keutamaan yang sama. Perintah daripada
operasi boleh ditukar dengan kurungan.
Parameter output:
-ci
tidak termasuk k-mers yang berlaku kurang daripada kali
-cx
tidak termasuk k-mers yang berlaku lebih daripada kali
-cs
nilai maksimum pembilang
CONTOH
__________________________________________________________________
|INPUT: |
|set1 = kmc_o1 -ci5 |
|set2 = kmc_o2 |
|set3 = kmc_o3 -ci10 -cx100 __|
|OUTPUT: | /
|hasil = (set3+set1)*set2 | /
|________________________________________________________________|/
Gunakan kmc_tools-complex dalam talian menggunakan perkhidmatan onworks.net
