Ini ialah command mapMers-depth yang boleh dijalankan dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks menggunakan salah satu daripada berbilang stesen kerja dalam talian percuma kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MAC OS
JADUAL:
NAMA
mapMers-depth - laporkan maklumat tentang memetakan kmer kepada jujukan
SINOPSIS
mapMers-depth {-kira|-kedalaman|-statistik} -mers MERYL -m MERSIZE -seq DALAM.FASTA
PILIHAN
Mod of operasi
Untuk urutan ordinal 's' dan kedudukan dalam urutan 'p' itu:
-kira melaporkan kiraan (c) bagi kmer tunggal yang bermula pada kedudukan (p).
Format: 'spc'
-kedalaman melaporkan bilangan (n) kmer yang menjangkau kedudukan (p).
Format: 'spn'
-statistik melaporkan kiraan minimum (m), maksimum (M) dan purata (a) semua mer yang menjangkau
kedudukan (p). juga melaporkan jumlah kiraan (t) dan bilangan kmer (n)
Format: 'spm M atn'
Umum
-m MERSIZE
-mers MERYL
meryl(1) pangkalan data
-seq DALAM.FASTA
urutan input fasta
Gunakan mapMers-depth dalam talian menggunakan perkhidmatan onworks.net
