miconv - Dalam talian dalam Awan

JADUAL:

NAMA

miconv - Menukar data imej perubatan antara format.

SINOPSIS

mikrokonv [pilihan] []

DESCRIPTION

miconv: Menukar data imej perubatan antara format.

Format fail dikenal pasti secara automatik oleh sambungan failnya. Ia menjangkakan pada
sekurang-kurangnya dua nama fail/direktori (untuk fail input dan output) pada penghujung fail
baris arahan. Pengecualian ialah pilihan '-l' yang memerlukan hanya satu
nama fail/direktori untuk menyenaraikan kandungannya.

Umum pilihan yang berikut:
-l: Menyenaraikan set parameter protokol dan pintu keluar yang dipisahkan ruang. Gunakan '-l help' untuk mendapatkan a
senarai parameter yang mungkin dan '-l all' untuk menyenaraikan semua parameter. Parameter
'fail-output' mesti ditinggalkan apabila menggunakan pilihan ini.

-p: Muatkan protokol ini untuk lalai

Protokol pilihan yang berikut:
-Tarikh: Tarikh imbasan [yyyymmdd] (default=20140807yyyymmdd)

-fp: FOV dalam arah fasa [mm] (lalai=220.0mm)

-fr: FOV dalam arah baca [mm] (lalai=220.0mm)

-fs: FOV dalam arah hirisan [mm] (lalai=5.0mm)

-nr: Bilangan ukuran berturut-turut (lalai=1)

-nx: Bilangan mata dalam arah bacaan (lalai=128)

-ny: Bilangan titik dalam arah fasa (lalai=128)

-nz: Bilangan titik dalam arah hirisan (lalai=1)

-kelahiran: Tarikh lahir pesakit [yyyymmdd] (default=00000000yyyymmdd)

-pid: Pengecam pesakit yang unik (lalai=Tidak diketahui)

-pname: Nama penuh pesakit (lalai=Tidak diketahui)

-seks: Jantina pesakit (pilihan=MFO , lalai=O)

-pweight: Berat pesakit [kg] (lalai=50.0kg)

-saintis: Nama Saintis (default=Unknown)

-sd: Jarak antara kepingan (dari tengah ke tengah) [mm] (lalai=10.0mm)

-serd: Perihalan Siri (lalai=Tidak diketahui)

-serno: Nombor Siri (lalai=1)

-st: Ketebalan kepingan [mm] (lalai=5.0mm)

-kancing: Penerangan Kajian (lalai=Tidak diketahui)

-tcname: Nama gegelung hantaran (lalai=Tidak diketahui)

-teh: Masa untuk gema jujukan [ms] (lalai=80.0ms)

-masa: Masa imbasan [hhmmss] (lalai=091009hhmmss)

-tr: Masa antara pengujaan berturut-turut [ms] (lalai=1000.0ms)

File membaca pilihan yang berikut:
-cplx: Anggap data sebagai kompleks dan ekstrak komponen yang diberikan (pilihan=tiada abs pha real
imag , lalai=tiada)

-d: Indeks set data untuk mengekstrak jika berbilang set data dibaca

-penapis: Baca hanya set data yang parameter protokol 'kunci' mengandungi rentetan
'value' (diberikan dalam format 'key=value')

-fmap: Untuk mengurangkan penggunaan memori, teruskan pemetaan filem selepas membaca data (mentah), tetapi menulis
ke dalam tatasusunan akan mengakibatkan ranap sistem

-jdx: Jika berbilang tatasusunan JDX hadir, pilih ini

-dialek: Baca data menggunakan dialek format yang diberikan. (lalai bukan dialek)

-rf: Format baca, gunakannya untuk mengatasi sambungan fail (options=autodetect 3db analysis asc
coi dat dcm double float gz hdr idx ima interfile jdx mag mhd nii ph png pos pro
reg s16bit s32bit s8bit smp u16bit u32bit u8bit , lalai=autodetek)

-langkau: Langkau jumlah bait ini sebelum membaca data mentah (lalai=0)

File menulis pilihan yang berikut:
-lampirkan: Tambahkan pada fail sedia ada, hanya untuk data mentah

-fnamepar: Senarai parameter protokol yang dipisahkan ruang untuk disertakan semasa membuat unik
nama fail

-noscale: Jangan skala semula nilai apabila menyimpan integer

-pecah: Paksa pemisahan pasangan protokol-data ke dalam fail berasingan.

Jenis: Jenis perwakilan imej (pilihan=apung automatik double s32bit u32bit s16bit
u16bit s8bit u8bit , lalai=automatik)

-wdialek: Tulis data menggunakan dialek format yang diberikan. (lalai bukan dialek)

-wf: Tulis format, gunakannya untuk mengatasi sambungan fail (options=autodetect 3db analysis asc
coi dat dcm double float gz hdr idx ima interfile jdx mag mhd nii ph png pos pro
reg s16bit s32bit s8bit smp u16bit u32bit u8bit , lalai=autodetek)

-wp: Simpan protokol secara berasingan ke fail ini.

Penapis:
-selaraskan : Jajarkan data kepada geometri (lokasi voxel) bagi
fail luaran

-automask : Cipta topeng menggunakan ambang berasaskan histogram automatik

-kelompok : Buat kelompok voxel bersebelahan/sebelah bukan sifar, diisih mengikut saiz

-belit <konvolusi kernel (Gauss NoFilter Triangle Hann Hamming CosSq Blackman
BlackmanNuttall Exp ), diameter kernel [mm]> : Konvolusi dalam dimensi spatial

-detrend <Bilangan komponen frekuensi rendah untuk dialih keluar, Sifar min terhasil
timecourse> : Keluarkan drift perlahan dari semasa ke semasa

-edit <Rentetan kedudukan/julat dalam format (jangka masa, slicepos, phasepos, readpos), nilai baharu
of voxel> : Edit nilai voxel tunggal

-genmask : Buat topeng termasuk semua voxel dengan nilai
dalam julat yang diberikan

-isotrop : membuat voxel imej isotrop melalui interpolasi (imej
geometri tidak akan berubah)

-PAS Rendah : Penapisan laluan rendah

-maks : Klip semua nilai melebihi nilai maksimum

-maxip : Lakukan unjuran keamatan maksimum
atas arahan yang diberikan

-bercantum : Gabungkan set data ke dalam set data tunggal dengan mengembangkan dimensi masa

-min : Klip semua nilai di bawah nilai minimum

-minip : Lakukan unjuran keamatan minimum
atas arahan yang diberikan

-tiadaNaN : Menggantikan setiap NaN dengan nilai yang diberikan

-pflip : Balikkan data mengikut arah fasa

-prange : Pilih julat dalam
arah fasa

-proj : Lakukan unjuran min atas yang diberikan
arah

-quantilmask : Buat topeng termasuk semua voxel di atas pecahan yang diberikan
ambang

-sampel semula : Saiz sementara data imej

-menukar saiz : Saiz spatial data imej

-relice : mengimbas semula imej kepada yang diberikan
orientasi

-rflip : Balikkan data ke arah bacaan

-busuk : Putaran dalam satah

-atur : Pilih julat dalam
membaca arahan

-skala : Skala semula nilai imej

-sflip : Balikkan data mengikut arah hirisan

-anjakan <readAnjakan arah [piksel],fasaAnjakan arah [piksel],sliceAnjakan arah
[pixel]> : Alihkan data secara spatial

-masa potong : Betul untuk
titik masa pemerolehan yang berbeza bagi kepingan

-sambatan : splices the
imej mengikut arah yang diberikan

-srange : Pilih julat dalam
arah hirisan

-swapdim <[rps][-],[rps][-],[rps][-]> : menukar/mencerminkan dimensi dengan menentukan arah
tiga kali ganda dengan tanda pantulan pilihan dilampirkan

-jubin : Gabungkan kepingan menjadi imej 2D segi empat sama

-pelik : Pilih julat dalam
arah masa

-pergi : Alihkan data dalam masa

-typemax : Klip semua nilai melebihi maksimum jenis data tertentu

-typemin : Klip semua nilai di bawah minimum jenis data tertentu

-usemask : Buat set data 1D termasuk semua nilai dalam topeng daripada fail

lain-lain pilihan yang berikut:
-v atau untuk penyahpepijatan/pengesanan semua komponen atau satu
komponen, masing-masing. Nilai yang mungkin untuk loglevel ialah: 0(noLog), 1(errorLog),
2(warningLog), 3(infoLog).

-h, - membantu, -membantu, --versi : Cetak maklumat teks bantuan atau versi

Disokong fail sambungan (format):
3db (data binari Iris3D)

menganalisis
(NIFTI/ANALYZE, dialek: fsl )

asc (ASCII, dialek: tcourse )

coi (set data JCAMP-DX)

dat (matriks data 2D Matlab ascii)

dcm (DICOM, dialek: siemens )

berganda (data mentah berganda)

terapung (mengapungkan data mentah)

gz (bekas GNU-Zip untuk format lain)

hdr (Interfile, dialek: neurostat )

hdr (NIFTI/ANALYZE, dialek: fsl )

idx (indeks 3D bukan sifar dalam ASCII)

ima (DICOM, dialek: siemens )

antara fail
(Interfile, dialek: neurostat )

jdx (format imej JCAMP-DX)

mag (DICOM, dialek: siemens )

mhd (MetaImage)

nii (NIFTI/ANALYZE, dialek: fsl )

ph (DICOM, dialek: siemens )

png (Grafik Rangkaian Mudah Alih)

pos (kedudukan xy bukan sifar dalam ASCII)

pro (protokol pengukuran ODIN)

reg (Ansoft HFSS ASCII)

s16bit (data mentah 16 bit yang ditandatangani)

s32bit (data mentah 32 bit yang ditandatangani)

s8bit (data mentah 8 bit yang ditandatangani)

smp (set data JCAMP-DX)

u16bit (data mentah 16 bit tidak ditandatangani)

u32bit (data mentah 32 bit tidak ditandatangani)

u8bit (data mentah 8 bit tidak ditandatangani)

Gunakan miconv dalam talian menggunakan perkhidmatan onworks.net