Dit is de opdracht dotmatchere die kan worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider van OnWorks met behulp van een van onze meerdere gratis online werkstations zoals Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator of MAC OS online emulator
PROGRAMMA:
NAAM
dotmatcher - Teken een drempeldotplot van twee reeksen
KORTE INHOUD
dotmatcher -een sequentie volgorde -volgorde volgorde [-matrixbestand Matrix]
[-venstergrootte geheel getal] [-drempelwaarde geheel getal] -rekken toggle -grafiek diagram
-xygraaf xygraaf
dotmatcher -Help
PRODUCTBESCHRIJVING
dotmatcher is een commandoregelprogramma van EMBOSS (“the European Molecular Biology Open
Softwaresuite"). Het maakt deel uit van de opdrachtgroep(en) "Uitlijning:Dotplots".
OPTIES
Invoer sectie
-een sequentie volgorde
-volgorde volgorde
-matrixbestand Matrix
Dit is het scorematrixbestand dat wordt gebruikt bij het vergelijken van reeksen. Standaard is het de
bestand 'EBLOSUM62' (voor eiwitten) of het bestand 'EDNAFULL' (voor nucleïnezuursequenties). Deze
bestanden zijn te vinden in de 'data' directory van de EMBOSS installatie.
Extra sectie
-venstergrootte geheel getal
Standaardwaarde: 10
-drempelwaarde geheel getal
Standaardwaarde: 23
uitgang sectie
-rekken toggle
Een niet-proportionele grafiek weergeven Standaardwaarde: N
-grafiek diagram
-xygraaf xygraaf
Gebruik dotmatchere online met behulp van onworks.net-services
