Dit is de opdracht mapMers-depth die kan worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider van OnWorks met behulp van een van onze meerdere gratis online werkstations zoals Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator of MAC OS online emulator
PROGRAMMA:
NAAM
mapMers-depth - rapporteer informatie over het in kaart brengen van kmers aan sequenties
KORTE INHOUD
mapMers-diepte {-telling|-diepte|-statistieken} -mers MERYL -m MERSIZE -volg IN.FASTA
OPTIES
Modes of operatie
Voor volgordevolgorde 's' en positie in die volgorde 'p':
-telling meldt de telling (c) van de enkele kmer die begint op positie (p).
Formaat: 'spc'
-diepte meldt het aantal (n) kmers die positie (p) overspannen.
Formaat: 'spn'
-statistieken rapporteert het minimum (m), maximum (M) en gemiddelde (a) aantal van alle mers die overspannen
positie (p). meldt ook totaaltelling (t) en aantal kmers (n)
Formaat: 'spm M atn'
Algemeen
-m MERSIZE
-mers MERYL
meryl(1) databank
-volg IN.FASTA
fasta invoerreeks
Gebruik mapMers-depth online met onworks.net-services