To jest polecenie ekstraktseqe, które można uruchomić u dostawcy bezpłatnego hostingu OnWorks przy użyciu jednej z naszych wielu bezpłatnych stacji roboczych online, takich jak Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online systemu Windows lub emulator online systemu MAC OS
PROGRAM:
IMIĘ
ekstraktseq - Wyodrębnia regiony z sekwencji
STRESZCZENIE
ekstraktseq -sekwencja sekwencja -regiony zasięg [-oddzielny boolean] -nast kolejne
ekstraktseq -Pomoc
OPIS
ekstraktseq to program wiersza poleceń firmy EMBOSS („The European Molecular Biology Open
Pakiet oprogramowania"). Jest częścią grupy (grup) poleceń „Edycja”.
OPCJE
Wkład Sekcja
-sekwencja sekwencja
Wymagane Sekcja
-regiony zasięg
Regiony do wyodrębnienia. Zbiór regionów jest określony przez zbiór par pozycji. The
pozycje są liczbami całkowitymi. Są one oddzielone dowolnym niecyfrowym, niealfatycznym znakiem.
Przykładowe specyfikacje regionów to: 24-45, 56-78 1:45, 67=99;765..888
1,5,8,10,23,45,57,99 Wartość domyślna: $(sekwencja.begin)-$(sekwencja.koniec)
Dodatkowy Sekcja
-oddzielny boolean
Jeśli ta opcja jest ustawiona na true, każdy określony region jest zapisywany jako osobna sekwencja.
Nazwa sekwencji tworzona jest z nazwy oryginalnej sekwencji z końcówką
pozycje początkowe i końcowe zakresu, oddzielane znakami podkreślenia,
np.: region XYZ od 2 do 34 jest zapisywany jako: XYZ_2_34 Wartość domyślna: N
Wydajność Sekcja
-nast kolejne
Skorzystaj z ekstraktów online, korzystając z usług onworks.net
