Jest to polecenie gt-matchtool, które można uruchomić w bezpłatnym dostawcy hostingu OnWorks przy użyciu jednej z naszych wielu bezpłatnych stacji roboczych online, takich jak Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online systemu Windows lub emulator online systemu MAC OS
PROGRAM:
IMIĘ
gt-matchtool — analizuje formaty dopasowania i/lub wywołuje narzędzia dopasowujące.
STRESZCZENIE
gt narzędzie do zapałek [opcja ...]
OPIS
-Type [...]
wybierz format pliku dopasowania: OPENMATCH: koncepcja mecz format, np. vmatch BLASTOUT: tabelaryczny
BLAST wyjście (-m 8) BLASTALLP: wywołaj BLASTALL za pomocą blastp BLASTALLN: wywołaj BLASTALL
z blastn BLASTP: wywołaj blastp BLASTN: wywołaj blastn LAST: wywołaj LAST SW: użyj
Smith-Waterman (domyślnie: MECZ OPEN)
-plik dopasowania [filename]
ustaw nazwę pliku wejściowego (domyślnie: niezdefiniowana)
-db [filename]
ustaw nazwę pliku bazy danych (domyślnie: niezdefiniowana)
-wminlen [wartość]
ustaw minimalną wymaganą długość wyrównania (dla wyrównania Smitha-Watermana) (domyślnie: 10)
-swmaxedysta [wartość]
ustaw maksymalną dozwoloną odległość edycji (dla wyrównania Smitha-Watermana) (domyślnie: 0)
-zapytanie [filename]
ustaw nazwę pliku zapytania (domyślnie: niezdefiniowana)
-Pomoc
wyświetl pomoc i wyjdź
-wersja
wyświetl informacje o wersji i wyjdź
RAPORTOWANIE ROBAKI
Zgłoś błędy do[email chroniony]>.
Skorzystaj z narzędzia gt-matchtool online, korzystając z usług onworks.net
