Jest to polecenie kmc_tools-counters_subtract, które można uruchomić w darmowym dostawcy usług hostingowych OnWorks przy użyciu jednej z wielu naszych bezpłatnych internetowych stacji roboczych, takich jak Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online systemu Windows lub emulator online MAC OS
PROGRAM:
IMIĘ
kmc_tools-counters_subtract - oblicza odejmowanie liczników dwóch baz danych KMC
STRESZCZENIE
kmc_tools liczniki_odejmowania <output
[parametry_wyjściowe]>
OPIS
Wyjściowa baza danych będzie zawierać tylko k-mery, które są obecne w pierwszym zestawie wejściowym i
mają liczniki wyższe niż odpowiednie k-mery w drugim zestawie. Dla każdego k-meru
licznik jest równy różnicy między licznikiem w pierwszym zestawie a licznikiem w zestawie
drugi zestaw.
OPCJE
Dla każdego wejścia dostępne są dodatkowe parametry:
-ci
wyklucz k-mery występujące mniej niż czasy
-cx
wyklucz k-merów występujących więcej niż czasy
Dla danych wyjściowych dostępne są dodatkowe parametry:
-ci
wyklucz k-mery występujące mniej niż czasy
-cx
wyklucz k-merów występujących więcej niż czasy
-cs
maksymalna wartość licznika
PRZYKŁAD
kmc - k28 plik1.fastq kmers1 tmp
kmc - k28 plik2.fastq kmers2 tmp
kmc_tools counters_subtract kmers1 kmers2 kmers1_kmers2_counters_subtract
Korzystaj z kmc_tools-counters_subtract online, korzystając z usług onworks.net
