miconv — online w chmurze

PROGRAM:

IMIĘ

miconv - Konwertuje medyczne dane obrazu między formatami.

STRESZCZENIE

mikonwa [Opcje] []

OPIS

miconv: Konwertuje dane obrazów medycznych między formatami.

Formaty plików są automatycznie identyfikowane na podstawie ich rozszerzenia. Oczekuje o godz
co najmniej dwie nazwy plików/katalogi (dla pliku wejściowego i wyjściowego) na końcu pliku
wiersz poleceń. Wyjątkiem jest opcja „-l”, która wymaga tylko jednego
nazwa pliku/katalog, aby wyświetlić jego zawartość.

Ogólne opcje:
-l: Wyświetla oddzielony spacjami zestaw parametrów protokołu i wyjść. Użyj „-l help”, aby uzyskać
lista możliwych parametrów i „-l all”, aby wyświetlić listę wszystkich parametrów. Parametr
Podczas korzystania z tej opcji należy pominąć „plik wyjściowy”.

-p: Załaduj ten protokół dla ustawień domyślnych

Protokół opcje:
-data: Data skanowania [rrrrmmdd] (domyślnie=20140807rrrrmmdd)

-fp: FOV w kierunku fazy [mm] (domyślnie=220.0mm)

-fr: FOV w kierunku odczytu [mm] (domyślnie=220.0mm)

-fs: FOV w kierunku cięcia [mm] (domyślnie=5.0mm)

-nr: Liczba kolejnych pomiarów (domyślnie=1)

-nx: Liczba punktów w kierunku odczytu (domyślnie=128)

-nie: Liczba punktów w kierunku fazy (domyślnie=128)

-nz: Liczba punktów w kierunku wycinka (domyślnie=1)

-pnarodziny: Data urodzenia pacjenta [rrrrmmdd] (domyślnie=00000000rrrrmmdd)

-pid: Unikalny identyfikator pacjenta (domyślnie=Nieznany)

-pnazwa: Pełne imię i nazwisko pacjenta (domyślnie=Nieznane)

-pseks: Płeć pacjenta (opcje=MFO , domyślnie=O)

-pwaga: Waga pacjenta [kg] (domyślnie=50.0kg)

-naukowiec: Nazwisko naukowca (domyślnie=Nieznane)

-SD: Odległość między przekrojami (od środka do środka) [mm] (domyślnie = 10.0 mm)

-serd: Opis serii (domyślnie=Nieznany)

- serno: Numer serii (domyślnie=1)

-st: Grubość plasterka [mm] (domyślnie=5.0mm)

-stadnina: Opis badania (domyślnie=Nieznane)

-tcnazwa: Nazwa cewki nadawczej (domyślnie=Nieznana)

-herbata: Czas do echa sekwencji [ms] (domyślnie=80.0ms)

-czas: Czas skanowania [hhmmss] (domyślnie=091009hhmmss)

-tr: Czas pomiędzy kolejnymi wzbudzeniami [ms] (domyślnie=1000.0ms)

filet czytać opcje:
-cplx: Traktuj dane jako złożone i wyodrębnij podany składnik (opcje=brak abs pha real
obraz , domyślnie=brak)

- ds: Indeks zestawu danych do wyodrębnienia, jeśli odczytanych zostanie wiele zestawów danych

-filtr: Odczytaj tylko te zestawy danych, których parametr protokołu „klucz” zawiera ciąg
„wartość” (podana w formacie „klucz=wartość”)

-fmapa: Aby zmniejszyć zużycie pamięci, zachowaj mapowanie plików po odczytaniu (surowych) danych, ale zapisie
do tablicy spowoduje awarię

-jdx: Jeśli istnieje wiele tablic JDX, wybierz to

-rdialekt: Odczytaj dane używając podanego dialektu formatu. (domyślnie brak dialektu)

-rf: Odczytaj format, użyj go do nadpisania rozszerzenia pliku (opcje=autodetect 3db analizuj asc
coi dat dcm double float gz hdr idx interfile ima jdx mag mhd nii ph png pos pro
reg s16bit s32bit s8bit smp u16bit u32bit u8bit , domyślnie = autodetekcja)

-pominąć: Pomiń tę ilość bajtów przed odczytaniem surowych danych (domyślnie=0)

filet napisać opcje:
-dodać: Dołącz do istniejącego pliku, tylko dla surowych danych

-fnazwapar: Oddzielona spacjami lista parametrów protokołu, które mają zostać uwzględnione podczas tworzenia unikalnych
nazwy plików

-noskala: Nie zmieniaj skali wartości podczas przechowywania liczb całkowitych

-rozdzielać: Wymuś podział par protokół-dane na osobne pliki.

-Type: Typ reprezentacji obrazu (opcje=automatic float double s32bit u32bit s16bit
u16bit s8bit u8bit , domyślnie=automatyczne)

-wdialekt: Napisz dane używając podanego dialektu formatu. (domyślnie brak dialektu)

-wf: Zapisz format, użyj go do nadpisania rozszerzenia pliku (options=autodetect 3db analysis asc
coi dat dcm double float gz hdr idx interfile ima jdx mag mhd nii ph png pos pro
reg s16bit s32bit s8bit smp u16bit u32bit u8bit , domyślnie = autodetekcja)

-wp: Zapisz protokół oddzielnie w tym pliku.

Filtry:
-wyrównywać : Dopasuj dane do geometrii (lokalizacji wokseli)
plik zewnętrzny

-automatyczna maska : Utwórz maskę przy użyciu automatycznego progu opartego na histogramie

-grupa : Utwórz klastry niezerowych sąsiednich/następnych wokseli, posortowanych według rozmiaru

-zwijać się <jądro splotu (Trójkąt Gaussa NoFilter Hann Hamming CosSq Blackman
BlackmanNuttall Exp ), średnica jądra [mm]> : Splot w wymiarach przestrzennych

-zniechęcać <Liczba składników o niskiej częstotliwości do usunięcia, średnia zerowa wyniku
przebieg czasu> : Usuń powolny dryf w czasie

-edytować <Łańcuch pozycji/zakresu w formacie (rama czasowa,slicepos,phasepos,readpos),nowa wartość
of voxel> : Edytuj wartości pojedynczych wokseli

-genmaska : Utwórz maskę zawierającą wszystkie woksele z wartością
w podanym zakresie

-izotrop : utwórz izotrop wokseli obrazu przez interpolację (obraz
geometria się nie zmieni)

- dolnoprzepustowy : Filtrowanie dolnoprzepustowe

-maks. : Przytnij wszystkie wartości powyżej wartości maksymalnej

-maksymalny : Wykonaj projekcję o maksymalnej intensywności
nad danym kierunkiem

-łączyć : Scal zestawy danych w jeden zestaw danych, rozszerzając wymiar czasu

- min : Przytnij wszystkie wartości poniżej wartości minimalnej

-minipa : Wykonaj projekcję o minimalnej intensywności
nad danym kierunkiem

-nieNaN : Zastępuje każdy NaN podaną wartością

-pflip : Odwróć dane w kierunku fazy

-płacz : Wybierz zakres w
kierunek fazy

-proj : Wykonaj średnią projekcję nad danym
kierunek

-maska ​​kwantylowa : Utwórz maskę zawierającą wszystkie woksele powyżej podanego ułamka
próg

-ponowne próbkowanie : Czasowa zmiana rozmiaru danych obrazu

-Zmień rozmiar : Przestrzenna zmiana rozmiaru danych obrazu

-przekrój : przenosi obraz do podanego
orientacja

-flip : Odwróć dane w kierunku odczytu

-gnić : Obrót w płaszczyźnie

-uporządkuj : Wybierz zakres w
czytaj kierunek

-skala : Przeskaluj wartości obrazu

-przeskok : Odwróć dane w kierunku plasterka

-Zmiana <czytajPrzesunięcie kierunku [piksel],fazaPrzesunięcie kierunku [piksel],plasterPrzesunięcie kierunku
[piksel]> : Przesuń dane przestrzennie

-czas kawałka : Poprawny dla
różne punkty czasowe pozyskiwania wycinków

-splatać : łączy
obraz w podanym kierunku

-zakres : Wybierz zakres w
kierunek krojenia

-zamień <[rps][-],[rps][-],[rps][-]> : zamień/odzwierciedlaj wymiary poprzez określenie kierunku
potrójny z dołączonym opcjonalnym znakiem odbicia

-dachówka : Połącz plasterki w kwadratowy obraz 2D

-dziwne : Wybierz zakres w
kierunek czasu

-tzmiana : Przesuń dane w czasie

-typmax : Przytnij wszystkie wartości powyżej maksimum określonego typu danych

-typ min : Przytnij wszystkie wartości poniżej minimum określonego typu danych

-usemaska : Utwórz zestaw danych 1D zawierający wszystkie wartości w masce z pliku

Inne opcje:
-v lub do debugowania/śledzenia wszystkich komponentów lub pojedynczego
odpowiednio. Możliwe wartości loglevel to: 0(noLog), 1(errorLog),
2 (dziennik ostrzeżeń), 3 (dziennik informacji).

-h, --help, -Pomoc, --wersja : Wydrukuj tekst pomocy lub informacje o wersji

Utrzymany filet rozszerzenia (formaty):
3db (dane binarne Iris3D)

w czasie rzeczywistym sprawiają,
(NIFTI/ANALYZE, dialekty: fsl )

asc (ASCII, dialekty: tkurs )

coi (zestawy danych JCAMP-DX)

dat (Matlab ascii macierz danych 2D)

dcm (DICOM, dialekty: siemens )

podwójne (podwójne dane surowe)

float (zmienne nieprzetworzone dane)

gz (kontener GNU-Zip dla innych formatów)

hdr (Interfile, dialekty: neurostat )

hdr (NIFTI/ANALIZA, dialekty: fsl )

idx (wskaźniki 3D niezerów w ASCII)

ima (DICOM, dialekty: siemens )

plik pośredni
(wewnątrz, dialekty: neurostat )

jdx (format obrazu JCAMP-DX)

mag (DICOM, dialekty: siemens )

mhd (Metaobraz)

nii (NIFTI/ANALIZA, dialekty: fsl )

ph (DICOM, dialekty: siemens )

png (przenośna grafika sieciowa)

pos (pozycje xy niezerów w ASCII)

pro (protokoły pomiarowe ODIN)

rej (Ansoft HFSS ASCII)

s16bit (podpisane 16-bitowe dane surowe)

s32bit (podpisane 32-bitowe dane surowe)

s8bit (podpisane 8-bitowe dane surowe)

smp (zestawy danych JCAMP-DX)

u16bit (niepodpisane 16-bitowe dane surowe)

u32bit (niepodpisane 32-bitowe dane surowe)

u8bit (niepodpisane 8-bitowe dane surowe)

Korzystaj z miconv online za pomocą usług onworks.net