To jest aplikacja dla systemu Linux o nazwie PRIMUS do uruchamiania w systemie Linux online, której najnowszą wersję można pobrać jako URLtoLastestPRIMUSversion.txt. Można go uruchomić online w darmowym dostawcy usług hostingowych OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online tę aplikację o nazwie PRIMUS, aby działać w systemie Linux online z OnWorks za darmo.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom emulator online OnWorks Linux lub Windows online lub emulator online MACOS z tej witryny.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Linux, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację, zainstaluj ją i uruchom.
PRIMUS do uruchomienia w Linuksie online
Ad
OPIS
NOWOŚĆ: Pobierz nową wersję z Rekonstrukcją rodowodu ze strony primus.gs.washington.eduTa wersja jest przestarzała i niekompletna. Zapraszamy do odwiedzenia nowej strony internetowej, aby zapoznać się z pełną wersją PRIMUS.
Przedstawiamy metodę zaadaptowaną z teorii grafów, która zawsze identyfikuje maksymalny zestaw niespokrewnionych osób w dowolnym zbiorze danych i umożliwia wykorzystanie parametrów ważenia w doborze niepowiązanych próbek. PRIMUS odczytuje oszacowania IBD generowane przez użytkowników i generuje maksymalny możliwy zbiór niepowiązanych osób, przy określonym progu pokrewieństwa. Można również wykorzystać dodatkowe informacje dotyczące preferencyjnego wyboru osób. Na przykład, gdy w sieci są dwa maksymalne zestawy niepowiązanych osób o równej wielkości, PRIMUS może preferencyjnie wybrać zestaw z większą liczbą osobników dotkniętych chorobą.
Zapisz się na listę e-mail PRIMUS-Users, aby otrzymywać powiadomienia o aktualizacjach i nowych wersjach.
Odpowiednie oprogramowanie:
http://students.washington.edu/jeanm5/Simulate_IBD_Python.ta
Korzyści
- Identyfikuje maksymalny zestaw niepowiązanych osobników ze zbioru danych genetycznych
- Grupuje próbki w sieci rodzinne
- Generuje pliki .dot do wizualizacji sieci rodzinnych
Publiczność
Opieka zdrowotna, nauka/badania, edukacja
Język programowania
Perl
Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/primus-beta/. Został umieszczony w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.
