Este é o comando extractseqe que pode ser executado no provedor de hospedagem gratuita OnWorks usando uma de nossas várias estações de trabalho online gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador online do Windows ou emulador online do MAC OS
PROGRAMA:
NOME
extractseq - Extrai regiões de uma sequência
SINOPSE
extrair seq -seqüência seqüência -regiões alcance [-separado booleano] -outseq seqoutall
extrair seq -Socorro
DESCRIÇÃO
extrair seq é um programa de linha de comando da EMBOSS (“the European Molecular Biology Open
Suite de software ”). Faz parte do (s) grupo (s) de comando "Editar".
OPÇÕES
Entrada seção
-seqüência seqüência
Exigido seção
-regiões alcance
Regiões a serem extraídas. Um conjunto de regiões é especificado por um conjunto de pares de posições. o
posições são inteiros. Eles são separados por qualquer caractere diferente de dígito e não alfa.
Exemplos de especificações de região são: 24-45, 56-78 1:45, 67 = 99; 765..888
1,5,8,10,23,45,57,99 Valor padrão: $ (sequence.begin) - $ (sequence.end)
Adicional seção
-separado booleano
Se for definido como verdadeiro, cada região especificada é gravada como uma sequência separada.
O nome da sequência é criado a partir do nome da sequência original com o
posições inicial e final do intervalo anexado com caracteres de sublinhado entre eles,
por exemplo: XYZ região 2 a 34 é escrito como: XYZ_2_34 Valor padrão: N
saída seção
-outseq seqoutall
Use extractseqe online usando serviços onworks.net
