Este é o comando mapMers-depth que pode ser executado no provedor de hospedagem gratuita OnWorks usando uma de nossas várias estações de trabalho online gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador online do Windows ou emulador online do MAC OS
PROGRAMA:
NOME
mapMers-depth - relata informações sobre o mapeamento de kmers para sequências
SINOPSE
mapMers-profundidade {-contagem|-profundidade|-Estatísticas} -mers MERYL -m MERSIZAR -seq IN.RÁPIDO
OPÇÕES
Modos of operação
Para a sequência ordinal 's' e posição nessa sequência 'p':
-contagem relata a contagem (c) do único kmer que começa na posição (p).
Formato: 'spc'
-profundidade relata o número (n) de quilômetros que abrangem a posição (p).
Formato: 'spn'
-Estatísticas relata a contagem mínima (m), máxima (M) e média (a) de todos os meros que abrangem
posição (p). também relata a contagem total (t) e o número de kmers (n)
Formato: 'spm M atn'
Geral
-m MERSIZAR
-mers MERYL
Meryl(1) banco de dados
-seq IN.RÁPIDO
sequência de entrada fasta
Use mapMers-depth online usando serviços onworks.net
