miconv - Online na nuvem

PROGRAMA:

NOME

miconv - Converte dados de imagens médicas entre formatos.

SINOPSE

microconv [opções] []

DESCRIÇÃO

miconv: converte dados de imagens médicas entre formatos.

Os formatos de arquivo são identificados automaticamente por sua extensão. Espera em
pelo menos dois nomes de arquivos / diretórios (para o arquivo de entrada e saída) no final do
linha de comando. Uma exceção é a opção '-l' que requer apenas um
nome do arquivo / diretório para listar seu conteúdo.

Geral opções:
-l: Lista um conjunto de parâmetros de protocolo separados por espaço e saídas. Use '-l help' para obter um
lista de parâmetros possíveis e '-l all' para listar todos os parâmetros. O parâmetro
'arquivo de saída' deve ser omitido ao usar esta opção.

-p: Carregar este protocolo para padrões

Protocolo opções:
-encontro: Data da verificação [aaaammdd] (padrão = 20140807yyyymmdd)

-fp: FOV na direção da fase [mm] (padrão = 220.0 mm)

-fr: FOV na direção de leitura [mm] (padrão = 220.0 mm)

-fs: FOV na direção do corte [mm] (padrão = 5.0 mm)

-nº: Número de medições consecutivas (padrão = 1)

-nx: Número de pontos na direção de leitura (padrão = 128)

-Nova Iorque: Número de pontos na direção da fase (padrão = 128)

-nz: Número de pontos na direção da fatia (padrão = 1)

-pnascimento: Data de nascimento do paciente [aaaammdd] (padrão = 00000000aaaammdd)

-pid: Identificador exclusivo do paciente (padrão = desconhecido)

-pnome: Nome completo do paciente (padrão = desconhecido)

-psex: Sexo do paciente (opções = MFO, padrão = O)

-ppeso: Peso do paciente [kg] (padrão = 50.0 kg)

-sciente: Nome do cientista (padrão = desconhecido)

-SD: Distância entre cortes (de centro a centro) [mm] (padrão = 10.0 mm)

-serd: Descrição da série (padrão = desconhecido)

-serno: Número da série (padrão = 1)

-st: Espessura da fatia [mm] (padrão = 5.0 mm)

-viga: Descrição do estudo (padrão = desconhecido)

-tcnome: Nome da bobina de transmissão (padrão = desconhecido)

-chá: Tempo para eco da sequência [ms] (padrão = 80.0 ms)

-Tempo: Hora da verificação [hhmmss] (padrão = 091009hhmmss)

-tr: Tempo entre excitações consecutivas [ms] (padrão = 1000.0ms)

Envie o ler opções:
-cplx: Trate os dados como complexos e extraia o componente fornecido (opções = nenhum abs pha real
imag, default = none)

-ds: Índice do conjunto de dados a ser extraído se vários conjuntos de dados forem lidos

-filtro: Leia apenas os conjuntos de dados cujo parâmetro de protocolo 'chave' contém a string
'valor' (fornecido no formato 'chave = valor')

-fmap: Para reduzir o uso de memória, mantenha o mapeamento de arquivos após ler os dados (brutos), mas gravando
na matriz resultará em uma falha

-jdx: Se vários arrays JDX estiverem presentes, selecione este

-rdialeto: Leia os dados usando um determinado dialeto do formato. (o padrão é nenhum dialeto)

-rf: Leia o formato, use-o para substituir a extensão do arquivo (opções = detecção automática 3db analise asc
coi dat dcm duplo flutuante gz hdr idx ima interfile jdx mag mhd nii ph png pos pro
reg s16bit s32bit s8bit smp u16bit u32bit u8bit, padrão = detecção automática)

-pular: Pule esta quantidade de bytes antes de ler os dados brutos (padrão = 0)

Envie o escrever opções:
-acrescentar: Anexar ao arquivo existente, apenas para dados brutos

-fnamepar: Lista separada por espaço de parâmetros de protocolo a serem incluídos ao criar um único
nomes de arquivo

-sem escala: Não redimensione os valores ao armazenar inteiros

-Dividido: Força a divisão de pares de dados de protocolo em arquivos separados.

-Tipo: Tipo de representação da imagem (opções = flutuação automática double s32bit u32bit s16bit
u16bit s8bit u8bit, padrão = automático)

-wdialeto: Grava dados usando o dialeto dado do formato. (o padrão é nenhum dialeto)

-wf: Grave o formato, use-o para substituir a extensão do arquivo (options = autodetect 3db analyze asc
coi dat dcm duplo flutuante gz hdr idx ima interfile jdx mag mhd nii ph png pos pro
reg s16bit s32bit s8bit smp u16bit u32bit u8bit, padrão = detecção automática)

-wp: Armazene o protocolo separadamente neste arquivo.

Filtros:
-alinhar : Alinhe os dados com a geometria (localizações de voxel) de
um arquivo externo

-máscara automática : Criar máscara usando limite baseado em histograma automático

-grupo : Crie clusters de voxels adjacentes / vizinhos diferentes de zero, classificados por tamanho

-convolver <kernel de convolução (Gauss NoFilter Triangle Hann Hamming CosSq Blackman
BlackmanNuttall Exp), diâmetro do kernel [mm]>: Convolução em dimensões espaciais

- tendência <Número de componentes de baixa frequência a serem removidos, média zero do resultado
curso do tempo>: Remova o desvio lento ao longo do tempo

-editar <String de posição/intervalo no formato (timeframe,slicepos,phasepos,readpos),novo valor
de voxel>: Editar valores de voxel único

-genmask : Criar máscara incluindo todos os voxels com valor
em determinado intervalo

-isotrópico : tornar isotrópico de voxels de imagem através de interpolação (imagem
geometria não mudará)

-passagem baixa : Filtragem passa-baixa

-máximo : Cortar todos os valores acima do valor máximo

-máximo : Execute a projeção de intensidade máxima
sobre a direção dada

-mesclar : Mesclar conjuntos de dados em um único conjunto de dados expandindo a dimensão do tempo

- min : Corte todos os valores abaixo do valor mínimo

-minip : Execute a projeção de intensidade mínima
sobre a direção dada

-noNaN : Substitui cada NaN pelo valor fornecido

-pflip : Inverte os dados na direção da fase

-prange : Selecione o intervalo em
direção de fase

-proj : Execute a projeção média sobre o dado
direção

-máscara de quantil : Criar máscara incluindo todos os voxels acima da fracionária fornecida
limiar

-redimensionamento : Redimensionamento temporal dos dados da imagem

-redimensionar : Redimensionamento espacial dos dados da imagem

- recortar : redimensiona a imagem para um determinado
orientação

-rflip : Inverte os dados na direção de leitura

-podridão : Rotação no plano

-organizar : Selecione o intervalo em
direção de leitura

-escala : Redimensionar valores de imagem

-slip : Inverte os dados na direção da fatia

-mudança <mudança de direção de leitura [pixel], mudança de direção de fase [pixel], mudança de direção de fatia
[pixel]>: Muda os dados espacialmente

-slictime : Correto para
diferentes pontos de aquisição de fatias

- emenda : emendas o
imagem na direção dada

-srange : Selecione o intervalo em
direção do corte

-swapdim <[rps] [-], [rps] [-], [rps] [-]>: troca / reflete dimensões especificando uma direção
triplo com sinal de reflexão opcional anexado

-telha : Combine fatias em uma imagem 2D quadrada

estranho : Selecione o intervalo em
direção do tempo

-tshift : Mudança de dados no tempo

-tipomax : Cortar todos os valores acima do máximo de um tipo de dados específico

-typemin : Corte todos os valores abaixo do mínimo de um tipo de dados específico

-usar máscara : Crie um conjunto de dados 1D incluindo todos os valores dentro da máscara do arquivo

Outros opções:
-v ou para depurar / rastrear todos os componentes ou um único
componente, respectivamente. Os valores possíveis para nível de log são: 0 (noLog), 1 (errorLog),
2 (warningLog), 3 (infoLog).

-h, --Socorro, -Socorro, --versão : Imprimir texto de ajuda ou informações de versão

Suportado lima extensões (formatos):
3db (dados binários Iris3D)

analisar
(NIFTI / ANALYZE, dialetos: fsl)

asc (ASCII, dialetos: tcourse)

coi (conjuntos de dados JCAMP-DX)

dat (matriz de dados 2D Matlab ascii)

dcm (DICOM, dialetos: siemens)

duplo (dados brutos duplos)

float (dados brutos flutuantes)

gz (contêiner GNU-Zip para outros formatos)

hdr (Interfile, dialetos: neurostat)

hdr (NIFTI / ANALYZE, dialetos: fsl)

idx (índices 3D de não zeros em ASCII)

ima (DICOM, dialetos: siemens)

interfil
(Interfile, dialetos: neurostat)

jdx (formato de imagem JCAMP-DX)

mag (DICOM, dialetos: siemens)

mhd (MetaImagem)

nii (NIFTI / ANALYZE, dialetos: fsl)

ph (DICOM, dialetos: siemens)

png (Gráficos de Rede Portáteis)

pos (posições xy de não zeros em ASCII)

pro (protocolos de medição ODIN)

reg (Ansoft HFSS ASCII)

s16bit (dados brutos assinados de 16 bits)

s32bit (dados brutos assinados de 32 bits)

s8bit (dados brutos assinados de 8 bits)

smp (conjuntos de dados JCAMP-DX)

u16bit (dados brutos de 16 bits não assinados)

u32bit (dados brutos de 32 bits não assinados)

u8bit (dados brutos de 8 bits não assinados)

Use miconv online usando serviços onworks.net