Este é o aplicativo Linux chamado PRIMUS para rodar no Linux online, cuja versão mais recente pode ser baixada como URLtoLastestPRIMUSversion.txt. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuita OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado PRIMUS para rodar em Linux online com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
PRIMUS para rodar em Linux online
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DESCRIÇÃO
NOVO: Baixe a nova versão com Pedigree Reconstruction em primus.gs.washington.eduEsta versão está desatualizada e incompleta. Visite o novo site para obter a versão completa do PRIMUS.
Apresentamos um método adaptado da teoria dos gráficos que sempre identifica o conjunto máximo de indivíduos não relacionados em qualquer conjunto de dados e permite que parâmetros de ponderação sejam utilizados na seleção de amostras não relacionadas. O PRIMUS lê as estimativas IBD geradas pelo usuário e produz o máximo conjunto possível de indivíduos não relacionados, dado um limite especificado de relacionamento. Informações adicionais para a seleção preferencial de indivíduos também podem ser utilizadas. Por exemplo, quando há dois conjuntos máximos de tamanhos iguais de indivíduos não relacionados em uma rede, o PRIMUS pode selecionar preferencialmente o conjunto com mais indivíduos afetados.
Inscreva-se na lista de e-mail dos usuários PRIMUS para notificações de atualizações e novas versões.
Software relevante:
http://students.washington.edu/jeanm5/Simulate_IBD_Python.ta
Funcionalidades
- Identifica o conjunto máximo de indivíduos não relacionados de um conjunto de dados genéticos
- Grupos de amostras em redes familiares
- Gera arquivos .dot para visualizar redes familiares
Público
Indústria de saúde, ciência / pesquisa, educação
Linguagem de Programação
Perl
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/primus-beta/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.
