Este é o aplicativo Linux chamado Seurat, cuja versão mais recente pode ser baixada como Version5.3.0sourcecode.tar.gz. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuita OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado Seurat com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
SCREENSHOTS
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seurat
DESCRIÇÃO
Seurat é um kit de ferramentas R abrangente para análise genômica de células únicas, introduzido pelo Laboratório Satija no NYGC. Ele suporta controle de qualidade, normalização, agrupamento, integração de dados multimodais (por exemplo, scRNA-seq, espacial, CITE-seq) e visualização. O Seurat v5 introduz fluxos de trabalho escaláveis e suporte à transcriptômica espacial, comumente utilizados em pesquisas acadêmicas e industriais para estudos de células únicas.
Recursos
- Pipelines de controle de qualidade e normalização para scRNA-seq
- Redução dimensional, agrupamento e anotação de tipo de célula
- Integração entre amostras e modalidades
- Análise e visualização transcriptômica espacial
- Manipula conjuntos de dados em larga escala com eficiência (escalabilidade v5)
- Vinhetas extensas, tutoriais e integração com Bioconductor
Linguagem de Programação
R
Categorias
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/seurat.mirror/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil em um de nossos sistemas operacionais gratuitos.
