Aceasta este comanda insdseqget care poate fi rulată în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks folosind una dintre multiplele noastre stații de lucru online gratuite, cum ar fi Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows sau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NUME
insdseqget - formatează secvențele din GenBank ca un XML INSDSet
REZUMAT
insdseqget [-] [-d nume de fișier] [-i nume de fișier] [-m n/p/b] [-n] [-o nume de fișier] [-v]
DESCRIERE
insdseqget preia datele secvenței biologice de la GenBank (conform unei liste de intrare de
numere de acces GI) și îl imprimă ca document XML INSDSet.
OPŢIUNI
Un rezumat al opțiunilor este inclus mai jos.
- Imprimați mesajul de utilizare
-d nume de fișier
Introduceți numele fișierului pentru lista de date (accesiuni dorite, una pe linie, urmată de a
linie goală și o listă de date permise, de asemenea, una pe rând)
-i nume de fișier
Introduceți numele fișierului pentru lista GI (implicit = stdin)
-m n/p/b
Tipul moleculei:
n Nucleotide (implicit)
p Proteine
b Ambele
-n Returnați numai înregistrări noi (pentru care GI-ul dat se referă la o versiune veche)
-o nume de fișier
Numele fișierului de ieșire pentru XML INSDSet (implicit = stdout)
-v Preluați variații SNP
Utilizați insdseqget online folosind serviciile onworks.net
