Aceasta este comanda mapMers-depth care poate fi rulată în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks folosind una dintre multiplele noastre stații de lucru online gratuite, cum ar fi Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows sau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NUME
mapMers-depth - raportează informații despre maparea kmers la secvențe
REZUMAT
mapMers-adâncime {-numara|-adâncime|-statistici} -mers MERYL -m MERSIZE -seq IN.FASTA
OPŢIUNI
Moduri of operaţie
Pentru ordinea „s” și poziția în acea secvență „p”:
-numara raportează numărul (c) al singurului kmer care începe la poziția (p).
Format: „spc”
-adâncime raportează numărul (n) de kmeri care se întind pe poziția (p).
Format: „spn”
-statistici raportează numărul minim (m), maxim (M) și mediu (a) al tuturor mersului care se întind
poziţia (p). raportează, de asemenea, numărul total (t) și numărul de kmeri (n)
Format: „spm M atn”
General
-m MERSIZE
-mers MERYL
meryl(1) baza de date
-seq IN.FASTA
secvență de intrare fasta
Utilizați mapMers-depth online folosind serviciile onworks.net