miconv - Online în cloud

PROGRAM:

NUME

miconv - Convertește datele de imagine medicală între formate.

REZUMAT

miconv [Opțiuni] []

DESCRIERE

miconv: convertește datele de imagine medicală între formate.

Formatele de fișiere sunt identificate automat după extensia lor de fișier. Se asteapta la
cel puțin două nume de fișiere/directoare (pentru fișierul de intrare și de ieșire) la sfârșitul fișierului
Linie de comanda. O excepție este opțiunea „-l” care necesită doar una
nume de fișier/director pentru a-și lista conținutul.

General opţiuni:
-l: Enumeră un set de parametri de protocol și ieșiri separate prin spațiu. Folosiți „-l ajutor” pentru a obține un
lista de parametri posibili și „-l all” pentru a lista toți parametrii. Parametrul
„fișierul de ieșire” trebuie să fie omis când utilizați această opțiune.

-p: Încărcați acest protocol pentru valorile implicite

Protocol opţiuni:
-Data: Data scanării [aaaammzz] (implicit=20140807aaaammzz)

-fp: FOV în direcția fazei [mm] (implicit=220.0mm)

-fr: FOV în direcția de citire [mm] (implicit=220.0 mm)

-fs: FOV în direcția feliei [mm] (implicit=5.0 mm)

- nr: Numărul de măsurători consecutive (implicit=1)

-nx: Numărul de puncte în direcția de citire (implicit=128)

-ny: Numărul de puncte în direcția fazei (implicit=128)

-nz: Numărul de puncte în direcția feliei (implicit=1)

-pnaștere: Data nașterii pacienților [aaaammzz] (implicit=00000000aaaammzz)

-pid: identificatorul unic al pacientului (implicit=Necunoscut)

-pname: Numele complet al pacientului (implicit=Necunoscut)

-psex: Sexul pacienților (opțiuni=MFO, implicit=O)

-pgreutate: Greutatea pacienților [kg] (implicit=50.0 kg)

-științific: Nume om de știință (implicit=Necunoscut)

-sd: Distanța între felii (de la centru la centru) [mm] (implicit=10.0 mm)

-serd: Descrierea seriei (implicit=Necunoscut)

-serno: Număr de serie (implicit=1)

-Sf: Grosimea feliei [mm] (implicit=5.0 mm)

-stud: Descrierea studiului (implicit=Necunoscut)

-tcname: Numele bobinei de transmisie (implicit=Necunoscut)

-ceai: Timpul până la ecou al secvenței [ms] (implicit=80.0ms)

-timp: Ora scanării [hhmmss] (implicit=091009hhmmss)

-tr: Timp între excitații consecutive [ms] (implicit=1000.0ms)

Fișier citit opţiuni:
-cplx: Tratați datele ca fiind complexe și extrageți componenta dată (opțiuni=niciuna abs pha real
imagine, implicit=niciuna)

-d: Index de seturi de date de extras dacă sunt citite mai multe seturi de date

-filtru: Citiți numai acele seturi de date pentru care parametrul de protocol „cheie” conține șirul
„valoare” (dată în formatul „cheie=valoare”)

-fmap: Pentru o utilizare redusă a memoriei, păstrați maparea fișierelor după citirea datelor (brute), dar după scriere
în matrice va duce la un accident

-jdx: Dacă sunt prezente mai multe matrice JDX, selectați aceasta

-rdialect: Citiți datele folosind dialectul dat formatului. (implicit nu este dialect)

-rf: Citiți formatul, utilizați-l pentru a suprascrie extensia fișierului (opțiuni=autodetect 3db analysis asc
coi dat dcm double float gz hdr idx ima interfile jdx mag mhd nii ph png pos pro
reg s16bit s32bit s8bit smp u16bit u32bit u8bit, implicit=autodetect)

-ocolire: Omiteți această cantitate de octeți înainte de a citi datele brute (implicit=0)

Fișier scrie opţiuni:
-adăuga: Adăugați la fișierul existent, numai pentru datele brute

-fnamepar: listă de parametrii de protocol, separați prin spații, pentru a include la crearea unică
nume de fișiere

-noscale: Nu redimensionați valorile atunci când stocați numere întregi

-Despică: Forțați împărțirea perechilor protocol-date în fișiere separate.

-Tip: Tip de reprezentare a imaginii (opțiuni=float automat dublu s32bit u32bit s16bit
u16bit s8bit u8bit , implicit = automat)

-wdialect: Scrieți datele folosind dialectul dat al formatului. (implicit nu este dialect)

-wf: Formatul de scriere, folosiți-l pentru a suprascrie extensia fișierului (opțiuni=autodetect 3db analizează asc
coi dat dcm double float gz hdr idx ima interfile jdx mag mhd nii ph png pos pro
reg s16bit s32bit s8bit smp u16bit u32bit u8bit, implicit=autodetect)

-wp: Stocați protocolul separat în acest fișier.

Filtre:
-alinia : Aliniați datele la geometria (locațiile voxelilor).
un fișier extern

- masca automata : Creați mască folosind pragul automat bazat pe histogramă

-cluster : Creați grupuri de voxeli adiacenți/vecini care nu sunt zero, sortați după dimensiune

-împături <nucleul de convoluție (Gauss NoFilter Triangle Hann Hamming CosSq Blackman
BlackmanNuttall Exp ),diametrul miezului [mm]> : Convoluția în dimensiuni spațiale

-detendință <Numărul de componente de joasă frecvență care urmează să fie eliminate, medie de rezultat zero
timecourse> : Eliminați deriva lentă în timp

-Editați | × <Șir de poziție/gamă în format (interval de timp, slicepos, phasepos, readpos), valoare nouă
of voxel> : Editați valorile voxelului unic

-genmask : Creați o mască care include toate voxelurile cu valoare
în intervalul dat

-izotrop : faceți voxelii de imagine izotropi prin interpolare (imagine
geometria nu se va schimba)

-pass jos : filtrare lowpass

-max : Decupați toate valorile peste valoarea maximă

-maxip : Efectuați proiecția la intensitate maximă
peste direcția dată

-combina : Îmbinați seturile de date într-un singur set de date prin extinderea dimensiunii de timp

- min : Decupați toate valorile sub valoarea minimă

-minip : Efectuați proiecția de intensitate minimă
peste direcția dată

-nuNaN : Înlocuiește fiecare NaN cu valoarea dată

-pflip : Întoarce datele în direcția fazei

-frange : Selectați intervalul în
direcția de fază

-proiect : Efectuați proiecția medie peste date
direcţie

-quantilmask : Creați o mască care să includă toți voxelii deasupra fracției date
prag

-reesantionare : Redimensionarea temporală a datelor de imagine

-dimensionare : Redimensionarea spațială a datelor de imagine

-reslice : repartează imaginea la un anumit
orientare

-rflip : Întoarce datele în direcția de citire

-putrezi : Rotație în plan

- aranja : Selectați intervalul în
direcția de citire

-scară : Redimensionați valorile imaginii

-slip : Întoarce datele în direcția secțiunii

-schimb <readDirection shift [pixel],phaseDirection shift [pixel],sliceDirection shift
[pixel]> : Deplasați datele spațial

-slicetime : Corect pentru
diferite momente de achiziție ale feliilor

-lipitură : îmbină
imaginea în direcția dată

-srange : Selectați intervalul în
direcția feliei

-swapdim <[rps][-],[rps][-],[rps][-]>: schimbă/reflectează dimensiuni prin specificarea unei direcții
triplu cu semn opțional de reflectare atașat

-ţiglă : Combinați felii într-o imagine 2D pătrată

- ciudat : Selectați intervalul în
direcția timpului

-tshift : Schimbați datele în timp

-typemax : Decupați toate valorile peste maximul unui anumit tip de date

-typemin : Decupați toate valorile sub minimul unui anumit tip de date

-foloseste masca : Creați un set de date 1D, inclusiv toate valorile din masca din fișier

Altele opţiuni:
-v sau pentru depanarea/urmărirea tuturor componentelor sau a unei singure
componentă, respectiv. Valorile posibile pentru loglevel sunt: ​​0(noLog), 1(errorLog),
2(warningLog), 3(infoLog).

-h, --Ajutor, -Ajutor, --versiune : Imprimați text de ajutor sau informații despre versiune

Suportat fişier extensii(formate):
3db (date binare Iris3D)

analiza
(NIFTI/ANALYZE, dialecte: fsl )

asc (ASCII, dialecte: curs)

coi (seturi de date JCAMP-DX)

dat (Matlab ascii 2D data matrix)

dcm (DICOM, dialecte: siemens )

dublu (date brute duble)

float (float date brute)

gz (container GNU-Zip pentru alte formate)

hdr (Interfile, dialecte: neurostat)

hdr (NIFTI/ANALYZE, dialecte: fsl)

idx (indici 3D ai diferitor zerouri în ASCII)

ima (DICOM, dialecte: siemens )

interfile
(Interfile, dialecte: neurostat )

jdx (format de imagine JCAMP-DX)

mag (DICOM, dialecte: siemens)

mhd (MetaImage)

nii (NIFTI/ANALYZE, dialecte: fsl )

ph (DICOM, dialecte: siemens )

png (grafică de rețea portabilă)

pos (poziții xy ale diferitelor zerouri în ASCII)

pro (protocoale de măsurare ODIN)

reg (Ansoft HFSS ASCII)

s16bit (date brute semnate pe 16 biți)

s32bit (date brute semnate pe 32 biți)

s8bit (date brute semnate pe 8 biți)

smp (seturi de date JCAMP-DX)

u16bit (date brute de 16 biți nesemnate)

u32bit (date brute de 32 biți nesemnate)

u8bit (date brute de 8 biți nesemnate)

Utilizați miconv online folosind serviciile onworks.net